Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0282029
Help
Entry
DDB_G0282029 CDS
T00245
Symbol
pks21
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
ADH_zinc_N_2
KAsynt_C_assoc
PKS_DH_N
Epimerase
Thiolase_N
PP-binding
ADH_N
PS-DH
Semialdhyde_dh
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623374
NCBI-ProteinID:
XP_001733001
dictyBase:
DDB_G0282029
UniProt:
B0G138
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(5285533..5294049)
Genome browser
AA seq
2779 aa
AA seq
DB search
MKLENKEIAIVGIGFRIPQGKESINNGSVSHLWNNLKNGFSGIVETSERWSDNINLLGEV
NNKFGGLLPLKEWSDFDPVHFAINPSEVPLMDPQTRLLLKCTWEALEDAFIDPIDIRGSN
TSCFIGCSTLDYSTTNRDFNETSENYFASNVLHTISNRLSFSYDIRGPSMTIDTACSSSL
NSIAMGFQSIQNGTSNLSIVGGVSLLLDPYISKSFSFLNMLSKKGKCKPFDSEADGYIRA
ESCGIVILKPLSDAIRDGNNIYCVINSFSSNVDGGGLNDKSNFYSPSKQSQSDNIKLALK
SANMKASDISFVECHGTGTPTGDPIEVEGVSMALNSSKTSTPSKPLLIGSLKSNIGHSEA
ASGVASLIKCCLMFKNKHYAPNVNFDQPNPKINFKDWNIKVVTEAIPFTNNNEKPVSMVI
NNFGVTGSNCCLILSQFIEQSINQNGNGHSYPAESQQQQQQRFLIPFSANSVKSLKNYED
LIINDIKISTNSFKEFVKNQIYSKSKKLYQRSVLISSNWDQLKTKNKYFKTNNDKSSNIT
IKRNQPLVVIVFGGQGSQWNKMAQQLYECEPIFRSSMDKFNKELSKYYGYSVLDKLRSIK
DDDIISIHQPIIAQPSILMLQISLFELYKHWGINVSFIVGHSLGEIATSYCSGMVDFQTV
CKLIYHRSISQNNTNGCGKMLSVNISHSEFIELYSNKYPTIEVACYNSPTSIVIAGNENI
LKEISLNLKENNIFCAFLGSLSSFHTSSQHSTKNEILPLDIPSKQSRIPTFSTVTTNLFN
HETTPFNSSYVYENIIQPVRFSQTISNLYQHIENNKLGNELIFIEVSPHPSLSFYLKQMI
PKSSSYFNSVSVLTSTNKKNSNDLDEIHSTISQIYCLGYDVNFKCQFNHNDDDVSSIRNS
KVNISLPNYQFDEQHYWKVDINFEQYRLNGPNVFNSLGKSMINYSSNNKSYESIIDINRN
PFKYLKDHIVKGKYYFPGIGYADNIMKLYPNQDIIINNLEFLAPFVLKENVKHTLQTNVY
QLGNTDYRVTFNIKDNKTNQWVQTCTGNFQLISLKDNNNDHSSKYDINQLLSECNFTTLS
KQEVYKHSRSITGITHLGAFQGIEELYFGNDCIISKIQVNTENFDIDGKPVYQTYDKSFF
NTALLDSCSQTIVGFITNSSQFVFERLEGLKVYSENIPTDKLKYKNIYCQAKFISLESDS
YKSSVLVLLEDGTKLLEMDCISLHSTLPLLNSLLINNPTTELFTNNLQCKDSLVNILSID
NNQTFSSISSSNTVTEIIKQTIKPIINEKIVFRILQSFSDLELSKQIIETLNQIFDDNSL
QEIDIEFTIIDNSNDKLPTLHDSSLIFKNDITQLKPSYYDIIINNNNDGDDETIIKSIFN
ILSSNGLLLIIGDDIGDKYNIDSLINLGFNENKIQKSNKVIQSQKSTILSNELTVVPNNK
NDNIIIYCEKESKYTNEFMKLISNNHISCKQTIISNINEFNQLLPSITNDSIIYFIKSME
QLEMNNFKQITMEYIEINQQLLKHSLTCKHVLITIDSQIKNYLSSSIIGTARYFNEFPSL
NLYSIDFDNQLSISSLLNKIINQLIENSNNHIQREYIIRNNSIYYEILKNEKNIKSNFNS
NSFEDNDFMTLLDSTNLEYKLASKPKKLKKNQIEVKVLATGINYKDYLIYRGLVVIDENV
SISKNPLGLEFSGIITRISNENQNCEFKVGDNVFGIACDTTASHVIADVLYVSHKPENIS
HVEAASLPVIFSTCLHGMFNIGNFNIDDDEVILIHSATGGIGLATLEILKWKGHKSPIFV
TVGSKDKEQYLIDNYGSFITGIYSSRNKNYVNEIKSKLNQLYGTTGKFNGVDLIINTLPN
EFTHSNFLCLKERGKIIDLSITHLNNNEFLNFNNFKFNKSYHNIELMHINKKVVSRLLKS
ISNALNENKLKPIPITTFQIEDVKEAIEYINQRKHIGKIVLDHSCSNGSIGSDGLLNQLI
ESDNNEKNHTILKYDFKIDTKNIIGKNIIITGQSGIILEILKWLIKYSPTESFENIIILS
KSSLKWELELLINKTISRKDNNTKFHFKSVDVGDPIEMRKSINQILLENPNIDNIDSIFH
YAFAQITKEVEEIDIESLDISHNAKTMGAINLHEISIEKSWKLKQFVMASSIASLFGSFN
QCSYVSANLVLDSLSRYRKSIGLPSTCTNWGAIKSAGFVSRNELVSKMLDDQGFIPIPTN
IILGSLDLQLQNSNKNSNLIVSKFNYDSIKKLSSETSTFQRLDFILNSIKEKDNDSNGGE
NSVSESIQTKILNKISELLSIEQSKINTDIRLSDYGADSLTSVQLKNFIDKDIKSNVITL
QQLQNNTIDMNIQTILEQIKKLDSNETKGKSKNIIKKDSAPTLDYWRNEMKLDESIQAIK
MNPIDFRNDSKVFLTGATGFLGVHLLSNLIKSPNCSVVYCLIRNKKSEPNPINAIINNLK
HHKLYHFHNEFELSKIKVIVGNLASPLLGLSKLDFDYISNQINLIINSGADINLASNYEE
SKVVNIGGFIELIKLSTTGDYQKPIVGFSSVSVFFNASNCKEFDEETVIPTIENINNLPG
GYMKSKVVVENLLREVAKRGIPSMLIRPPIIFSHEETGIGHDSDFFQLIIQSCYAVKKYP
KIDKNILTSPIGWISLNTIKMIGNEKCWNKSSSNQLNIYSLNSEVSAMNPSFSFLEKQYG
CEMVEYEQWKNIINQSKILSCVKLKTFHSLDDLYNIYNLGNGFGVSKKTKELLQSMNSYE
GGMVNEKMIQNHINYIFKN
NT seq
8340 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattagaaaacaaagaaattgcaattgtaggtattggatttagaattccacaaggt
aaagaatcaattaataatggtagtgtttcacatttatggaataatttaaagaatggattc
agtggtattgttgaaacatcagaaagatggagtgacaatatcaatttactcggtgaagtt
aataataaatttggtggattattaccattaaaagaatggagtgatttcgatccagttcat
ttcgcaatcaatccatcagaagtacccctaatggatccacaaacaagattactattaaag
tgtacatgggaagcattagaagatgcattcatcgatccaatcgatattagaggttcaaat
acatcttgtttcattggttgctcaacattagattattcaacaacaaatagagactttaat
gaaacatctgaaaattatttcgcatcaaatgttcttcataccatttcaaatagattatca
ttttcatatgatatcagaggtccatcaatgacaattgatacagcatgttcttcatcattg
aattcaattgcaatgggttttcaatcaattcaaaatggtacttcaaatctatcaattgtg
ggtggtgtcagtttattacttgatccatacatttcaaaatcattttcatttttaaatatg
ctaagtaaaaaaggtaaatgtaaaccatttgattcagaagcagatggttacattcgtgca
gagagttgtggtattgtaattttaaaaccattatcagacgcaattagagatggtaataat
atttattgtgtaattaattcatttagttcaaatgtcgatggaggtggtttaaatgataaa
tcaaacttttattcaccatccaaacaatcacaatctgataatatcaaattagcattgaaa
agtgcaaatatgaaagcatcagatattagtttcgtagaatgtcatggtacaggaacacca
acaggtgatccaattgaagtagaaggtgtatcaatggctctaaattcatcgaaaacatca
acaccatctaaaccattactcattggatcactcaaatctaatattggtcattctgaagct
gcaagtggtgttgcatcattaatcaaatgttgtttaatgtttaaaaataaacattatgca
ccaaatgttaattttgatcaaccaaatccaaagattaactttaaagattggaatattaaa
gttgtaacagaagcaataccatttacaaataataatgaaaaaccagtatcaatggttatt
aacaactttggtgtaactggttcaaattgttgtttaattttatcacagtttattgaacaa
tcaatcaatcaaaatggtaatggtcatagttatcctgccgaatcacaacaacaacaacaa
caaagatttttaataccattttcagccaattcagtaaaatcattaaaaaattatgaagac
ttaataataaatgatattaaaatttcaacaaattcattcaaagagtttgttaagaatcaa
atttactcaaaatcaaagaaactatatcaaagatcagttttaatttcaagtaattgggat
caattaaaaactaaaaacaagtactttaaaacaaataatgacaaatcctcaaatattaca
attaaaagaaatcaaccattggttgttattgttttcggaggtcaaggttcacaatggaat
aaaatggctcaacaactttatgaatgtgaaccaatattcagatcatcgatggacaaattc
aataaagagttaagtaaatactatggatactcagttttagataaattaagatcaattaaa
gatgatgatattatatcaatacatcaaccaataatcgctcaaccatcgatattaatgtta
caaatatcattatttgaactatacaaacattggggtatcaatgtatcattcatcgttggt
catagtttaggtgaaatcgcaacatcatattgttcaggtatggtagatttccaaacagtt
tgtaaattaatttatcacagatcaatttctcaaaataatacaaatggatgtggtaaaatg
ttatcagttaatatcagtcattcagaatttattgagctttattcaaataaatacccaaca
attgaagttgcatgctataattcaccaacatcaattgtaattgcaggtaatgaaaatatt
ttaaaagagatatcattaaatttaaaagaaaataatatcttttgcgcatttttaggttca
ttatcatcattccacacaagtagtcaacattcaactaaaaatgaaattttaccattagat
ataccatcaaaacaatcaagaattccaacattttcaacagttacaactaatttatttaat
catgaaactactccattcaattcaagttatgtttatgaaaatataatacaacctgtcaga
ttctctcaaactatttcaaatttatatcaacacattgaaaataataaacttggtaatgaa
ttaatatttattgaagtttcaccacatccaagtttatcattttatttaaaacaaatgata
ccaaaatcatcaagttactttaattcagtttcagtattaacatcaacaaacaaaaagaac
tccaatgatttagatgaaattcattcaacaatttcacaaatttattgtttaggttatgat
gtaaacttcaagtgtcaattcaatcacaatgatgatgatgtcagttccattagaaacagc
aaggtcaatatcagtttaccaaactatcaattcgacgaacaacactattggaaagttgat
attaactttgaacaatatagattaaatggaccaaatgttttcaacagtttaggtaaatca
atgattaactattcatcaaataacaaatcatatgaatcaataatcgatataaatagaaat
ccattcaaatacttaaaagaccatattgtaaaaggaaaatattacttcccaggtattgga
tatgctgataatattatgaaactttacccaaatcaagatattataattaataacttggaa
tttttagcaccatttgttttaaaagaaaatgtcaaacatactttacaaaccaatgtttat
caattaggtaacactgattatagagttacattcaacataaaagataataaaacaaatcaa
tgggttcaaacatgtactggtaactttcaacttatatcactaaaagataataataatgat
cactcatctaaatatgatataaatcaattgctatcagaatgtaattttacaaccctttca
aaacaagaagtttacaaacattccagatcaataactggaatcactcatttaggagctttc
caaggaattgaagagttgtattttggtaatgattgtattatatctaaaattcaagtaaac
actgaaaactttgatatcgatggtaagccagtttatcaaacatacgataaatcatttttc
aatacagctttattagatagttgttcacaaactatagttggattcattacaaattcaagc
cagtttgtatttgaaagacttgaaggtttaaaagtttattctgaaaatataccaactgac
aaattaaaatataagaatatctattgtcaagcaaaattcatctccttggaatcagatagc
tataaatcatcagttttagttttattagaagatggtacaaagttgttagaaatggattgt
atatctttacattcaactcttccattacttaatagtttattaattaataatcctacaact
gaattatttacaaataatttacaatgtaaagattcattagttaatattttatccattgat
aataatcaaacttttagcagcatcagcagcagcaatacagttacagaaattattaaacaa
acaatcaaaccaattataaatgaaaaaattgtttttagaattttacaatcattttcagat
ttagaattatcaaaacaaatcattgaaacattaaatcaaattttcgatgataatagttta
caagaaatcgatatagaatttacaattattgataattcaaatgataaacttccaacttta
cacgattcaagtttaatctttaaaaatgatataacccagttaaaaccatcatactatgat
attatcattaataataataatgatggtgatgatgaaacaatcatcaaatcaatatttaat
attctttcttcaaatggattattattaataattggagatgatattggtgataaatacaat
atcgatagtttaataaatttaggttttaatgaaaacaaaattcaaaagtcaaataaagta
atacaatcacaaaaatcaacaatattatcaaatgaattaacagttgttccaaacaataaa
aatgataatattataatttattgtgaaaaagaatcaaaatatacaaatgaatttatgaaa
ttaatttcaaataatcatatcagctgcaaacaaacaataatatcgaatattaatgaattt
aatcaattattaccttcaataacaaatgattcaataatttactttattaaatcaatggaa
caattagaaatgaataatttcaaacaaattacaatggaatatattgaaattaatcaacaa
cttttaaaacatagtttaacatgtaaacatgtattaattactattgattcacaaatcaaa
aactatttatcatcatcaataataggtacagcaagatactttaatgaatttccaagttta
aatctatattcaatcgattttgataatcaattatcaatatcatcattattaaataaaatc
attaatcaattgattgaaaattcaaataaccatattcaaagagaatatataattagaaat
aattcaatttattatgaaatattaaagaatgaaaagaatataaaatcaaacttcaattca
aattcgttcgaagataatgactttatgacactcttagattcaacaaatttagaatacaaa
ttagcatcaaaaccaaagaaattaaaaaagaatcaaattgaagtcaaagttttagcaaca
ggtattaattataaagattatttaatttatcgtggtttagttgttattgatgaaaatgta
tcaatatctaaaaatccacttggtctcgaattttcaggtattatcacaagaatatctaat
gagaatcaaaattgtgaatttaaagtaggcgataatgtatttggtatagcttgtgacaca
accgcttcacatgttatagctgatgtactttatgtttcacataaacctgagaatattagt
catgttgaagcagcatcattaccagtcattttttcaacatgtcttcatggtatgttcaac
attggtaattttaatatcgatgatgatgaagtaattttaattcactcagcaacaggtggt
attggtttagcaacattagaaatattaaaatggaaaggtcataaatcaccaattttcgtc
acagtaggttcaaaagataaagaacaatatttaattgataattatggatcattcataact
ggtatttattcatcaagaaataaaaactatgtaaatgaaatcaaatcaaaattaaatcaa
ctttatggtacaactggtaaattcaacggagtagatttaattataaatacattaccaaat
gaatttacacattcaaactttttatgtttaaaagaaagaggtaaaatcattgatctttca
attacccatttaaataacaatgaatttttaaatttcaacaatttcaaatttaacaagagt
tatcataatattgaacttatgcatattaataaaaaagtagtttcaagattattaaaatcc
atttcaaatgctttaaatgaaaacaaattaaaaccaattccaataacaacattccagatt
gaagatgtcaaagaagcaattgaatatattaatcaaagaaaacatattggtaaaattgta
ttagatcatagttgttcaaatggtagtatcggtagtgatggattattaaatcaactcatt
gaatcagataacaatgaaaagaatcacacaatactaaaatatgatttcaaaattgataca
aaaaatataattggtaaaaatataattattacaggtcaatcaggtattattttagaaatc
ttaaaatggttaattaaatattcaccaacagaatcatttgaaaacattatcattttatca
aaatcatcattaaaatgggagttagaactattaatcaataaaacaatatcaagaaaggat
aataacactaaattccatttcaagagtgtagatgttggtgatccaattgaaatgagaaaa
tcaattaatcaaattttattagaaaatccaaatattgataacattgattcaatattccat
tatgcattcgctcaaataactaaagaagtagaagaaatcgatattgaatcattagatatt
tcacataatgctaaaacgatgggtgcaattaatttacatgaaatttcaattgagaaatca
tggaaattaaaacaatttgttatggcatcatcgattgcatcattatttggctcattcaac
caatgtagttatgtttctgcaaatttagtattagattcattatcaagatatcgtaaatca
attggtttaccatcaacatgtacaaattggggtgcaattaaatcagcaggttttgtatca
agaaatgaattagtttcaaaaatgttagatgatcaaggtttcattccaattccaacaaat
ataattttaggttcattagatttacaacttcaaaattcaaataaaaattcaaacttaatt
gttagtaaatttaactatgattcaattaagaaattatcatcagaaacatcaactttccaa
agattagatttcattttaaattcaatcaaagaaaaagataatgatagtaatggtggtgaa
aatagtgtatcagaaagtatacaaacaaagattttaaataaaatttcagaactcttatca
attgaacaatcaaagatcaacacagatattcgtttaagtgattatggagcagattcatta
acttcagtacaattaaagaatttcattgataaagatattaaatcaaatgtaattacactt
caacagttacaaaataatacaattgatatgaatattcaaactattttagaacaaatcaaa
aaactagattcaaatgaaactaaaggaaaatcaaaaaatattattaaaaaagattcagca
ccaactttagactattggagaaatgaaatgaaattagatgaatcaattcaagcaattaaa
atgaatccaattgattttagaaatgattcaaaagtatttttaacaggtgcaaccggattt
ttaggtgttcatttattatcaaacttaattaaatcaccaaattgttcagttgtatattgt
ttaattagaaataaaaaatcagaaccaaatccaatcaatgctataattaataatttgaaa
catcataaactatatcactttcacaatgaatttgaattatcaaaaattaaagtaatagtt
ggtaatttagcatcaccattattaggattatcaaaattagattttgattatatttcaaat
caaattaatttaataattaattcaggtgccgatattaatttagcatcaaattatgaagag
agtaaagttgtaaatattggtggtttcattgaattaattaaactttcaacaactggtgat
tatcaaaaaccaattgtaggatttagctcagtatcagtattctttaatgcatcaaattgt
aaagaatttgatgaagaaacagtaataccaacaattgaaaatattaataatttaccaggt
ggttatatgaaaagtaaagtagttgttgaaaatttattaagagaagtagcaaaaagaggt
attccatcaatgttaattagaccaccaattatattctcacatgaagaaacaggtattggt
catgattctgatttcttccaattaattattcaatcatgttatgcagttaaaaagtatcca
aaaattgataaaaacatattaacatcaccaattggttggataagtttaaatacaattaaa
atgattggaaatgaaaaatgttggaataaatcatcttcaaatcaattaaatatctatagt
ttaaatagtgaagtttcagcaatgaacccttcattctcattcttggaaaagcaatatgga
tgtgaaatggttgaatatgaacaatggaagaatatcattaatcaatcaaagattctatca
tgtgtaaaattaaaaacattccattcattagatgatttatataatatttataacttgggt
aatggatttggtgtttcaaagaaaactaaagaattattacaatcaatgaactcatatgaa
ggaggaatggttaatgaaaaaatgattcaaaatcatataaactatatttttaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
