Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0291684
Help
Entry
DDB_G0291684 CDS
T00245
Symbol
pks41
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
Methyltransf_23
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N
ADH_zinc_N_2
ADH_N
PP-binding
Methyltransf_11
PS-DH
Methyltransf_25
PKS_DH_N
Thiolase_N
Methyltransf_31
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8628248
NCBI-ProteinID:
XP_635304
dictyBase:
DDB_G0291684
UniProt:
Q54ED6
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(545874..553580)
Genome browser
AA seq
2542 aa
AA seq
DB search
MDSKNLVDENCNKVAIIGIGFRFPNLKGDITPNELWSKLLNRYDGIVKNDRWNESFFKSG
DISTNYAGFIPFEELKSFDPLFFGINPSEGIHMCPQQRLLLKCTWEALEDSGIDPIEIRG
SNTSVFIGCSGADYQNLNKNDNKVQQEIFSSSTHSISNRVSYCFDLHGESMTIDTACSSS
SNAIRRGYKSIIDGSSNISVVGGINILLDPNISKSYSRLNILSKDGKCKSFDAGADGYVR
SDAAGIAILKNLNDAIKDDNNIYCVIDGSASNVDGNGFSDKSNFYSPSKSSQVECIRLAL
ESTNGQVNENDIVYFEAHGTGTPTGDPIELESVSIALKTSENRSSDNPLLIGSFKPNIGH
TESASGISSLIKCCLILKNQCFVPNLNFNKPNPLIKFDQWNLKVVTDPIDFSTLNYINKR
VSIAINNFGVTGSNCCLIVSSFKGNQIRNNINNKSKSPKQYLIPFSTNSIKSLDLYKSRI
DNNVEFKEFAENQIKSKSKKLIQRSVVIASNWDEFNLKSNTINTSNDKLTSNMLVSSNKK
NVTMVFVFCGQGAQYSTMAKNLYDNEPIFKKSMDKIDSKLNEYYGFSILEKLRSFNENDL
KGIQYSIIAQPSTCMVQISLFELYCHWGIKPSIIVGHSLGEISSSYCSGMIDLDTFCYLI
YHRSMVQSKTNGLGRMLSISIGENEYNSKYSSRYPELEIACYNSPSSIVIAGKELILNEI
IKELKKDGVFCAILGSPTSFHTSSQLSVKDEILKISFKSKQPTIPIFSTVTTNLYDEMNP
FDTKYVYDNIINPVRFTNTISNIYKHIELNYSVNNNSNEVIFIEIAPHPTLSFYLKQMVP
EDKKQSVSIFSPLSKKKSNDLFEIQKLISELYCLGYNGIGFNIQLSDHNNTNNQTRVNLP
LYQWEDQEYWKLDNLHQYHLSNGPSINHLGISNSNHTPIKSYQTHINIQKKPFQWLKGHQ
IKGKYYFPGCGYIDNILKIFGESKTDTNPNKELPDILISFIEFKTPLIFMDGISQCLQTN
IHSTGKKEYKALFHFKDEKSSSDWVQTSTANFQLFSRGPNLNEDDEQSLFMYNINDLISN
QCNLTKLSKQELYSHIKTKCGLNYSGDFQRVDKCYLGYNCSLSEISIIQGVNENRSTFFD
SSIIDCCLHGSIGLIDENCQLVFEKLEELTYYSSKVPKTTSQHSKIYVYSKLKPRIGDSY
SASIIVMLENGTVLFEMENASFKSTTKIKDPLAMEYPTNEIYSCNLQSKDSLIPSLSSFD
HIFKRKIPNEYVDQINIYESFIPKLLFSNINKRCPEITIDEIQSSEIEQLLLKYYKIKED
NDNKWLSRLFTFAFESIKQWYHNEDYDFENVLSPHNFKIFSKSTKIISKLLFPLENDNDE
DSPQSLFEGGLLDKFYSSGFSAQNELVGEIIQESIKPILNEKLVFRILEFGGGVGSLSLL
VLEKINSLLIQYPNYQIDIEYTWSDISPSFITEAKAKFEKFNDRFNIIYKALNLEQPLIG
EKQGLKPQYFDYIIMFNVLHVIKDVKYGVEQIYQLLVPNGHLLFIEPIYKSIIGDGIFGV
FDQWWSFQDTEIRKDRCCMKQKTWYKLLKSVNFNDDIRMTPELTCFVIQAQKPSISNLSF
SKSETTNYDSIIVFGNKYASNLSNHFIKSIDNGNLQFISTIEELNKIGKYISNESIIYFI
KSIDELSVDNFVNITHEYTQINQKLMELNCKCKHVLITNDSTTTNYLSSSLIGAARYYHE
CPLELFILNFDTPSIIENQNLFKTIEPLINSSINIQREFIINNHKVYYERIKNETKLKSI
FKNSSSFESLEQVDNFMISLTPNLEYKVKVKPTSILKENEVEIKVMSTGLNYKDYLIYAG
LVESVEPIFGIEFSGIITRISTGSKEFKVGDHVYGIGKSTTSSHIITDIDVISHKPSNIS
HSEASSIPVVYLTSYHSLYNIGALKNNETILIHSATGGVGLSTLEILKWKGHSGLIFVTV
GSNEKEEYLRENYGDMISGIYSTRNKNFVKQIKSKISKLNPFGKSGVDFILNTLSSSDYM
DSNFKCLNMSGRIVDLSITHLNSNEFTDNKKFKYNYGYHNIELQYVDKKIIKSTLSIISN
AVSSNDLQLIPITHYSIEKVKESIEFINERVHMGKIIINHENQDSIINELIEKQKSINKF
DQSIFKQNYKLEPSLLGRNILLTGQSGIVLEILKWILRNSENNSIGNIIILSKSSIKWEM
EYLINKVKLINKLGNFFNNIKFHFKSVDISDSGLIDESINKLLIENPDINNIDSIFHFAY
TQATCNSDEVDLHHLTQSHSAKSMGAINLHNQSIKRNWKLKNFIMSSSVSSKTSTANQCG
YISSNNVLDALSKYRISIGLPTICTNYGLIESTGFVSRNESVAALLSGEGFIPISANLIL
GTLDLQLQNQAQSSNLILSNFNFTSLNGLPQKSLISKFDYQININEENEKSKSLLKDDNV
ELTVDQLITFKISEILSTDILKLNKDIILVDYGIDSLVIIQLKNWVDKEFSIPNELTIQK
IQNSTINSFIQLVKNSMDKNKK
NT seq
7629 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattctaaaaatctagtggatgaaaattgtaataaagttgcaattatcggaataggt
tttagatttccaaatttaaaaggtgatataacaccaaatgaactatggagtaaattattg
aataggtatgatggaattgttaaaaatgatagatggaatgaaagtttttttaaatcaggt
gatatttcaacaaattatgctggatttataccatttgaagaattgaaatcatttgatcca
ttattttttggaattaatccatctgaaggtattcacatgtgcccacaacaaagattatta
ttaaagtgtacttgggaagcattggaagattctggaattgatccaattgaaattcgtggt
tccaatacttcagttttcattggttgtagtggtgctgattatcaaaatttaaataaaaac
gataataaagttcaacaagaaatattctcttcatcaacacattcaatatcaaatcgtgta
tcttattgttttgatttacatggtgagtcaatgacaattgatactgcatgctcatcatca
tcaaatgcaatcagaagaggttataaatcaattattgatggttcaagtaatatttctgtt
gttggtggtattaatattttattagatccaaatatatcaaaatcatattcacgtttaaat
attttaagtaaagatgggaagtgtaaatcgtttgatgctggtgcagatggttatgttaga
tctgatgcagcaggtattgcaattttgaagaatttaaatgatgcaatcaaagatgataac
aatatttattgtgtaattgatggttcagcatcaaatgtcgatggtaatggattttcagat
aaatcaaatttttattcaccttcaaaatcatcacaagttgaatgtattcgtttggcactg
gagtcaacaaatggacaggtcaatgaaaatgatatcgtttattttgaagctcatggcact
ggtacaccaactggtgatccaattgaattggaaagtgtttcaatagctttgaaaaccagt
gaaaatcggtcatctgataatccattattaattggttcatttaaaccaaatatcggtcac
actgaatctgcatccggtatatcatcattaattaaatgttgtttaattttaaaaaatcaa
tgttttgttccaaatttaaattttaataaaccaaatccacttattaaatttgatcaatgg
aatttaaaggttgtaacagacccaattgatttttcaactttaaattatataaataaacga
gtttcaattgcaattaataatttcggtgtcactggttcaaattgttgtttaattgtatca
agtttcaaaggaaatcaaattagaaataatattaataataaatcaaaatcaccaaaacaa
tatttaatcccattttcaacaaattcaattaaatcattagatttatataaatcaagaatt
gataataatgttgaatttaaagaatttgcagaaaatcaaataaaatcaaaatctaaaaaa
ttaattcaacgttcagttgtaattgcaagtaattgggatgagtttaatttaaaatcaaat
actatcaatacatcaaatgataaattaacatcaaatatgttagtatcatcaaataaaaag
aatgtaacaatggtatttgtattctgtggtcaaggagctcaatattcaacaatggcaaag
aatttatatgataatgaaccaattttcaaaaaatcaatggacaaaattgattcaaaatta
aatgaatattatggattttcaattttagaaaaattaagatcatttaatgaaaatgattta
aaaggtattcaatattcaataattgcacaaccatcaacttgtatggtacaaatttcatta
tttgaattatactgtcattggggtattaaaccatcaattatcgtcggtcatagtttaggt
gaaatttcatcatcatattgttctggtatgattgatttagatactttttgttatttaatt
tatcacagatcaatggtacaatcaaaaacaaatggtctcggtagaatgttatcaatttca
attggcgagaatgaatataattcaaaatactcttcaagatatccagaattagaaattgca
tgttacaattcaccatcatcaattgttattgctggtaaagaattaatcttgaatgaaatt
attaaagaattaaaaaaagatggtgtattttgtgcaatattaggttctccaacttcattc
catacctcaagtcaattatcagtaaaagatgaaattttaaaaatttcattcaaatcaaaa
caaccaactattccaattttctcaacagttacaacaaatttatatgatgaaatgaatcca
tttgataccaaatatgtttatgataatatcattaatcctgtaagatttacaaatacaatt
tcaaatatttataaacatattgaattaaattattcagttaataataatagtaatgaagtt
atatttattgaaattgcaccacatccaactttatcattttatttaaaacaaatggtacca
gaggataaaaaacaatcagtttcaatcttttcaccactttcaaaaaagaaatcaaatgat
ttatttgaaattcaaaaattaatttcagaattatattgtttaggttataatggtatcgga
tttaatattcaattatctgatcataataataccaataatcaaactagggtaaatttgcca
ttatatcaatgggaagatcaggaatattggaaacttgataatcttcaccaatatcatctt
tcaaatggtccatcaatcaatcatcttggtatttcaaattcaaatcatacaccaattaaa
tcatatcaaactcatattaatattcaaaagaaaccattccaatggttaaaaggacatcaa
attaaaggaaagtattatttcccaggttgtggttacattgacaacattttaaaaatattt
ggtgaatcaaaaactgatacaaacccaaataaagagttaccagatatattgattagtttt
attgaatttaaaactccattaatttttatggatggaatcagtcaatgtttacaaaccaac
attcactcaactggtaaaaaagaatataaagcattattccattttaaagatgaaaaatca
tcaagcgattgggtacaaacatcaactgcaaatttccaattattttcaagaggtcctaat
ttaaacgaagatgacgaacaatccttatttatgtataatataaatgatttaatttcaaat
caatgtaaccttacaaaattatcaaaacaagaattatattctcatattaaaacaaaatgt
ggtttaaattattctggtgatttccaaagagttgataaatgttatttaggttacaattgt
tcattatctgaaatatcaattattcaaggtgttaatgaaaatagatcaaccttttttgat
tcatcaattattgattgttgtttacatggttcaattggtttaattgatgagaattgtcaa
ttggtatttgaaaaacttgaagaattaacatactattcatcaaaggttccaaagacaaca
agtcaacattctaaaatatatgtttattcaaaattaaaaccaagaattggtgattcatat
tctgcatcaattattgtaatgttagaaaatggtactgttttatttgaaatggaaaatgca
tcatttaaatcaactacaaaaattaaagatccattggcaatggaatatccaacaaatgaa
atttattcatgtaatttacaatcaaaagattcattaattccatcactatcatcatttgat
catattttcaaaagaaaaatacctaatgaatatgttgatcaaattaatatctatgaatca
tttattccaaaattattattttcaaatatcaataaaagatgtccagaaattacaattgat
gaaattcaatcaagtgaaattgaacaattattattaaaatattataaaattaaagaagat
aatgataataaatggctttcaagattatttacatttgcatttgaatcaataaaacaatgg
taccataatgaagattatgattttgaaaatgttttaagtcctcataattttaagatattc
tcaaagtcaacaaagataatttcaaagttattattcccattagaaaatgataatgatgaa
gattcaccacaatcattattcgaaggtgggttattagataaattctattcaagtggtttt
tctgctcaaaatgaattggtgggtgaaatcattcaagaatccatcaaaccaatattaaat
gaaaaattagtatttagaatattagaatttggaggtggtgttggatcattatcgttatta
gtacttgaaaaaatcaattcattattaattcaatatccaaattatcaaattgatattgaa
tatacatggtcagatatatcaccatcttttattaccgaagcaaaagctaaatttgaaaag
tttaatgatagatttaatattatttataaagcattaaatttagaacaaccattgattggt
gaaaaacaaggattaaaaccacaatactttgattatataattatgtttaatgtattacat
gtcattaaagatgttaaatatggtgttgaacaaatttatcaattattagtaccaaatggt
catttattattcatcgaaccaatttataaatcaattataggtgatggtatttttggtgtt
tttgatcaatggtggtctttccaagatactgaaattagaaaagatagatgttgtatgaaa
caaaaaacttggtataagttattaaaatcagtaaattttaatgatgatattagaatgaca
ccagaattaacatgttttgtaattcaagctcaaaaaccatcaatttcaaatctttcattt
tcaaaatctgaaaccacaaattatgatagtattattgtttttggtaataaatatgcttca
aatttatcaaatcattttataaaatcaattgataatggtaatttacaatttatatcaaca
attgaagagttaaataaaattggaaaatatatttcaaatgaatcaattatttacttcatt
aaatcaattgatgaattatctgttgataatttcgtaaacattacacatgaatatactcaa
atcaatcaaaaattaatggaattgaattgtaaatgtaagcatgttttaattacaaatgat
tcgacaacaaccaattatttaagttcttcattaattggtgctgcaagatattatcatgaa
tgtcctttagagttgtttatattaaatttcgataccccatcaattattgaaaatcaaaat
ttatttaaaacaattgaaccattaattaattcatcaattaatatacaaagagagtttata
attaataatcataaggtttattatgaaagaattaaaaatgaaacaaaattaaaatcaatt
ttcaagaactcaagttcatttgaatcattagaacaagttgataactttatgatatcatta
acaccaaatttagaatataaagtaaaagtaaaaccaacatcaatattaaaagaaaatgaa
gttgaaattaaagtaatgtcaacaggtttaaattataaagattatttaatatatgcaggt
ttagtagagagtgttgaaccaattttcggtatagagttttctggtattattacaagaatt
agtacaggtagtaaagaatttaaagttggtgatcacgtttacggtattggtaaaagtaca
acatcatctcatattattacagatatcgatgtaataagtcataaaccatcaaacatatct
cattcagaagcatcatcaattccagttgtttatttaacttcatatcattcactttataat
attggtgcattaaaaaataatgaaacaatattaattcattctgcaactggtggtgttggt
ttatcaactttagaaatattaaaatggaaaggccattctggtttaatttttgtaactgtt
ggttcaaatgaaaaagaagagtatttaagagaaaattatggtgatatgatttcaggtata
tattcaacaagaaataaaaatttcgttaaacaaattaaatcaaaaattagtaaattaaat
ccatttggtaaaagtggtgttgactttatattgaatacattatcatcaagtgattatatg
gattcaaatttcaaatgtttaaatatgagtggtagaattgttgatttatcaattactcat
ttaaattcaaatgaatttactgataataagaaatttaaatataattatggttatcataat
attgaattacaatatgttgataagaaaattataaaatcaactttatcaataatttcaaat
gcagtttcatcgaatgatttacaattaattccaattacacattattcaattgaaaaagtt
aaagaatcaattgaatttataaatgaaagagttcatatgggtaaaatcattataaatcat
gaaaatcaagattcaattataaatgaattaattgaaaaacaaaaatcaattaataaattt
gatcaatcaatttttaaacaaaattataaacttgaaccatcattattaggtagaaacata
ttattaacaggtcaatcaggtatagttttagaaattttaaaatggatattaagaaattct
gaaaataattcaattggcaatataatcattttatcaaaatcatcaattaaatgggaaatg
gagtatttaataaacaaggtaaaattaattaataagcttggtaattttttcaataatatt
aaatttcatttcaagagtgtcgatattagtgattctggattaattgatgaatcaattaat
aaattattaattgaaaatccagatattaataatatcgattcaatattccatttcgcatac
actcaagccacttgtaattctgatgaagttgatttacatcatttaacacaatctcatagt
gcaaaatcaatgggtgcaattaatttacataatcaatcaattaaaagaaattggaaatta
aaaaattttataatgtcatcaagtgtttcaagtaaaacaagtacagcaaatcaatgcggt
tacatctcatctaataatgttttagatgcattatcaaaatatagaatttcaattggttta
ccaacaatttgtacaaattatggtttaattgaatccacaggtttcgtttcaagaaatgaa
agtgttgcagcattattaagtggtgaagggtttataccaatatcagcaaatttaatttta
ggtacattggatttacaattacaaaatcaagcacaatcatcaaatttaattttatcaaat
ttcaatttcacctcgttgaatggattacctcaaaaatcattaatatctaaatttgattac
caaattaatataaatgaagaaaatgaaaaatcaaaatcattattaaaagatgacaatgtt
gaattaactgttgaccaattaataacatttaaaatttcagagatattatcaactgatatt
ttaaaacttaataaagatatcattttagttgattatgggattgattctttagttatcatt
caattaaagaattgggtagataaagaattttcaattccaaatgaattaacaattcaaaaa
atccaaaatagtacgatcaattcatttattcaacttgttaaaaattctatggataaaaat
aaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
