Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0270572
Help
Entry
DDB_G0270572 CDS
T00245
Symbol
pks2
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
NAD_binding_4
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
Epimerase
ADH_N
ADH_zinc_N
Thiolase_N
PKS_DH_N
PP-binding
NAD_binding_10
Methyltransf_31
PS-DH
Methyltransf_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8617054
NCBI-ProteinID:
XP_646104
dictyBase:
DDB_G0270572
UniProt:
Q55DM7
LinkDB
All DBs
Position
1:3098695..3108214
Genome browser
AA seq
3010 aa
AA seq
DB search
MIESTSNKSRDVAVIGIGLRLPGGSNTPLELWNNLIKGIDGIVETKERWSDTFSEMGEVS
SKYAGLIDFDQWMSFDPLHFAINPSDAKEIDPQQKILLKTTWEAFEDAQIDPLSLRGSDT
SVYVGASSMDYASINTDPNKQPINCFNVNLSGVSNRISYCYDLRGTSLTIDTACSSSLNA
VHLGYESIVNGKSDYSIVGGVNFIINPQQSRAFKYAMVTSKTGKCKAFDESADGFVRSEG
AVVLILKSLSKSIEDGNQIYSIIKGSSSNVDGTLNKTNYFAPSKVSQSNNMQKAFDSTNG
ELTPNDISFFELHGTGTQIGDPIEVEAVSTLFKDIKTKESPLLIGSIKSNIGHLEPASGV
ASLAKVCLMLKNREFVKNIHFETPNPNIKFDEWKVKVCTQNTPFPTIRGKPISIAINSFG
ITGSNACLLLSEYLKTNITTTNDQLEPSTTSYLIPLSSSSKKSLELYKNELTNNIETFSK
SIEFKDFISYHINSKAIKLASRSVLMVKDWDELKSSLNLNEPLIYSSKGNKSGNIMKDNN
KNPILVFVFCGIGGQWNQMGKQLYETSKVFKQSIDEIDQIFNRLFGYSILKKLRSISDDD
SKGINEFITSQPSIFMLQVSLFEFYKSWGINPSINVGHSFGEISSACCSGMLDLETACFI
VYKRSIIQTKTIGSGGMLVIGLSEDEYKKQYQSQYPLIEISCFNSPSSIVISGSELDLTT
ITSSLKEKNIFTYLLGSPAALHSSKQKVIKDDILTQLKDIKFKQPTIKTFSTVTTNLFDN
STTPFDSNYIFSNIRKPVSFEKTIKNIFNHIETNDLGSNVIFLELSPLPTLTNYIKEMIP
QNSNYFYIDDESITILTSLNKKKSIDELQEIKSTISQIYCSGYNVNFKSQLTTTTTTTFG
NLIIDSNKIVKGFTSYYLPRYQWDESNYFKVGRISKQISQGPTATQLGYRNDVSPFMSYT
SYIDIKEEPFKFLKCHQSRGRNLFPGNAYLENVLKVFPDQDLTFHLIEYRSPLILKEGIK
HIISTNIYPSAKNEYRVTFHYKDSFDKWILGCSARFSVLKHNSDLENQKIDVESLKAKCN
WTTIKRKEFYEVLKTNTSLALTGQFQCIEEAYYGYNCCLAKISMNETLTKLSQYDNELFL
NACTIDGGFQLLGLFRDNPDTFVMDRVELLRFYASNIPKSSKFRENYPFIYTYTEFISQI
GNSVYANINTFLPDGTLLFNTPVVCYSSISTDIKNQLSIENPNHQLYSTVLQSLESPLSV
TTQNAIIDEKLFLSFLPTPVANIRKAFTTCIFSNIKKIYQSITPAKINTSTVDSLIDSYF
KICETDNIEKRKLGETLFNALKLNYSIIEYSSQAKLIKLLSTNQIEIMNKITTHLLNETK
PTTNTTETTPVSSSQKLPEQIQLIENIITKSVLPLVNEKIVFRILEISSGIGQLSKIIVT
RLNELLQQNPLAEIDIELTFTDREDITLIKEKLTTLLYSTSSTADINSKDLSSRKTSLIF
TQLDLNDKDLISSKTIYPSYYDIIVLNGLDGIKDLNQSIETIYQILNPNGYFIMIDTLFK
ANKSDLKNYELYQQWLSFNYFDSTKDLDSWKKLLTQDFKLINFTATSSQPWVILCQKPRF
FETVSTENPISTTLSCYDQVIIFGTIDNINESKALSKLMDVNDRGTDIYCIKTLDEFETH
VKETPLTDESVIVYVNTINQVFISFISYSLEYIKINQHLLRTNCNAKHVLLTRSAFIETT
NTLVSATVGAFRYFCEFSQLDLYLMDFDDSIYLKSMQFINVTHEMTNPNKHYQREFIFRG
DKVYYERVTQETNLKLKLKSTSYISEPTQLYAKLGQNLQYQLKPFENKIPEGFIEVKVLA
SGINFKDNLVYRRLVPNEAVNHTGNSNDPEFGYECSGIVSRVGDGVTKFKVGDEVVGLGF
NCTGSFVTLEQFRFVLKPKNLTHVEAASIPVVYLTSYYSLFVAGYLSIEKKESVLIHGGT
GGIGLACINLLKAKGFKGYLFVTVGSKEKENFLRVTYGNFITGIYSSQNTDYLLEIKKKI
QQLTGNNLIFKQFGVAKMGIDLIINTLSNEFMDANFNSLCQGGRIIDLSVTHMNSQDTTD
FRKFRYCISYSSVELLLNGFERNKLILQEVMDMFVNENLALLPIKEYSVKDIKEAIEFIA
ERKHIGKIVVNHENYDLISQTLVSNDNEFYKDFLIPKANYRISADCNLGKTVLLTGQLGL
SLSIIKWIIAFNNLEQPVENILVLSLSPIKYELEHMICYCKHVNNQIKIIFKQVDISDMC
ALDDAIGEIYKENENLPLVSSIFHNAFAPSECDALDIDEDHLRISHSAKTMGMINLNSLS
TGIWSESIKNFVLSSSITSILGSQRQCGYISANCIIDAVSRLRASEGLPCTSINWGVLGT
GFVSRNESVSKLFEYQGFIPISMDMLIGTLDLFLQNSGKLNNKIVASFNYNNVSAAFRNH
HLSYKLNYFLNPVYSKGSTFDDNELSIRDDILEKFSEYLSTEKSKLSLDIKLIDYGSSSI
MLVELKNYLDKTYTPNILSIAQLQNVTINQLIQAVIQAVSKLKKPTTNQQSQQPIISNIK
WEDEIALDPTIKPTQQIIDTYKNEMTQLYKNNNNKTSLGGLQVLLTGPCTFSGTHILSNL
LLSSKTKVIHCLLPMETPEQVMCTIIDNFKAQGLYDQLNLANVLSKIKPIAADFTRPIFG
LDTDDYIELSKKIDIVINAASNTTKHYCAHISYEDTNKEYLHGVSHLLRFASSEKLKRVV
QISTLGRYSDLQRNSLDEYYFPEVDFSFISDQNQLVSGYIQSKIVAEYHLKQASNRGIPC
LIVRTPFTFPGNNGIGREADFTQLLLQSCYTLNCYPTESHIQLYTAPVTWYAKNITLMAV
GSDISQDGCWDTINTSPIENLLCFNLFGGGFDFGDLLVDISKDLSWKEVPFETLVKKAAV
NETECCKRLASFVLKKKGDFLKNLGVIPGNFTVNENLKNYLTLNNSFDGWLVTKQLVYNH
LSYVFKKKVF
NT seq
9033 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaatcaacttcgaataaatctagagatgttgctgttataggtattggtttacgt
ttaccaggtggatcgaatacaccattagaattatggaataatttaattaaaggtatagat
ggtattgttgaaactaaggagcgttggagtgatactttctcagagatgggagaggtttca
agtaaatatgcaggtttaatagatttcgatcaatggatgtcgtttgaccctttacatttc
gctattaacccatcagatgccaaagaaattgaccctcaacaaaaaattttattaaaaact
acttgggaagctttcgaagatgcacaaattgatccattatcactaagaggtagtgatact
tctgtatatgtcggtgcatcttcaatggattacgcaagtatcaatactgatccaaataaa
caaccaattaattgttttaatgttaatctaagtggtgtatcaaatcgtatttcatattgt
tatgatttaagaggtacttcattaactattgatacagcatgttcaagctcattgaatgct
gttcatttaggttatgagtcaattgttaatggaaagtcagattactcaatagttggtggt
gttaattttataattaatccacaacaatcaagagcattcaaatatgcaatggttacaagt
aaaactggtaaatgcaaagcatttgatgaatcagctgatggttttgttcgttcagagggg
gcagtagttttaattttaaagagtttatcaaaatctattgaagatggtaatcaaatttat
tcaataattaagggtagtagttcaaatgttgatggtactttaaataaaacaaattatttt
gcaccttcaaaagtttcacaatcaaataatatgcaaaaggcattcgattctacaaatggt
gaattaacaccaaatgatattagtttctttgaacttcatggtacaggtacacaaattggt
gatccaattgaagttgaagcagtatcaaccttatttaaagatattaaaactaaagaatca
ccattattaattggttcaattaaatcaaatattggtcatttagaaccagcaagtggagtt
gcatcattagcaaaagtttgtttaatgttaaaaaatagagaatttgtaaagaatattcat
tttgaaacaccaaatccaaatattaaatttgatgaatggaaagttaaagtttgtacacag
aatacaccatttccaactattcgtggaaaaccaatttcaattgcaattaatagttttggt
attacaggttcaaatgcttgtctattattatcagaatatttaaaaaccaatataactaca
acaaatgatcaattagaaccatcgacaacaagttatttaataccattaagttcaagttca
aaaaaatcattagagctttacaagaatgaattaacaaataatattgaaacattttcaaaa
tcaattgaatttaaagattttataagttatcatataaattcaaaggcaataaaattagca
tcaagatcagttttaatggtaaaggattgggatgaattaaaatcaagtttaaatttaaat
gaaccattaatttattcaagtaaaggtaataaatcaggaaatataatgaaagataataat
aagaatccaatattagtttttgtattttgtggtattggtggacaatggaatcaaatgggt
aaacagctttatgaaaccagtaaagtgtttaaacaatcaatagatgaaatcgatcaaatc
tttaatagactatttggttattcaattttaaagaaattaagatcaattagtgatgatgat
tcaaaaggaattaatgaatttataacctctcaaccatcaatattcatgcttcaagtatca
ttgtttgaattttataagagttggggaattaatccatcgattaatgttggtcatagtttt
ggtgaaatttcatctgcttgttgttcaggaatgcttgatttggaaactgcatgtttcata
gtttataaaagatcaattattcaaactaaaaccattggtagtggtggaatgttagtcatt
ggtttaagtgaagatgaatataaaaaacaatatcaatctcaatatccattgatagaaatt
agttgttttaattcaccatcatcaattgtaattagtggtagtgaactggatttaaccaca
attacaagttcacttaaagaaaagaatattttcacctatttattaggctcacctgcagca
cttcattcatcaaaacaaaaggttatcaaagatgatattttaactcaacttaaagatatt
aaattcaaacaaccaacaattaaaaccttttcaactgtcacaacaaatttatttgataat
tcaacaacaccattcgatagtaattatattttttcaaatattagaaaaccagtatcattt
gaaaaaacaattaaaaacatctttaatcatattgaaactaatgatcttggaagtaatgta
atctttttagaattatcaccacttccaacattaactaattatatcaaagaaatgatacca
caaaattcaaattacttttacattgatgatgaatcaattacaattttgacatcattaaat
aaaaaaaaatcaattgatgaattacaagaaattaaatcaacaatttcacaaatttattgt
tctggttataatgttaactttaaatcacaattaacaacaacaacaacaacaacttttggt
aatttaataattgatagtaataaaattgttaaaggttttacgtcttattatttaccacgt
tatcaatgggatgaatcaaattattttaaagttggtagaatttcaaaacaaatttcacaa
ggtccaacagcgactcaattaggttatcgtaatgatgtatcaccatttatgtcatacaca
tcatacatcgatattaaagaggaaccatttaaatttctaaagtgtcatcaatcacgtggt
agaaatttattcccaggaaatgcatacttggagaatgttttaaaagtatttccagatcaa
gatttaacatttcatttaattgaatatagatcaccattgatattaaaagaaggtattaaa
catattatctctacaaatatttatcccagtgcaaagaatgaatatagagttacctttcat
tataaagatagtttcgataaatggattttaggttgttcagctagattctctgtattaaaa
cataatagtgatttagagaatcaaaagattgatgtagaatcattaaaggctaaatgtaat
tggacaacaattaaaaggaaggaattttatgaagtattaaaaacaaacacatcattggca
ctcactggtcaatttcaatgtattgaagaagcatactatggttataattgctgtttagct
aaaatatcaatgaatgaaactttaacaaaactatcacaatacgataatgaattattttta
aatgcttgtacaatcgatggtggtttccaactattaggtttatttagagataatccagat
acttttgttatggatagagttgaactacttagattctatgcttcaaatattccaaaatct
tcaaagtttagagaaaattatccattcatttatacctataccgaatttattagtcaaatt
ggtaattcagtatatgcaaatattaatacattcttacctgatggtacattattatttaat
actcctgttgtttgttactcttcaatttcaactgatataaaaaatcaattgtcaattgaa
aatccaaatcatcaattatactctacagttcttcaatcactagaatcaccattgtcagtc
actacccaaaatgcaatcattgatgagaaattattcttatcatttttaccaaccccagtt
gcaaatattagaaaagcatttacaacctgtatcttttcaaatataaagaaaatttatcaa
tcaattacaccagctaaaattaatacttcaactgttgattccctaatcgatagttatttt
aaaatttgtgaaactgataatattgaaaaaagaaaattaggtgaaacattatttaatgct
ttaaaattaaattattcaattattgaatatagttctcaagctaaattaattaaattatta
tcaacaaatcaaattgaaataatgaataaaattacaacccatttattaaatgaaacaaaa
ccaacaacaaacactactgaaaccacacctgttagtagtagtcaaaaattacctgaacaa
attcaattaattgaaaatattattacaaaatcagttttaccattagttaatgaaaagatt
gtatttagaattttagaaatttcatcaggtatcggtcaattatcaaagattatagttaca
agattgaatgagttattacaacaaaatcctttagcagaaattgatattgaattaacattt
accgatagagaagatattacattaattaaagagaaattaacaacattactttattcaaca
tcatcgacagccgatataaatagtaaagatctttcatcacgtaaaactagtttaattttt
actcaattggatttaaatgataaagatttaatttcatcaaaaaccatttatccatcctat
tatgatattatagttttaaatggtttggatggtattaaagatttaaatcaatcaattgaa
actatttatcaaattcttaatccaaatggttatttcataatgattgatactttatttaaa
gctaataaaagtgatttaaaaaactatgaattatatcaacaatggttatctttcaattat
tttgattcaactaaagatttagattcttggaaaaagttattaactcaagattttaaatta
attaatttcactgctacttcaagtcaaccatgggtaattttatgtcaaaaacctagattt
ttcgaaacagtttcaactgagaatccaatctctacaactcttagttgctatgatcaagtt
attattttcggtacaattgataatatcaatgaatcaaaagcactatcaaaattaatggat
gttaatgatagaggtaccgatatttattgtataaagactttggatgaatttgaaactcat
gtcaaagagacaccattaactgatgaatcggttatagtttatgtgaatacaatcaatcaa
gtattcatttcattcatttcctattcattagaatatatcaaaatcaatcaacatttatta
agaaccaattgtaacgccaaacatgtattgttaactagaagtgcattcattgaaactacc
aatacattggtaagtgcaacagttggagcttttagatacttttgtgaattctctcaattg
gatttatatttaatggattttgatgattcaatctatttaaaatctatgcaattcataaat
gtaacccatgaaatgacaaatccaaataaacactaccaaagggaattcatttttagaggt
gataaagtttactatgaaagagttactcaagagacaaacttaaaattaaaattaaaatca
acatcatacatatccgagccaactcaactatatgcaaaattaggtcaaaacttacaatat
caattgaaaccatttgaaaataaaattcctgaaggattcattgaagttaaagtattggca
agtggtatcaatttcaaagataatttagtttatcgccgtttggtaccaaatgaagctgtg
aaccatactggtaattcaaatgatccagaatttggttatgaatgttctggtattgtatca
agagtaggcgatggtgttacaaaattcaaagttggtgatgaagtggttggtttaggtttc
aattgtacaggttcatttgtaactttagaacaatttagatttgtattaaaaccaaagaat
cttactcatgttgaagcagcttcaattccagtggtttatttaacatcatattatagttta
ttcgttgctggttatcttagtattgaaaagaaagaatctgtactaattcatggtggaaca
ggtggtattggtttagcatgtattaatcttttaaaagcaaaaggtttcaaaggttattta
ttcgttactgttggttcaaaagaaaaagaaaatttccttcgtgttacctatggtaacttt
atcactggtatctattcaagtcaaaatacagattaccttttagaaatcaagaaaaagata
caacaactcactggaaataatttaatttttaaacaatttggtgttgctaaaatgggtatt
gatttaattataaatacattatcaaatgaatttatggatgcaaatttcaattcattatgt
caaggtggtagaattattgatctttctgtgactcacatgaatagtcaagatactactgat
tttagaaaattccgttattgtatcagttattcaagtgttgaattacttttaaatggtttc
gaaagaaataaattaatacttcaagaggttatggatatgtttgtaaatgaaaatttagca
ttactaccaattaaagaatattcagttaaagatattaaagaagctattgaattcatcgct
gaaagaaaacatattggtaaaattgttgttaatcatgaaaactatgatttaatttcacaa
actcttgttagcaatgataatgaattctataaagactttttaattccaaaagcaaactat
agaataagtgcagattgtaatttgggtaaaaccgttttattaactggtcaacttggtctt
agtttatcaattatcaaatggattattgcttttaataatttagaacaaccagttgaaaat
atattagtactatcattatcacctatcaaatatgaattggaacatatgatttgttattgt
aaacatgttaataatcaaattaaaataatatttaaacaagtggatatctctgatatgtgt
gcattggatgatgcaattggtgaaatttataaagaaaatgaaaatttaccattggtatct
tcaattttccataatgcatttgcaccatcggaatgtgacgcattggatattgatgaagat
catttgaggatatctcattcagccaaaactatgggtatgataaatttgaattccctttca
actggtatttggtcagagtctataaagaactttgtattgtcatcatctataacaagtatt
cttggaagtcaacgtcaatgtggttatattagtgcaaattgtatcattgatgcagtctca
agattaagagcatcagaaggtttaccatgtacttcaattaactggggtgtacttggtact
ggtttcgtttcaagaaatgaaagtgtttcaaagttatttgaatatcaaggtttcattcca
atctctatggatatgttaattggtacattggatttattcttacaaaattctggtaaatta
aataacaaaatagttgcctcatttaattataataatgttagtgcagcatttagaaatcat
catctatcctataaattaaattactttttaaatccagtctattcaaaaggttcaactttt
gatgataatgaattatcaattagagatgatattttagagaaattctctgaatatctatca
actgaaaaatcaaaattaagtttagatatcaaattaatagattatggtagtagttcaatt
atgcttgttgaattaaagaattatttagataaaacttatacaccaaacattttatcgatt
gcacaacttcaaaatgtaacaatcaatcaattaattcaagcagtaattcaagcagtttca
aaattaaaaaaaccaacaacaaatcaacaatctcagcaaccaattatttcaaacattaaa
tgggaggatgagattgcattagatccaaccattaaaccaactcaacaaataattgatacc
tataaaaatgaaatgactcaactttacaaaaataataataataaaacaagtttgggaggt
ttacaagtactattaactggtccatgtacattttcaggtactcatatactttcaaatctt
ttattatcttcaaaaacaaaagtgattcattgtttattaccaatggaaactccagagcaa
gtaatgtgtacaatcattgataatttcaaagctcaaggtttatatgatcaattgaattta
gcaaatgtattatcaaagattaaaccaattgctgcagattttacaagaccaatatttgga
ttggatactgatgattatattgaactttcaaaaaagattgatatagtcattaatgcagca
tcaaatacaaccaaacattattgtgctcatatttcctatgaagatacaaataaagagtat
ttacatggtgtctcacatttacttagatttgcatcaagtgaaaagctaaagagggtcgtt
caaatctcaacattgggacgttattctgatttacaaagaaattctttagacgaatactat
ttcccagaggtcgatttctcattcatttccgatcaaaatcagttagtatcaggttatatt
caatcaaagattgtggcagagtatcatcttaaacaagcttcaaatcgtggtattccatgt
ttaatagttcgtactccatttaccttccctggaaataatggtattggtagagaagctgat
ttcactcaactacttctccaaagttgttatacattaaattgttatccaactgaatcacat
attcaactctacactgcacctgtaacttggtatgcaaagaatattacattaatggctgtt
ggtagtgatatttcacaagatggttgttgggatacaatcaacacatctccaattgaaaac
cttttatgttttaatcttttcggaggtggctttgattttggtgatttattggttgatatt
tcaaaagatttatcttggaaagaagtcccattcgaaactttggttaaaaaagctgctgta
aatgaaactgagtgttgtaaaagattggcttcattcgttttaaagaaaaaaggtgatttc
ttaaaaaatttaggtgttatccctggtaatttcaccgtcaatgaaaatctcaaaaattat
ttaaccttaaataactcatttgatggttggttagttacaaaacaattagtctataatcat
ttatcttatgtttttaaaaagaaagttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
