Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0279737
Help
Entry
DDB_G0279737 CDS
T00245
Symbol
top2mt
Name
(RefSeq) DNA topoisomerase II
KO
K03164
DNA topoisomerase II [EC:
5.6.2.2
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ddi03032
]
DDB_G0279737 (top2mt)
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
DDB_G0279737 (top2mt)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
DDB_G0279737 (top2mt)
DNA replication proteins [BR:
ddi03032
]
Eukaryotic type
DNA Topoisomerases
DDB_G0279737 (top2mt)
Chromosome and associated proteins [BR:
ddi03036
]
Eukaryotic type
Chromosome condensation proteins
Other regulators of chromosome condensation
DDB_G0279737 (top2mt)
Centrosome formation proteins
Centriole proteins
DDB_G0279737 (top2mt)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
TOPRIM_C
DNA_gyraseB
Toprim
HATPase_c
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8622204
NCBI-ProteinID:
XP_641531
dictyBase:
DDB_G0279737
UniProt:
P90520
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(2512313..2516167)
Genome browser
AA seq
1284 aa
AA seq
DB search
MSKLLNNNNHKNLTNYLKFGKGIINNLNNKSKQVGIISFISQSSIQSQSSIQSQSFLSIN
NNSNNKYFSTKLNKNEKISEKTTTRKIEDIYQKKTPTEHVLLRPDSYIGTIEKIEDDMWV
LSNSMFNKEKKTIELNNDNNEKNVESTTTTTTKTNKKPLTYIHPIKATYIPGLLKIYDEI
LVNAADNKKRDSKMSFIKVEINPNENSISIMNDGKGIPVVMHQTENCYVVEMVMGNLMSG
SNFNDSELKVVGGRNGFGAKLTNIFSKEFTVETVDKSSGKKYFQRWSNNMGDRSEPIITP
IGEGESDYTKITFKPDLEKFKIKSLWDDNILQLMERRLYDIAGCNTELMVTLNGKRLNYN
FQSYVKLYEHHLNNSTKREDNEEQYREESFEFGEISPRWKIGIGLSETGQFTQVSFVNSI
NTVKGGTHVNFLADQIVRYVGEKLKKKHSDLEIRPMNIKHHLALFVNCLVDNPSFDSQSK
ETLTTKPMLFGSTPEIPESLLAQFVKNSKIIERVAGWALMKQKADLIHSTSGRQSKTTLI
KSISKLDDANWAGGLKSKECTLIITEGDSAKSLALAGLSVVGRNSYGVFPLRGKLLNVRD
VASKQLLSNEEINNLTTILGLSHKNSYDTDESMEDLRYGRVMIMADQDHDGSHIKGLVMN
FIHYFWPNLLKRGFLVEFVTPIIKATKSSTQKKSFFTIKDYEKWRETISSDQLKQYTIKY
YKGLGTSTSAEAKEYFSNLDKHVIKFIWGDEADDLIKMAFAKDLSSLRQRWIKETDMSQG
IDHSIKEITYPDFINKELIHYSWAANLRSIPSLIDGLKPGQRKILFASFKRRLTNEIKVS
QLSGYVAEQTSYHHGEQSLNSTIVKMAHNFVGSNNLPLLTPSGQFGTRLQGGSDSASARY
IFTKLEPVARYLFNELDDPLLNYLEEEGESIQPDYYIPIIPMLLVNGSEGIGVGMSTSIP
LFSPIDIIDQLMLRLNNQVALKKLIPWYRGFKGTISPDRHTYRTNGVIKLVGRNLEITEL
PIGRWTSDYKEVLNDLIDKDVIKSFQESNTENSVHFTILLNNNQLEQMEDLTENELIKLF
KLSASLNFHLTCFDENSKIQKLESVEEIIDQFYKVRLQFYGKRREYLLKSLDNQIKRLTT
TIQFLEVIASGKLKIQGRSKQDLIKELESGEIVGFENFGTHPPEVYQHLFSLSILDITKE
RIDNLTNQLTKRKSEHQSISSSDPKSLWTADLQQLKEYLEKSDKEFQKKPLKTSSSSSFD
VSSSSESAKLSSTRKSKTDKIKSK
NT seq
3855 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaattattaaataataataatcataaaaatttaacaaattatttaaaatttgga
aaaggaattataaataatttaaataataaatcaaaacaagttggaataatttcatttata
tcacaatcatcaatccaatcacaatcatcaatccaatcacaatcatttttatcaattaat
aataatagtaataataaatatttttcaacaaaattaaataaaaatgaaaaaatatcagaa
aaaacaaccacaagaaagatagaagatatttatcaaaaaaaaacaccaactgaacatgtt
ttattaagaccagattcatatattggaacaattgaaaaaattgaagatgatatgtgggtt
ctatcaaattcaatgtttaataaagaaaaaaaaacaattgaattaaataatgataataat
gaaaagaatgttgaatcaacaacaacaacaacaacaaaaacaaataaaaaaccattaact
tatattcatccaattaaagcaacatatataccaggtttattaaaaatttatgatgaaatt
ttagtgaatgcagcagataataaaaagagggattcaaaaatgtcatttattaaagttgag
attaatccaaatgaaaatagtatatcaattatgaacgatggtaaaggtataccggtggta
atgcatcaaactgaaaattgttatgttgttgaaatggtgatgggtaatctaatgtctggt
tccaatttcaatgatagtgaattaaaggttgttggtggtagaaatgggtttggtgcaaag
ttaacaaatatattctccaaagaattcactgttgaaactgttgataagagttcaggtaaa
aagtatttccaaagatggtcaaataatatgggtgatagaagtgaaccaataataacacca
attggcgagggtgagagtgattataccaaaatcacattcaaaccagatttagagaaattt
aaaatcaaatcattatgggatgataatattttacaattaatggaacgtagattatatgat
atcgcaggttgtaatacagaattaatggtaacattaaatggaaagagattgaattataat
ttccaaagttatgttaaactttatgaacatcatttaaataatagtacaaaacgtgaagat
aatgaagaacaatatcgtgaagaatcctttgaatttggtgaaatttcaccacgttggaaa
attggtattggtttatcagagactggtcaattcactcaagttagttttgtaaatagcata
aacactgttaaaggtggaactcatgtcaatttcttggctgatcaaatcgtacgttatgtt
ggtgagaaattaaaaaagaaacactcggatcttgaaattagaccaatgaatattaaacac
catttagcattgtttgtcaattgtttagttgataatccaagttttgatagtcaaagtaaa
gaaaccctaacaactaaaccaatgttattcggatcaacaccagaaattccagagtcatta
ttagctcaattcgtaaagaatagtaaaatcattgaacgtgttgcaggttgggcattaatg
aaacaaaaagcagatttaattcattcaacaagtggtagacaatcaaaaaccacattgatt
aaatcgatttccaaattggatgatgcaaattgggcaggtggattaaaatcaaaggaatgt
acattgattataactgaaggtgattctgcaaaatcattagcattggcaggtttaagtgta
gttggtcgtaattcatatggtgttttcccattacgtggtaagctattgaatgtacgtgat
gtcgcttcaaaacaattattatccaatgaagaaattaataatcttaccaccattttgggt
ttatctcataaaaattcctatgataccgatgaaagtatggaagatttacgttatggtaga
gttatgattatggccgatcaagatcatgatggttcacatattaaaggtttagttatgaat
ttcattcactacttttggccaaatcttttgaaacgtggtttccttgtagaatttgttaca
ccaatcataaaagcaactaaaagttcaactcaaaagaaatctttctttaccattaaagac
tatgaaaaatggagagaaacaatttcatccgatcaattgaaacaatataccattaaatat
tataaaggtttaggtacatcaactagcgcagaggcaaaggaatactttagtaatttggat
aaacatgtaattaaattcatttggggagatgaagctgatgatttaattaaaatggcattt
gcaaaggatttaagttcacttagacaacgttggattaaagaaactgatatgtcacaaggt
attgatcattcaattaaagagatcacctatccagatttcattaataaagaattgattcat
tatagttgggctgcaaatcttagatccattccatcattaatcgatggtttaaaaccaggt
caacgtaaaattctatttgcatcatttaaacgtcgtttaacaaatgaaattaaagtttca
caattgtcaggttatgtagccgaacaaacttcctatcatcatggtgagcaatctttaaat
tcaacaattgttaaaatggctcataatttcgtaggttcaaataatttaccattgttaaca
ccaagtggtcagtttggtactcgtttacaaggtggttcagattctgcatcagctagatat
atctttacaaaacttgaaccagttgcacgttaccttttcaatgaattggatgatccatta
ttaaactatctagaggaagaaggtgaatccattcaaccagactattatataccaattata
ccaatgttattagttaatggaagtgaaggtattggtgttggcatgtcaacttcaattcca
ttattttcaccaattgatatcatcgatcaattgatgctacgtttaaataatcaagttgca
cttaaaaaactaattccatggtatcgtggtttcaaaggaaccatttcacctgatagacat
acctatagaactaatggtgtaattaaattggttggtagaaatttagaaatcactgaatta
ccaattggtagatggacctctgactataaagaagttttaaatgatttaattgataaagat
gttattaaatcattccaagaatcaaatactgaaaattcagttcatttcacaattttatta
aataataatcaattggaacaaatggaagatttaactgaaaatgagttaataaagctattc
aagttatcagcttctcttaatttccatttaacatgtttcgatgaaaattcaaaaattcaa
aaattagaatctgttgaagaaatcattgatcaattctataaagttcgtttacaattctat
ggaaaacgtagagaatacctcttgaaatcattggataatcaaattaaacgtttaacaact
acaatacaattccttgaagttattgcaagtggtaaattaaaaattcaaggtagatcaaaa
caagatttaatcaaagagttggaaagtggtgaaattgttggtttcgaaaattttggaact
catccaccagaggtttatcaacatcttttctctttatcaattttagatattacaaaagaa
agaattgataatttaactaatcaattaacaaaaagaaaatctgaacatcaatcaatttca
tcttctgatccaaaatcactttggactgctgatttacaacaattaaaagaatatttagaa
aaaagtgataaagaatttcaaaaaaaacctttaaaaacttcctcttcttcatcatttgat
gtttcttcttcttctgaatctgcaaaattatcttcaactagaaaatcaaaaactgataaa
attaaatcaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
