Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0283931
Help
Entry
DDB_G0283931 CDS
T00245
Symbol
pks23
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_12
Methyltransf_23
Methyltransf_31
PKS_DH_N
ADH_N
PP-binding
Thiolase_N
Methyltransf_11
Methyltransf_25
PS-DH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624337
NCBI-ProteinID:
XP_638813
dictyBase:
DDB_G0283931
UniProt:
Q54QD1
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(1322762..1330597)
Genome browser
AA seq
2499 aa
AA seq
DB search
MIEGNFEKNNDNQVAIVGLGLRLPGNSGSPLEFWKNLLDGFDGIVDSNQRWSDTLHSIGE
ISNKNAGLIDLEENWHSFEPLFFGINPTDAKQIDPQIKLMLKLTWEAFEDASIDPLKLRG
TNTSVFVGAANTDYSLINFEQNEAPINIFNGTLSAFANRISYCFDLRGTSLTLDTACSSS
LNAVHLGYESIVNGKSNYSVVAGCNILLNPYITRSFHSINITGKSGRCNSFDESADGFVR
SEGVVVLILKRLSLAIQDGDQIYCVMKGSSSNVDGTFKKTNFFAPSKNAQSTNIKNAFLS
SNGAMKYQDIDFFELHSTGTQVGDPIEVEAVADIFKNVKQEPLLIGSVKSNIGHLEPASG
VASLAKVCLMFKHRQFVKNIHFNNPNPNIKFKEWNVKVCTETTAFPDRQVSMAINSFGIT
GSNACVLLSEYIKPSEIKNQTSMKLNEKSKLLIPISTNSKKSLEQFKSKLLEEIDTYSES
LTFEEFAMFQVYSKTTKLSQRSVLIGNDWNDLKIDINEIISTKNNKSGNIIKSNDINPPL
VFSFCGQGPQYSKMGLNLYQNEPIFKEFMDLLDSILFKYFGYSIIQKLRSINDDPILINE
PILALPSIFMIQISLYKLYLHWGITPSIIVGHSLGEVASAFCSGMIDLETACFVIYKRAT
IQNKTNGSGRLLAISLNLEEFNNQFSKEYPEIEISCFNSPSSIVVCGNELDILNISKSLK
EKQIFNSLLGTSSAFHSSKQDIIKDEIIESTNHIQSRPPSITIFSTVTSNKFDKNTPYDS
NYIFDNIRKPVLFQQTIENIFKYIESNDLGNSVIFLELSPHPTLNHYVKEMIPKNSNYFL
NKDSISVLSSLNKKKEDINEIQSTISQLYCFGYNIDFSAQFKSEITSNSFKKCSYLIPHY
QWDESLFWREGISSINNRKNGASINQLGNKNELSPHISYTSYIDIKEEPFRFLKDHQFRG
KSLFPGVGYLDIILKLFPNQDLTIPLLEFKSQFVLTEGVKKTLTTNLYKSAKNEYRATFN
FKDQTSGKWIQSANSRILMKSLDVTVKKVDVQSIRDQCNWSTLKREQLYDLIKNYSNISL
LESFQRIEEASYGDNRCLCKVSLDPTSSYDNESFLNICIIDTCIHPCIFFDNPASSVFER
IEHLKIYSSSVPLTAEDRVKQQYVYCYVELIKKYSDFIYFKTTCFLKDGTVLLHSPLVTI
ASTLSTNIDTNIECPNNQLFSQCLQPKDSILQSPLILKEYFNQQLQLQQSNIISISTLSS
YLFSTLKKILNNLTTDEFQNGSLEEFIGKYSYILEEIQEASTFRSNLIFLSINFLLTHHK
HIDQNQVSNFLLNNIPNELLVLDTIVSNKGISHIGIYQHQLILDIISKSIIPIVNEKIVF
RILEIGCGVGELTKLINDKLESILNDNPSYNIDIEFVFSDYTDSKVLLIKERLFNSKKSC
FFKIIDLNKQLQEQSFSPSYYDLIILSNTTNQIKDIKTSISFINEILTPNGHLLILDTNF
IQTSIDEDYYLENYKQWLSFNYLNSGSGAMKLNQWNQLLINDLKFNNFICSTGEIEPYLI
QVQKSNLSNSINSVSKEHSSEYDQIIIFGTCDEINIGSSFYGLVPIAINSIDKFKEHVKL
QPLTDKSLILFIESVNLLTVDNFNQVSMNYIEINQHLLKNEISGCKHILISRNVNFETSN
LFGSSLIGSFRYFCEFNQLNIYSFEFEGNNILSGDGGDKLFNIIQELSNSNKHSQNEFSI
RSDGKIYYERIKLESNLKLKYKSKSYIENKNELVSRLKPDLTFALEAVLPLNPNFVEVKV
MASGVNFKDFLVYRQLINMANSNENGDPSKPQFGYELSGIVTKVGKNVTKFKVGDHVMGG
AFHTFSSSVHVDQDRIELKPSNISWFEASQSLVYLTSYCSLFELGRLDLYGSTETVLIHS
GSGGIGLSCIDLLQVYGFKGFLFVTVGSEEKKQFLKDRYGNFITEIYSTKNTDYEYLIKE
KLIELKAPSQEYGSFSMICVDLIINTLSADYMDANFNCLSQGGRIIDLSITHMTTTDTTD
FYKFRNHIGYMTYESVIAGFRKHKHVLKIIVDLLASGKLKTIPFNVYPVTKIKEAIESLG
DRKHIGKNIVNFNDPEGIDLIDCPEFSNNHNFIHPSSNYKIHQDTLGKTILITGQAGLSD
TIIKWIREKRSDSIESIIVLSKSPIKFELERAIGRIRSTNLKIYFKQVDISDEKLLLKSI
NQLFEENKDIKPIESIFHNAFSPAECEPLEIDMNHLISSHSAKSMGAYNLHKLSLNWPIK
QFVLSSSVTSILGSQRQCGYVASNCFIDALSRHRKSLNLPCISINWGLLGGGGFAARNDA
VFKLFELQGSVGISKDLVWGSLDLLLQNQNESTNKMVASFEFHATCKTYKYHKLSYKLDY
FLNPIISKESVTDEKEFSIRQDIVDKFASLLSTDQSKLNLDIKVIDYGADSLLVVEVKNW
ADNIFARNILSMPEIQNSTINQIINIVTTKVSNLPSKKK
NT seq
7500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcgaaggaaattttgaaaagaacaatgataaccaagttgcgattgttggtcttggg
ctaagattaccaggtaactcgggttctcctttagaattttggaaaaacttgcttgatggt
tttgatggaattgttgattctaatcaaagatggagcgacacactccatagtattggagaa
atctcaaataagaatgcaggattaattgatttggaagagaattggcattcttttgagcca
ttgttttttggaatcaatccaactgatgctaaacaaattgatccacaaattaaattaatg
ttaaagttaacatgggaagcatttgaagatgcatcaattgatcctttaaaactcagagga
accaatacttctgtttttgttggtgccgcaaatactgattattctttgattaatttcgaa
caaaatgaagcaccaatcaatatttttaatggtactctcagtgcatttgcaaatagaata
tcatattgttttgatttacgtggtacttcattaacacttgatacagcatgttcatcatca
ttaaatgcagttcatttaggatatgaatcaattgttaatggtaaatcaaattactctgta
gtagctggttgtaatatattattaaatccatatattactagatcatttcattcaattaat
attacaggtaaatctggtagatgtaattcatttgatgaatctgctgatggttttgtacgt
tcagaaggtgttgttgtattaattttaaaaagattatcacttgcaattcaagatggtgat
caaatttattgtgtaatgaaaggaagtagttcaaatgtagatggtacttttaagaaaaca
aacttttttgcaccttcaaaaaatgcacaatcaactaatatcaaaaatgcatttttatca
tccaatggtgcaatgaaatatcaagatattgatttctttgaattacatagtacaggtaca
caagtaggtgatccaatcgaagttgaagctgttgctgatatttttaaaaatgttaaacaa
gaaccattattaattggatcagttaaatcaaatattggtcatcttgaacctgcatcaggt
gtagcatcattagcaaaagtttgtttaatgtttaaacatcgtcaatttgtaaagaatatt
catttcaataacccaaatccaaatattaaattcaaagaatggaatgttaaagtatgtaca
gaaacaacagcattcccagatagacaagtatcaatggcaatcaatagttttggtataact
ggttcaaatgcatgtgttttattgtctgaatacatcaaaccttcagaaataaaaaatcaa
acatctatgaaattaaatgaaaaatctaaattattaataccaatctcaaccaactcaaag
aagtcactcgaacaattcaaatcaaaactacttgaagaaattgatacatattcagaaagc
ttaacttttgaagagtttgcaatgtttcaagtttattcaaaaacaaccaaattatcacaa
agatcagttttaattggtaacgattggaatgatttaaaaattgatataaatgaaattatt
tcaacaaaaaataataaatctggtaatattatcaaatcaaatgatattaatccaccatta
gtattttcattttgtggtcaaggtcctcaatattcaaaaatgggtttaaatttatatcaa
aatgaaccaatattcaaagaattcatggatttattagattcaatactatttaaatatttt
ggatattcaatcattcaaaaactaagatcaattaatgatgatccaattctaattaatgaa
ccaatattagctctaccatctatatttatgattcaaatatcattatataaattatatttg
cattggggaatcacaccatctataatagttggccatagtttaggagaagtagccagtgca
ttttgttcaggcatgattgatttagaaacagcatgcttcgtgatatataaaagagcaacc
attcaaaataaaaccaatggatctggaagacttttagcaattagtttaaatcttgaagaa
ttcaataatcaattttcaaaggaatatccagaaattgaaatttcatgttttaactcacca
tcatcaatcgttgtatgtggtaatgaacttgatatattaaatatttcaaaatcattaaaa
gagaaacaaatattcaactctttattaggtacatcatcagcatttcattcatcaaaacaa
gatataatcaaagatgaaatcatagaatcaaccaatcatattcaatcaagaccaccttct
ataacaatattttcaacagtcacatcaaataaattcgataaaaatacaccttatgattca
aattatatatttgacaatataagaaagccagtattatttcaacaaaccattgaaaacata
ttcaaatatattgaatcaaatgatttaggtaattcagtaatatttttagaattatcacct
catccaactttaaaccattatgttaaagaaatgattccaaagaattcaaattacttttta
aacaaagattcaataagtgtattatcatcattaaataagaaaaaagaagatatcaacgaa
attcaatcaacaatttcacaactttattgttttggttacaatattgattttagtgcccaa
tttaaatcggaaataacatcaaattcattcaagaaatgctcatatctaataccacattat
caatgggatgaatcattattttggagagaaggtatttcatcaataaataatagaaaaaat
ggagcatcaataaatcaacttggtaataaaaatgaattatcaccacatatatcatataca
tcatatatcgatattaaagaagaaccatttagattcttaaaagatcatcaatttcgtggt
aaatcacttttcccaggagttggttatttggatattattttaaaacttttcccaaatcaa
gatttaaccataccacttttagaatttaaatcacaatttgtattaactgaaggtgtaaaa
aaaactcttacaactaatctctacaaaagtgcaaagaatgaatatagagcaacatttaat
tttaaagatcaaacaagtggtaaatggatccaatctgcaaatagtagaattttaatgaaa
agtttagatgtaacagttaaaaaagttgatgttcaatcaatacgtgatcaatgtaattgg
tcaactttgaaaagagaacaattatatgatttaattaaaaactattcaaacatttcacta
ttagaatcatttcaaagaattgaagaagcttcatatggtgataatagatgcttgtgtaaa
gtttcattggatccaacttcaagctatgataatgaatcatttttaaatatttgcattatt
gatacatgtatacatccatgtattttctttgataacccagcttcgtctgtttttgaaaga
attgaacatttaaaaatttattcttcaagtgttccattaactgcagaagatagagtgaag
caacaatacgtttactgttatgttgaacttattaaaaaatatagtgattttatttatttt
aaaacaacttgcttcttaaaagatggcactgttctattacattctccattggtaacaatt
gcatctactctatcaacaaatattgatactaatattgaatgtccaaacaatcaattattt
tcacaatgtcttcaaccaaaagattcaattttacaatcaccattaatattgaaagaatat
tttaatcaacaacttcaacttcaacaatcaaatatcatttcaatatctactctatcctct
tatcttttttccacattaaagaaaatattgaataacctaaccactgatgaatttcaaaat
ggttcacttgaagagtttatcggaaaatattcatatatcttggaagagattcaagaagct
agtactttcagatccaatttaatcttcttatcaatcaactttttattaacacatcacaaa
catattgatcaaaaccaagtttcaaactttctcttgaataacattccaaacgaattatta
gttcttgatactattgtttcaaataaaggtatttcacatattggtatttatcaacatcaa
ttaattttagatataatttcaaaatcaattattccaatcgtaaatgaaaaaatagttttt
agaattttagaaattggatgtggtgttggtgaattaactaaactaatcaatgataaatta
gaatcaattttaaatgataatccatcatataacattgatatagaatttgtattttcagat
tataccgattcaaaagtattattaattaaagaaagattatttaattcaaaaaagagttgt
ttctttaaaattattgatttaaacaaacaattacaagaacaatcattttcaccatcttat
tatgatttaattattctatcaaatacaacaaatcaaattaaagatattaaaacatcaatt
tcatttataaatgaaattttaactccaaacggtcatttgttaattttagatacaaatttc
attcaaacatcaatagatgaagattattatttagaaaactacaaacaatggttatcattt
aattatttaaattctggtagtggtgcaatgaaactaaatcaatggaatcaattattaata
aatgatttgaaatttaataatttcatatgttcaacaggtgaaattgaaccatatttaatt
caagttcaaaaatcaaatttatcaaattcaattaattcagttagtaaagagcattcatca
gaatatgatcaaattataatttttggtacttgtgatgaaattaatattggttcttctttc
tatggcttagttccaatagcaataaattcaattgataagtttaaagaacatgtcaaatta
caaccattaactgataaatcattaatattatttattgaatcagtaaatctattaacagtt
gataattttaatcaagtctcaatgaactatatagaaatcaatcaacatttattaaaaaat
gaaatttcaggttgtaaacatattttaatttcaagaaatgtaaactttgaaacttcaaac
ttatttggatcatcattaattggttcatttagatacttttgtgaattcaatcaattaaat
atatattcatttgaatttgaaggtaataatatccttagtggtgatggtggtgataaatta
tttaatattattcaagaattatcaaattcaaataaacattcacaaaatgaattttcaatt
agaagtgatggtaaaatttattatgaaagaattaaattagaatcaaatttaaaattaaaa
tataaatcaaaatcatatattgaaaataaaaatgaattagtttcaagattaaaaccagat
ttaacatttgcattagaagcagtattaccattgaatccaaatttcgttgaagttaaagta
atggcaagtggtgttaattttaaagatttcttagtttatcgtcaattaattaatatggca
aattcaaatgaaaatggtgatccttcaaaaccacaatttggatatgaactaagtggaatc
gttaccaaagtcggtaagaatgtgaccaaattcaaagttggtgatcatgtaatgggaggt
gcttttcatacattttcatcaagtgttcatgtagatcaagacagaatcgaattaaaacca
tcaaacatttcttggtttgaagcatcacaatctttagtttatttaacttcatattgtagt
ttattcgaacttggtagattagatttatatggttcaactgaaacagttttaattcattca
ggaagtggtggtattggtttatcttgtatcgatttattacaagtatatggatttaaagga
tttttatttgtaactgtaggttctgaagaaaagaaacaatttttaaaagatcgttatggt
aatttcatcacagagatttattcaactaaaaatacagactatgaatatttaattaaagag
aaattaattgaattaaaagcaccatctcaagaatatggtagtttttcaatgatttgtgtg
gatttaattataaatactttatcagcagattatatggatgcaaactttaattgtctttca
caaggtggtagaattatagatttatcgatcactcatatgacaacaacagatacaaccgat
ttttataaatttagaaatcatattggttatatgacctatgaatctgtaattgctggtttt
agaaaacataaacatgtattgaaaattattgttgatttattagcaagtggtaaattaaaa
actataccattcaatgtatatccagtaacaaaaattaaagaagcaattgaatcacttggt
gatagaaaacatattggtaaaaatattgtaaatttcaacgatcctgaaggaattgattta
attgattgtcctgaattttcaaataaccacaactttatccatccttcgtcaaattataaa
attcatcaagatactttaggtaaaacaatattaataacaggtcaagcaggtctttcagat
acaatcataaaatggataagagaaaaaagatcagattctattgaatcaataatagtatta
tcaaaatcaccaattaaatttgaattagaaagagcaattggtagaataagatcaacaaat
ttgaaaatctattttaaacaagttgatatttcagatgaaaaacttttattaaaatcaatt
aatcaactatttgaagaaaataaagatattaaaccaattgaatcaatattccataatgca
ttttcaccagcagaatgtgaaccattagaaattgatatgaatcatttaattagctctcat
tctgcgaaatcgatgggtgcctacaatttacataaactttcattaaattggccaataaaa
caatttgttttatcaagttcagtaacatcaattttaggatcacaacgtcaatgtggttat
gttgcttcaaattgctttatagatgcattatcaagacatagaaaatcattaaatctacca
tgtatttcaatcaattggggtctattgggaggtggtggttttgctgcacgtaatgatgct
gtttttaaattatttgaattacaaggttcggttggtatttcaaaagatttagtttggggt
agtttagatttacttttacaaaatcaaaacgaatcgacaaataaaatggttgcatcattt
gaattccacgctacttgtaaaacatacaaatatcataaactttcatataaattagattac
tttttaaatccaatcatatcaaaagaatctgtgactgacgaaaaagaattttcaattaga
caagatatcgttgataaatttgcatcactactttcaactgatcaatccaaactcaattta
gatataaaggtaattgattatggtgctgattcattacttgttgtcgaagttaaaaattgg
gctgataatatatttgctagaaatatattatccatgcctgaaattcaaaactcaacaatt
aatcaaattattaatatcgttacaacaaaagtatcaaatttaccttcaaagaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
