Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0288939
Help
Entry
DDB_G0288939 CDS
T00245
Symbol
valS2
Name
(RefSeq) valine-tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
Pathway
ddi00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ddi00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
DDB_G0288939 (valS2)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
ddi01007
]
DDB_G0288939 (valS2)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
DDB_G0288939 (valS2)
Enzymes [BR:
ddi01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
DDB_G0288939 (valS2)
Amino acid related enzymes [BR:
ddi01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
DDB_G0288939 (valS2)
Transfer RNA biogenesis [BR:
ddi03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
DDB_G0288939 (valS2)
Prokaryotic type
DDB_G0288939 (valS2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
CPSase_L_D3
tRNA-synt_1e
Capsule_synth
ABC_tran_CTD
Val_tRNA-synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626884
NCBI-ProteinID:
XP_636501
dictyBase:
DDB_G0288939
UniProt:
Q54I78
LinkDB
All DBs
Position
5:2152189..2155430
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MNKLLFLSKKSSTSNLYRFYSRAPINESSIKSSFDPKVVEEFKYKYWQDSGLFKPKSNNG
GEKFSMVLPPPNVTGSLHIGHSLTTTIQDSLIRYNRMMGKEVLWVPGLDHSGIATQVAVE
KELQVKQGKTRFDLGREKFLEQVFQWTDQYSSNINNQLKITGSSLDWSRSVFTLDEQRND
AVQTAFIRMFEMGLIYRSTRLVNWCPYLQSVISDIEVDHKVIEKPTMLKLKSRKKSVEVG
AIHNIAYMMEDPMLAPLIVSTTRPETIFGDTGLAIHPLDERYKDYHGKFAIHPFNHERIP
IVLDDILVNREMGTGVVKITPAHDFNDYQCGQRHSLPIVNILNSNGTLNENSTAEFEGVD
RLDARSMVIEKLEQMGLYREKLAHPQTLSICSRSGDLLEPVLKPQWYVKCKDMADKSIEF
VESGEIKIIPESFRADWSRWLTNIQDWCISRQLWWGNPIPAYRVIMIDKVTNEDLDIHLT
ETERLKQEKWVVGKNEKEARENVFKTYGIANAGEYRLEKDQDVLDTWFSSGLFPISSMGW
PTATKNSDNDNDFSRFLPLDVMETGSDILFFWVARMVMMCSTLNNGEVPFKTILLHPMIR
DSQGRKMSKSLGNVIDPLHVINGISLQDLKENLSKSNLSQQEKVTATKGLEKEFPQGIPQ
CGTDSLRFSLAQYPINGKDINLDISKIIGNRLFCNKLWNASKFVFNYLVNLNNLSINLYY
NNNNNEKDQQQPFNYLESTTLIDKWILLKLSKLVEIVNESYKSNNLSIAAQSLYSFFQYD
FCDIYIECIKADLSKPILSKQNEHSSLVLASVLDSYLRMLHPFMPFITEDLWQRLPKSKQ
QLEIANSIEIDDSLSIMISDYPNPSYKYHQLFKNQEIEIEKQVNLFLDTLKLIRSQKVSL
GINEKTKLIIKLQIIGDDQILIKSSFNQLKDSFEKLLNSNLIIDENNNNDNNNNNDNNDL
TNISINKFTISKELQISIEFDKEINNQLNQKLINPNQSNDKKILKLENFIKQLQDEIDNP
DFKQRVPEKVQNIKIEKLNQYKIELKEIYKK
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaactattatttttatcaaaaaaatcatcaacatcaaatttatatagattttat
agtagagcaccaataaatgaatcttcaataaaatcatcatttgatcctaaagttgttgaa
gaatttaaatataaatattggcaagatagtggattatttaaaccaaaatcaaataatggt
ggtgaaaaattttcaatggtattaccaccaccaaatgtaacaggatcattacatattgga
catagtttaacaactacaattcaagattcattgattagatataatcgtatgatgggcaaa
gaagtattatgggtaccaggattggatcattctggaattgcaactcaagttgcagttgag
aaagaattacaagtgaaacaaggtaaaactagattcgatttaggtagagagaaattttta
gaacaagttttccaatggactgatcaatactcgagtaatattaataatcagttaaagata
acaggttcgtcattggattggagtagatcagtgtttacattggatgaacaaagaaacgat
gcagttcaaacggcgtttattagaatgtttgaaatgggcttgatttataggtccactaga
ttggttaattggtgtccatatttgcaatcggtgatttcagatattgaggttgatcataag
gtaattgagaaaccaacaatgttaaaattaaagagtagaaagaagtcagttgaagttggt
gcaattcataatattgcctatatgatggaggatccaatgttggcaccattgattgttagt
actacgagaccagagacgatatttggtgatacgggtctagccattcatccattggatgag
aggtataaggattatcatggtaaatttgcaattcatccatttaatcatgaaagaatacca
atagtgttggatgatattttagtgaatagagagatgggtactggtgtggtaaagattaca
ccagctcatgatttcaatgattatcaatgtggtcaaagacattcattgccaattgtaaat
attttaaattcaaatggtactctaaatgaaaattcaacagcagagtttgaaggtgttgat
agattggatgcaagatcaatggtaattgaaaaacttgaacaaatgggattatatagagag
aaattagcacatccacaaacattatcaatttgtagtagatctggtgatctattagaacca
gtgttaaaaccacaatggtatgttaaatgtaaagatatggctgataaatcaatagagttt
gttgaatctggtgaaattaaaatcataccagaatcattccgtgcagattggtcaagatgg
ttaactaatattcaagattggtgtatatcaagacagttatggtggggtaatcctatacct
gcctatagagttataatgattgataaggtgactaatgaggatttagatattcatttaaca
gaaactgaaagattaaaacaagagaaatgggtagttggtaaaaatgaaaaagaagcaaga
gaaaatgtattcaaaacttatggtatcgccaatgctggtgaatatcgtttagagaaggat
caagatgtattggatacttggttttcatctggacttttcccaatttcatcaatgggttgg
ccaacagcaacaaagaatagtgataatgataatgatttttcaagatttttaccattagat
gttatggagactggttctgatattctattcttttgggttgcaagaatggtaatgatgtgt
tccactcttaataatggtgaagtaccatttaaaaccattctattacatccaatgattaga
gattcacaaggcagaaaaatgtcaaaaagtttaggaaatgtaatagatccattacatgtt
atcaatggtatatcattacaagatcttaaagagaatctttcaaaatctaatctttcacaa
caagagaaagtcacagcaaccaaaggtttagaaaaagaatttcctcaaggtattccacaa
tgtggtactgattcattacgtttttcattagctcaatatccaatcaatggtaaagatatt
aatttagatatttcaaaaattattggtaatcgtttattttgtaataaactttggaatgct
tcaaaatttgtttttaattatttagtaaatttaaataatctatcaattaatttatattat
aataataataataatgaaaaagatcagcaacaaccatttaattatttagaatcaacaaca
ttaattgataaatggatattattaaaattatcaaaattagttgaaattgtaaatgaatca
tataagagtaataatttatcaattgcagcacaatcattatattcattctttcaatatgat
ttttgtgatatttatattgaatgtattaaagcggatttatcgaaaccaattctatcaaaa
caaaatgaacattcatcattggtattggcaagtgtattagatagttatcttagaatgctt
cacccatttatgccatttataactgaagatctttggcaaagattaccaaaatctaaacaa
caattagagattgcaaactctattgaaattgatgattcattatcaattatgatttcagat
tatccaaatccatcctataaatatcatcaattatttaaaaatcaagaaattgaaattgaa
aaacaagttaatctattccttgatactttaaaactaattagatctcaaaaagtttcatta
ggaataaatgaaaaaacaaaattaattataaaattacaaattataggtgatgatcaaatt
ttaattaaatcaagttttaatcaactaaaagattcatttgaaaaattattaaattcaaat
ttaataattgatgaaaataataataatgataataataataataatgataataatgattta
acaaatatatcaataaataaatttacaatttcaaaagaattacaaatttcaattgaattt
gataaagaaattaataatcaattaaatcaaaaattaattaatccaaatcaatcaaatgat
aaaaagattttaaaattagaaaattttattaaacaattacaagatgaaattgataatcca
gattttaaacaaagagtacctgaaaaagttcaaaatattaaaattgaaaaattaaatcaa
tataaaattgaattaaaagaaatttataaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
