Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0282027
Help
Entry
DDB_G0282027 CDS
T00245
Symbol
pks19
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
ADH_zinc_N_2
KAsynt_C_assoc
PKS_DH_N
Thiolase_N
Epimerase
PS-DH
ADH_N
Semialdhyde_dh
PP-binding
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623370
NCBI-ProteinID:
XP_640415
dictyBase:
DDB_G0282027
UniProt:
Q54T36
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(5258026..5266453)
Genome browser
AA seq
2778 aa
AA seq
DB search
MEFGNKEIAIVGIGFRIPQGKESINNGSVSHLWNNLKNGFSGIVETSERWSDNINLLGEV
NNKFGGLLPLKEWSDFDPVHFAINPSEVPLMDPQTRLLLKCTWEALEDAFIDPIDIRGSN
TSCFIGCSTLDYSTTNRDFNETSENYFASNVLHTISNRLSFSYDIRGPSMTIDTACSSSL
NSITMGFQSIQNGTSNLSIVGGASLLLDPYVSKSFSFLNMLSKKGKCKPFDSEADGYIRA
ESCGIVILKPLSDAIRDGNNIYCVINSFSSNVDGGGLNDKSNFYSPSKQSQSDNIKLALK
SANMKASDISFVECHGTGTPTGDPIEVEGVSMALNSSTTSTPSKPLLIGSLKSNIGHCEA
ASGVASLIKCCLMFKNKHYAPNVNFDQPNPKINFKDWNIKVVTEAIPFTNINEKPVSMVI
NNFGVTGSNCCLILSQFIEHSISLNGNNPSYPIESQQQIFLIPFSANSVKSLKNYEDLII
NDNNLSTNSFKEFVKNQIYSKSKKLYQRSVLISSNWDQLKTKNKYFKTSNDKSSNITIKR
NQPLIVIVFGGQGSQWNKMAQQLYECEPIFRSSMDKFNKELSKYYGYSVLDKLRSIKDDD
IISIHQPIIAQPSILMLQISLFELYKHWGINVSFIVGHSLGEIATSYCSGMVDFQTVCKL
IYHRSISQNNTNGCGKMLSVNISHSEFIELYSNKYPTIEVACYNSPTSIVIAGNENILKE
ISLDLKENNIFCAFLGSLSSFHTSSQNSTKNEILPLEIPSRQSTIPTFSTVTTNLFNHET
TPFNSSYVYENIIQPVRFSQTISNLYQHIENNKLGNELIFIEVSPHPSLSFYLKQMIPKS
SSYFNSVSVLTSTNKKNSNDLDEIHSTISQIYCLGYDINFKCQFNHNDDDVNSIRNNSTI
ILPNYQFDEQYYWKVDINFEQYRLNGPNVFNNLGKSMINYSSNNKSYESIIDINRNPFKY
LKDHIVKGKYYFPGIGYADNIMKLYPNKDIVINNLEFLAPFVLKENVKHILQTNVYQLGN
TDYRVTFNIKDNKANQWVQTCTGNFQLISLKDNNNNNNNNHSSKYNINQLLSECNFTTLS
KQEVYKYSKLRSGITHLGTFQGIEEFHFGNDLTIARIQINYENFDINGKPVYQTFDKSFF
NIALLDNCIQAITGFITNSSQFVFERLEGLKVYSENIPTDKLKYKNIYCQAKFISLEADS
YKSSVLVLLEDGTKLLEIEHISFRSTLPLIDELLLNNPTNELFTNNLQCKDSLVNILSID
NNETSSSSGSSNTVTEIIKQTIKPIINEKIVFRILQSFSDSELSKQIIEALNQIFDNSLQ
EIDIEFTIIDNSNDKLPTLHDSSLIFKNDITQLKPSYYDIIINNNNDETIIKPIFNILSS
NGLLLLIIEDDIGIRFNINNLIGVGFNENKIQKSNKVIQSQKSTILSNELTVVPNNKNDN
IIIYCEKHSKYTNEFKKLISNNHTNRKQTTISNINEFNQLLPSITNDSIIYFIKSMEQLE
MNNFKQITMEYIEINQQLLKHSLTCKHVLITIDSQIKNYLSSSIIGASRYFNEFPSLNLY
SIDFDNQLSISSLLNKIINQLIENSNNHIQREYIIRNNSIYYEILKNEKNIKSNFNSNSF
EDNDFMTLLDSTNLEYKLASKPKKLKKNEIEVKVLATGINYKDYLIYRGLVVIDENVSIS
KNPLGLEFSGIITRISDENKNCEFKVGDNVFGVSHDATASHVITDVLYVSHKPNNISHIE
AASLPIIFSTCLHGMFNIGNFNIDDDEVILIHSATGGIGLATLEILKWKGHKSPIFVTVG
SKDKEQYLIDNYGSFITGIYSSRNKNYVNEIKSKLNQLYGTTGKFNGVDLIINTLPNEFT
HSNFLCLKERGKIIDLSITHLNNNEFLNFNNFKFNKSYHNIEFMHINKRVVSRLLKSISN
ALNENKVKLIPITTFQIENVKEAIEYINQRKHIGKIVLDHSCSNGSIGSDGLLNQLIESD
NNEKNHTILKYDFKIDTKNIIGKNIIITGQSGIILEILKWLIKYSPPTESFENIIILSKS
SLKWELELLINKTISRKDNNTKFHFKIVDVGDSIEMRKSINQILLENPNIDNIDSIFHYA
FTQVTKEVEEIDIESLDISHNAKTMGAINLHEISIEKSWKLKQFVMASSIASLFGSFNQC
TYVSANLVLDSLSRYRKSIGLPSTCTNWGTIKSSGFVSRNDSVSKMLDDQGFIPIPTNII
LGSLDLQLQNSNKYSNLIVSKFNYDSIKKFASETSTFQRLDFILNSIKEKDNDNNGGENI
SISESIQMKFLNKISELLSIEQSKINTDIRLGEYGADSLTSVQLKNFIDKENKSNVITLQ
QLQNNTIGVNIQIILEQIKKLDSNETKGKSKKIIKKDSAPSLEYWRNEMKLDESIQAIKM
NPIDFRNDSKVFLTGATGFLGVHLLSNLIKSPNCSVVYCLIRNKKSEPNPINAIINNLKH
HKLYHFHNEFELSKVKVIVGNLASPLLGLSKLDFGFVSNQINLIINSGADINLASNYEES
KVVNIGGLIELIKLSTTGDYQKPIVGFSSISVFFESPNCKEFDEETVIPTIENINNLPGG
YMKSKVVVENLFREAAKRGIPSMLIRLPIIFSHEETGIGHDSDFFQLIIQSCYAVKKYPN
IDKNILTSPIGWIGLNTIKMIGNEKCWNKSSSNQLNIYSLNSEVSSIKSSFSFLEKQYGC
EMVEYEQWKNIINQSKILSCIKFKTFHSLDRLNGVYNLGHGFGVSKKTKELLQSMNSYEG
GMVNEKIIQNHINYIFKN
NT seq
8337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttggaaataaagaaattgccattgtaggtattggatttagaattccacaaggt
aaagaatcaattaataatggtagtgtttcacatttatggaataatttaaagaatggattc
agtggtattgttgaaacatcagaaagatggagtgacaatatcaatttactcggtgaagtt
aataataaatttggtggattattaccattaaaagaatggagtgatttcgatccagttcat
ttcgcaatcaatccatcagaagtacccctaatggatccacaaacaagattactattaaag
tgtacatgggaagcattagaagatgcattcatcgatccaatcgatattagaggttcaaat
acatcttgtttcattggttgctcaacattagattattcaacaacaaatagagactttaat
gaaacatctgaaaattatttcgcatcaaatgttcttcataccatttcaaatagattatca
ttttcatatgatatcagaggtccatcaatgacaattgatacagcatgttcttcatcattg
aattcaattacaatgggttttcaatcaattcaaaatggtacttcaaatctatcaattgtg
ggtggtgccagtttattacttgatccatacgtttcaaaatcattttcatttttaaatatg
ttaagtaaaaaaggtaaatgtaaaccatttgattcagaagcagatggttacattcgtgca
gagagttgtggtattgtaattttaaaaccattatcagacgcaattagagatggtaataat
atttattgtgtaattaattcatttagttcaaatgtcgatggaggtggtttaaatgataaa
tcaaacttttattcaccatccaaacaatcacaatctgataatatcaaattagcattgaaa
agtgcaaatatgaaagcatcagatattagtttcgtagaatgtcatggtacaggaacacca
acaggtgatccaattgaagtagaaggtgtatcaatggctctaaattcatcaacaacatca
acaccatctaaaccattactcattggatcactcaaatctaatattggtcattgtgaagct
gcaagtggtgttgcatcattaatcaaatgttgtttaatgtttaaaaataaacattatgca
ccaaatgttaattttgatcaaccaaatccaaagattaactttaaagattggaatattaaa
gttgtaacagaagcaataccatttacaaatattaatgaaaaaccagtatcaatggttatt
aataactttggtgtaactggctcaaattgttgtttaattttatcacaatttattgaacac
tcaatcagtctaaatggtaataaccctagttatccaattgaatcgcaacaacaaatattt
ttaataccattttcagccaattcagtaaaatcattaaaaaattatgaagacttaataata
aatgataataatctttctacaaattcattcaaagagtttgttaagaatcaaatttattca
aaatcaaagaaactatatcaaagatcagttttaatttcaagtaattgggatcaattaaaa
actaaaaacaagtactttaaaacaagcaatgacaaatcctcaaatattacaattaaaaga
aatcaaccattgattgttattgttttcggaggtcaaggttcacaatggaataaaatggct
caacaactttatgaatgtgaaccaatattcagatcatcgatggacaaattcaataaagag
ttaagtaaatactatggatactcagttttagataaattaagatcaattaaagatgatgac
attatatcaatccatcaaccaataatcgctcaaccatcgatattaatgttacaaatatca
ttatttgaactatacaaacattggggtatcaatgtatcattcattgttggtcatagttta
ggtgaaatagcaacatcatattgttcaggtatggtagatttccaaacagtttgtaaatta
atttaccacagatcaatttctcaaaataatacaaatggatgtggtaaaatgttatcagtc
aatatcagtcattcagaatttattgaactttattcaaataaatatccaacaattgaagtt
gcatgctataattcaccaacatcaattgtaattgcaggtaatgaaaatattttaaaagag
atatcattagacttaaaagaaaataatatcttttgcgcatttttaggttcattatcatca
ttccacacaagtagccaaaactcaaccaaaaatgaaattttaccattagaaataccatca
agacaatcaacaattccaacattttcaacagttacaactaatttatttaatcatgaaact
actccattcaattcaagttatgtttatgaaaatataatacaacctgtcagattctctcaa
actatttcaaatttatatcaacacattgaaaataataaacttggtaatgaattaatattt
attgaagtttcaccacatccaagtttatcattttatttaaaacaaatgataccaaaatca
tcaagttactttaattcagtttcagtattaacatcaacaaacaaaaagaactccaatgat
ttagatgaaattcattcaacaatttcacaaatttattgtttaggttatgatataaacttt
aaatgccaattcaatcacaatgatgatgatgtcaattccattagaaacaatagcactata
attttaccaaactatcaattcgatgaacaatactattggaaagttgatattaactttgaa
caatatagattaaatggaccaaacgttttcaacaacttaggtaaatcaatgattaactat
tcatcaaataacaaatcatatgaatcaataatcgatataaatagaaatccattcaaatat
ttaaaagaccatattgtaaaaggaaaatattacttcccaggtattggatatgctgataat
attatgaaactttacccaaataaagatattgtaattaataacttggaatttttagcacca
tttgttttaaaagaaaatgtcaaacatattttacaaaccaacgtttatcaattaggtaac
actgattatagagttacattcaacataaaagacaataaagcaaatcaatgggttcaaaca
tgtactggtaactttcaacttatatcattaaaagataataataataataataataataat
cactcatctaaatataatataaatcaattgctatcagaatgtaattttactaccctttcc
aaacaagaagtttataagtactctaaattaagatcaggtatcactcatttaggaactttc
caaggaattgaagaatttcactttggcaatgatcttacaattgcaagaatacaaataaac
tacgaaaactttgatatcaatggtaaacctgtttatcaaacatttgacaaatcatttttc
aatatagcgctattagataactgtatacaagccatcactggattcattacaaattcaagc
cagtttgtatttgaaagacttgaaggtttaaaagtttattctgaaaatataccaactgac
aaattaaaatataagaatatctattgtcaagcaaaattcatctccttggaagcagatagc
tataaatcatcagttttagttttattagaagatggtacaaagttattagaaatagaacat
atatcattccgttcaactcttccattgattgatgaattattacttaataatcctacaaat
gaactatttacaaataatttacaatgtaaagattcattagttaatattttatccattgat
aataatgaaacttctagcagcagtggcagcagcaacacagttacagaaattattaaacaa
acaatcaaaccaataataaatgaaaagattgtttttagaattttacaatcattttcagat
tcagaactatcaaaacaaatcattgaagcattaaatcaaattttcgataatagtttacaa
gaaatcgatatagaatttacaattattgataattcaaatgataaacttccaactttacac
gattcaagtttaatctttaaaaatgatataacccagttaaaaccatcatactatgatatt
atcattaataataataatgatgaaacaatcatcaaaccaatatttaatattctttcttca
aatggattattattattaataattgaagatgatattggtatccgatttaatatcaataat
ttaatcggtgtaggttttaatgagaacaaaattcagaaatcgaacaaagtaatacaatca
caaaaatctacaatattatcaaatgaattaacagttgttccaaacaataaaaatgataat
attatcatttattgtgaaaaacattcaaaatatacaaatgaatttaagaaattaatttca
aataatcataccaatcgcaaacaaacaacaatatcaaatattaatgaatttaatcaacta
ttaccttcaataacaaatgattcaataatttactttattaaatcaatggaacaattagaa
atgaataatttcaaacaaattacaatggaatatattgaaattaatcaacaacttttaaaa
catagtttaacatgtaaacatgtattaattactattgattcacaaatcaaaaactattta
tcatcatcaataataggtgcatcaagatactttaatgaatttccaagtttaaatctatat
tcaatcgattttgataatcaattatcgatatcatcattattaaataaaatcattaatcaa
ttgattgaaaattcaaataaccatattcaaagagaatatataattagaaataattcaatt
tattatgaaatattaaagaatgaaaagaatataaaatcaaacttcaattcaaattcattc
gaagataatgattttatgacactcttagattcaacaaatttagaatataaattagcatca
aaaccaaagaaattaaaaaagaatgaaattgaagtcaaagttttagcaacaggtattaat
tataaagattatttaatttatcgtggtttagttgttattgatgaaaatgtatcaatatct
aaaaatccacttggtctcgaattttcaggtattatcacaagaatatctgatgaaaataaa
aattgtgaatttaaagtaggcgataatgtttttggtgtatcacacgatgcaactgcatct
catgttataactgatgtactttatgtttcacataaaccaaataatattagtcatattgaa
gcagcgtcattaccaatcattttttcaacatgtcttcatggtatgttcaacattggtaat
tttaatatcgatgatgatgaagtcattttaattcactcagcaacaggtggtattggttta
gcaacattagaaatattaaaatggaaaggtcataaatcaccaattttcgtcacagtaggt
tcaaaagataaagaacaatatttaattgataattatggatcattcataactggaatttat
tcatcaagaaataaaaactatgtaaatgaaatcaaatcaaaattaaatcaactttatggt
acaactggtaaattcaacggagtagatttaattataaatacattaccaaatgaatttaca
cattcaaactttttatgtttaaaagaaagaggtaaaatcattgatctctcaatcacccat
ttaaataacaatgaatttttaaatttcaacaatttcaaatttaacaagagttatcataat
atcgaatttatgcatattaataaaagagtagtttcaagattattaaaatctatttcaaat
gctttaaatgaaaacaaagtgaaactaattccgataacaacattccagattgaaaatgtc
aaagaagcaattgaatatattaatcaaagaaaacatattggtaaaattgtattagatcat
agttgttcaaatggtagtatcggtagtgatggattattaaatcaactcattgaatcagat
aacaatgaaaagaatcatacaatattaaaatatgatttcaaaattgatacaaaaaatata
attggtaaaaatataattattacaggtcaatcaggtattattttagaaatcttaaaatgg
ttaattaaatattcacctccaacagaatcatttgaaaacattatcattttatcaaaatca
tcattaaaatgggagttagaactattaatcaataaaacaatatcaagaaaggataataac
accaagttccatttcaagatcgtagatgttggtgattcaattgaaatgagaaaatcaatt
aatcaaattttattagaaaatccaaatattgataacattgattcaatattccattacgcg
ttcactcaagtaactaaagaagtagaagaaatcgatattgaatcattagatatttcacat
aatgctaaaacgatgggtgcaattaatttacatgaaatctcaattgagaaatcatggaaa
ttaaaacaatttgttatggcatcatcgattgcatcattatttggctcattcaaccaatgt
acttatgtttctgcaaatttagtattagattcactatcaagatatcgtaaatcaattggt
ttaccatcaacgtgcacaaattggggaacaattaaatcatcaggtttcgtatcaagaaat
gattcagtttcaaaaatgttagatgatcaaggtttcattccaattccaacaaatataatt
ttaggttcattagatttacaacttcaaaattcaaataaatattcaaatttaattgttagt
aaatttaactatgattcaattaagaaattcgcatcagaaacatcaactttccaaagatta
gatttcattttaaattctatcaaggaaaaagataatgataataatggtggtgaaaatatt
agtatttcagagagtatccaaatgaaatttttgaataaaatttcagaactcttatcaatt
gaacaatcaaagatcaacacagatattcgtttaggtgaatatggagcagattcattaact
tcagtacaattaaagaatttcattgataaagaaaataaatcaaatgtaattacacttcaa
caattacaaaataatacaattggagtaaatattcaaattattttagaacaaatcaaaaaa
ctagattcaaatgaaactaaaggaaaatcaaaaaaaattattaaaaaagattcagcacca
agtttagaatattggagaaatgaaatgaaattagatgaatcaattcaagcaattaaaatg
aatccaattgattttagaaatgactcaaaagtatttttaactggtgcaacaggattttta
ggtgttcatttattatcaaacttaattaaatcaccaaactgttcagttgtatattgttta
attagaaataaaaaatcagaaccaaatccaatcaatgcaataattaataatttgaaacat
cataaactatatcactttcacaatgaatttgaattatcaaaagttaaagtaatcgttggt
aatttagcatcaccattattaggattatcaaaattagattttggttttgtttcaaaccaa
attaatttaataattaattcaggtgccgatattaatttggcatcaaattatgaagagagt
aaagttgtaaatattggtggtttaattgaattgattaaactttcaacaactggtgattat
caaaaaccaattgtaggatttagttcaatatcagtattctttgaatcaccaaattgtaaa
gaatttgatgaagaaacagtaataccaacaattgaaaatattaataatttaccaggtggt
tatatgaaaagtaaagtagttgttgaaaatttatttagagaagcagcaaaaagaggtatt
ccatcaatgttaattagactaccaattatattttcacatgaagaaacaggtattggtcat
gattctgatttcttccaactaattattcaatcatgttatgcagttaaaaagtatccaaat
attgataaaaacatattaacatcaccaattggttggataggtttaaatacaattaaaatg
attggaaatgaaaaatgttggaataaatcatcttcaaatcaattaaatatctatagttta
aatagtgaagtttcatcaattaaatcatcattctcattcttggaaaagcaatatggatgt
gaaatggttgaatatgaacaatggaagaatatcattaatcaatcaaagattctatcatgt
ataaagttcaaaacattccattcattagatagactcaatggtgtttataacttgggtcat
ggatttggtgtttcaaagaaaactaaagaattattacaatcaatgaactcatatgaagga
ggaatggttaatgaaaaaatcattcaaaatcatataaactatatctttaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
