Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0284001
Help
Entry
DDB_G0284001 CDS
T00245
Symbol
pks22
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_12
Methyltransf_23
Methyltransf_31
PKS_DH_N
ADH_N
PP-binding
Methyltransf_11
Thiolase_N
Methyltransf_25
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8624335
NCBI-ProteinID:
XP_638811
dictyBase:
DDB_G0284001
UniProt:
Q54QD3
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(1312340..1320136)
Genome browser
AA seq
2499 aa
AA seq
DB search
MIEGNIEKNNDNQVAIVGLGLRLPGNSGSPSEFWKNLLGGFDGIVDSNERWSDTFHSMGE
ISNKNAGLIDLEENWHSFEPLFFGINPTDAKQIDPQIKLMLKLTWEAFEDASIDPLKLRG
TNTSVFVGAANTDYSFINFEQNEAPINVFNGTLSAFANRISYCFDLRGTSLTLDTACSSS
LNAVHLGYESIVNGKSNYSVVAGCNILLNPYITRSFHSINITGKSGRCNSFDESADGFVR
SEGVVVLILKRLSLAIQDGDQIYCVMKGSSSNVDGTFKKTNFFAPSKNAQSTNIKNAFLS
SNGAMKYQDIDFFELHSTGTQVGDPIEVEAVADIFKNVKQEPLLIGSVKSNIGHLEPASG
VASLAKVCLMFKHRQFVKNIHFNNPNPNIKFKEWNVKVCTETTAFPDRQVSMAINSFGIT
GSNACVLLSEYIKPSELKNQTSMKLNEKSKLLIPISTNSKKSLEQFKSKLLEEIDTYSES
LTFEEFAMFQVYSKTTKLSQRSVLIGNDWNDLKIDINEIISTKNNKSGNIIKSNDINPPL
VFSFCGQGPQYSKMGLNLYENEPIYKQSMDILDSILFKYFGYSIIQKLRSINDDPILINE
PILAQPSIFMIQISLYKLYLHWGITPSIIVGHSLGEVASAFCSGMIDLETACFVIYKRAT
IQNKTNGSGRLLAISLNLEEFNNQFSKEYPEIEISCFNSPSSIVVCGNELDILNISKSLK
DKQIFNSLLGTSSAFHSSKQDIIKDEIIESTNHIQSRPPSITTFSTVTSNKFDKNTPYNS
SYIFDNLRKPVLFQQTIENIFKHIESNDLGNSVIFLELSPHPTLNHYVKEMIPKNSNYFL
NKDSISVLSSLNKKKEDINEIQSTISQLYCFGYNVDFSAQFKSEITSNSFKKCSYLIPHY
QWDESLFWREGISSLNNRKNGAPINQLGNKNESSPHISYTSYIDIKEEPFRFLKDHQFRG
KSLFPGVGYLDIILKLFPNQDLTIPLLEFKSQFVLTEGVKKTLTTNLYKSAKNEYRATFN
FKDQTSGKWIQSANSRILMKSLDVTVKKVDVQSIRDQCNWSTLKREQLYDLIKNYANISL
LEPFQRIEEASYGDNRCLCKVSLDPTSSYDNESFLNICIIDTCIHPCIFFDNPASSVFER
IEHLKIYSSSVPLTAEDRVKQQYVYCYAELIKQFSDFIYFKTTCFLKDGTVLLHSPLVTI
ASTLSTKSETDLECPNNQLFSQCLQPKDSILQSPLILKEHFNQQLQLQQSNIISISTLST
YLFSILKKRLNNLTVDEFQNNSLEQLIEKYSYVLDEVEVGTIRSNLILLTINFLLTHHKH
IDQNQVSNFLLNNIPNELLVVDTIVSNKGISHIGIYQHQLILDIISKSIIPIVNEKIVFR
ILEIGCGVGELTKLINDNLESILNDNPSYNIDIEFVFSDYTDSKVLLIKERLFNSKKSCF
FKIIDLNKQLQEQSFSPSYYDLIILSNTTNQIKDIKTSISFINEILTPNGHLLILDTNFI
QTSIDEDYYLENYKQWLSFNYLNSGSGAMKLNQWNQLLINDLKFNNFICSTGEIEPYLIQ
VQKPNLSNSINSVSKEHTSEYDQIIIFGTCDEINIGSSFCGSGGVVPIAINSIDKFKEHA
KLQPLTDKSLILFIESVNLLTVDNFNQVSMNYIEINQHLLKNEISGCKHILISRNINFET
SNLFGSSLIGSFRYFCEFNQLNIYSFEFEGNNILSGGDKLFNIIQELSNSNKHSQNEFSI
RSDGKIYYERIKLESNLKLKYKSKSYIENKNELVSRLKPDLTFALEAVLPLNPNFVEVKV
MASGVNFKDFLVYRQLINMANSNENGDPSKPQFGYELSGIVTKVGKNVTKFKVGDHVMGV
TFHTFSSSVHVDQDRIELKPSNISWFEASISLVYLTSYCSLFELGRLGLHGSTETVLIHS
GSGGIGLSCIDLLQVYGFKGFLFVTVGSEEKKQFLKDRYGNFITEIYSTKNTDYEYLIKE
KLIELKAPSQEYGGFSMICVDLIINTLSADYMDANFNCLSQGGRIIDLSITHMTTTDTTD
FYKFKNHIGYMTYESVIAGFRKHKHVLKIIVDLLASGKLKTIPFNVYPVTKIKEAIESLG
DRKHIGKNIVNFNDPEGIDLIDCPEFSNNHNFIHRSSNYKIHQDTLGQTILITGQAGLSD
TIIKWIREKRSDSIESIIVLSKSPIKFELERAIGRIRSTNLKIYFKQVDISDEKLLLKTI
NQLFEENKDIKPIESIFHNAFSPAECEPLEIDMNHLISSHSAKSMGAYNLHKLSLNWPIK
QFVLSSSVTSILGSQRQCGYVASNCFIDALSRHRKSLNLPCISINWGLLGGGGFAARNDA
VFKLFELQGLVGISKDLVWGSLDLLLQNQNESTNKMVASFEFHATCKTYKNHKLSYKLDY
FLNPIISKESVTDEKEFSIRQDIVDKFASLLSTDQSKLNLDIKVIDYGADSLLVVEVKNW
ADNKFTRNILSMPEIQNSTINQIINIVTTKVSNLPSKKK
NT seq
7500 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgaaggaaatattgaaaagaacaatgataaccaagttgcgattgttggtcttggg
ctaagattaccaggtaactcgggttctccttcagaattttggaaaaatttgcttggtggt
tttgatggaattgttgattctaacgaaagatggagcgacacattccatagtatgggagaa
atctcaaataagaacgcaggattaattgatttggaagagaattggcattcttttgaacca
ttgttttttggaatcaatccaactgatgctaaacaaattgatccacaaattaaattaatg
ttaaagttaacatgggaagcatttgaagatgcatcaattgatcctttaaaactcagagga
accaatacttctgtttttgttggtgccgcaaatactgattattcttttattaatttcgaa
caaaatgaagcaccaatcaatgtttttaatggtactctcagtgcatttgcaaatagaata
tcatattgttttgatttacgtggtacttcattaacacttgatacagcatgttcatcatca
ttaaatgcagttcatttaggatatgaatcaattgttaatggtaaatcaaattactctgta
gtagctggttgtaatatattattaaatccatatattactagatcatttcattcaattaat
attacaggtaaatctggtagatgtaattcatttgacgaatctgccgacggttttgtacgt
tcagaaggtgttgttgtattaattttaaaaagattatcacttgcaattcaagatggtgat
caaatttattgtgtaatgaaaggaagtagttcaaatgtagatggtacttttaagaaaaca
aacttttttgcaccttcaaaaaatgcacaatcaactaatatcaaaaatgcatttttatca
tccaatggtgcaatgaaatatcaagatattgatttctttgaattacatagtacaggtaca
caagtaggtgatccaatcgaagttgaagctgttgctgatatttttaaaaatgttaaacaa
gaaccattattaattggatcagttaaatcaaatattggtcatcttgaacctgcatcaggt
gtagcatcattagcaaaagtttgtttaatgtttaaacatcgtcaatttgtaaagaatatt
catttcaataacccaaatccaaatattaaattcaaagaatggaatgttaaagtatgtaca
gaaacaacagcattcccagatagacaagtatcaatggcaatcaatagttttggtataact
ggttcaaatgcatgtgttttattgtctgaatatatcaaaccttcagaattaaaaaatcaa
acatctatgaaattaaatgaaaaatcaaaattattaataccaatctcaaccaactcaaag
aagtcactcgaacaattcaaatcaaaactacttgaagaaattgatacatattcagaaagc
ttaacttttgaagagtttgcaatgtttcaagtttattcaaaaacaaccaaattatcacaa
agatcagttttaattggtaatgattggaatgatttaaaaattgatataaatgaaattatt
tcaacaaaaaataataaatctggtaatattatcaaatcaaatgatattaatccaccatta
gtattttcattttgtggtcaaggtcctcaatattcaaaaatgggtttaaatttatatgaa
aatgaaccaatatataaacaatccatggatatattagattcaatactatttaaatatttt
ggatattcaatcattcaaaaactaagatcaattaatgatgatccaattctaattaatgaa
ccaatattagctcaaccatctatatttatgattcaaatatcattatataaattatatttg
cattggggaatcacaccatctataatagttggccatagtttaggagaagtagccagtgca
ttttgttcaggtatgattgatttagaaacagcatgcttcgtgatatataaaagagcaacc
attcaaaataaaaccaatggatctggaagacttttagcaattagtttaaatcttgaagaa
ttcaataatcaattttcaaaggaatatccagaaattgaaatttcatgttttaactcacca
tcatcaatcgttgtatgtggtaatgaacttgatatattaaatatttcaaaatcattaaaa
gataaacaaatattcaactctttattaggtacatcatcagcatttcattcatcaaaacaa
gatataatcaaagatgaaatcatagaatcaaccaatcatattcaatcaagaccaccttct
ataacaacattttcaacagtcacatcaaataaattcgataaaaatacaccttataattca
agttatatatttgacaatttaagaaagccagtattatttcaacaaacaattgaaaatata
ttcaaacatattgaatcaaatgatttaggtaattcagtaatatttttagaattatcacct
catccaaccttaaaccattatgttaaagaaatgattccaaagaattcaaattacttttta
aacaaagattcaataagtgtattatcatcattaaataagaaaaaagaagatattaatgaa
attcaatcaacaatttcacaactttattgttttggttacaatgtcgattttagtgcccaa
tttaaatcggaaataacatcaaattcattcaagaaatgctcatatctaataccacattat
caatgggatgaatcattattttggagagaaggtatttcatcactaaacaatagaaagaat
ggagcaccaataaatcaacttggtaataaaaatgaatcatcgccacatatatcatataca
tcatatatcgatattaaagaagaaccatttagattcttaaaagatcatcaatttcgtggt
aaatcacttttcccaggagttggttatttggatattattttaaaacttttcccaaatcaa
gatttaaccataccacttttagaatttaaatcacaatttgtattaactgaaggtgtaaaa
aaaactcttacaactaatctctacaaaagtgcaaagaatgaatatagagcaacatttaat
tttaaagatcaaacaagtggtaaatggatccaatctgcaaatagtagaattttaatgaaa
agtttagatgtaacagttaaaaaagttgatgttcaatcaatacgtgatcaatgtaattgg
tcaactttgaaaagagaacaattatatgatttaattaaaaattatgcaaacatttcacta
ttagaaccatttcaaagaattgaagaagcttcatatggtgataatagatgcttgtgtaaa
gtttcattggatccaacttcaagctatgataatgaatcatttttaaatatttgcattatt
gatacatgtatacatccatgtattttctttgataacccagcttcgtctgtttttgaaaga
attgaacatttaaaaatttattcttcaagtgttccattaactgcagaagatagagtgaag
caacaatacgtttactgttatgctgagcttattaaacaatttagtgattttatttatttt
aaaacaacttgcttcttaaaagatggcactgttctattacattctccattggtaacaatt
gcatctacactatcaacaaaaagtgaaactgatcttgaatgtccaaacaatcaattattt
tcacaatgtcttcaaccaaaagattcaattttacaatcaccattaatattgaaagaacat
tttaatcaacaacttcaacttcaacaatcaaatatcatttcaatatctaccctatctaca
tatcttttttccatattaaagaaaagattaaataacctaaccgttgatgaatttcaaaat
aattcacttgaacagttgattgaaaaatattcatatgtcttggatgaggttgaagttggt
actatcagatccaatttaatcctcttaacaatcaactttttattaacacatcacaaacat
attgatcaaaaccaagtttcaaactttctcttgaataacattccaaacgaattattagta
gttgacactattgtttcaaataaaggtatttcacatattggtatttatcaacatcaatta
attttagatataatttcaaaatcaattattccaatcgtaaatgaaaaaatagtttttaga
attttagaaattggatgtggtgttggtgaattaactaaactaatcaatgataatttagaa
tcaattttaaatgataatccatcatataacattgatatagaatttgtattttcagattat
accgattcaaaagtattattaattaaagaaagattatttaattcaaaaaagagttgtttc
tttaaaattattgatttaaacaaacaattacaagaacaatcattttcaccatcttattat
gatttaattattctatcaaatacaacaaatcaaattaaagatattaaaacatcaatttca
tttataaatgaaattttaactccaaacggtcatttgttaattttagatacaaatttcatt
caaacatcaatagatgaagattattatttagaaaactacaaacaatggttatcatttaat
tatttaaattctggtagtggtgcaatgaaactaaatcaatggaatcaattattaataaat
gatttgaaatttaataatttcatatgttcaacaggtgaaattgaaccatatttaattcaa
gttcaaaaaccaaatctatcaaattcaattaattcagttagtaaagagcatacatctgaa
tatgatcaaattataatttttggtacttgcgatgaaattaatattggttcttctttctgt
ggtagtggtggcgtggttccaatagcaataaattcaattgataaattcaaagaacatgcc
aaattacaaccattaactgataaatcattaatattatttattgagtcagtaaatctatta
acagttgataactttaatcaagtctcaatgaactatatagaaatcaatcaacatttatta
aaaaatgaaatttcaggttgtaaacatattttaatttcaagaaatataaactttgaaact
tcaaacttatttggatcatcgttaattggttcatttagatacttttgtgaattcaatcaa
ttaaatatttattcatttgaatttgaaggtaataatattcttagtggtggtgataaatta
tttaatattattcaagaattatcaaattcaaataaacattcacaaaatgaattttcaatt
agaagtgatggtaaaatttattatgaaagaattaaattagaatcaaatttaaaattaaaa
tataaatcaaaatcatatattgaaaataaaaatgaattagtttcaagattaaaaccagat
ttaacgtttgcattagaagcagtattaccattgaatccaaatttcgttgaagttaaagta
atggcaagtggtgttaattttaaagatttcttagtttatcgtcaattaattaatatggca
aattcaaatgaaaatggtgatccttcaaaaccacaatttggatatgaactaagtggaatc
gttaccaaagtcggtaagaatgtgaccaaattcaaagttggtgatcatgtaatgggagtt
acttttcatacattttcatcaagtgttcatgtagatcaagacagaatcgaattaaaacca
tcaaacatttcttggtttgaagcatcaatctcattggtttatttaacttcatattgtagt
ttattcgaacttggtagattaggtttacatggttcgactgaaacagttttaattcattca
ggaagtggtggtattggtttatcttgtatcgatttattacaagtatatggatttaaagga
tttttatttgtaactgtaggttctgaagaaaagaaacaatttttaaaagatcgttatggt
aatttcatcacagagatttattcaactaaaaatacagactatgaatatttaattaaagag
aaattaattgaactaaaagcaccatctcaagaatatggtggtttttcaatgatttgtgtg
gatttaattattaatactttatcagcagattatatggatgcaaactttaattgtctttca
caaggtggtagaattatagatttatcaatcactcatatgacaacaacagatacaaccgat
ttttataaatttaaaaatcatattggttatatgacttatgaatctgtcattgctggtttt
agaaaacataaacatgtattgaaaattattgttgatttattagcaagtggtaaattaaaa
actataccattcaatgtatatccagtaacaaaaattaaagaagcaattgaatcacttggt
gatagaaaacatattggtaaaaatattgtaaatttcaacgatcctgaaggaattgattta
attgattgtcctgaattttcaaataatcacaactttatccatcgttcatcaaattataaa
attcatcaagatactttaggtcaaacaatattaataacaggtcaagcaggtctttcagat
acaatcataaaatggataagagaaaaaagatcagattctattgaatcaataatagtatta
tcaaaatcaccaattaaatttgaattagaaagagcaattggtagaataagatcaacaaat
ttgaaaatctattttaaacaagttgatatttcagatgaaaaacttttattaaaaacaatt
aatcaattatttgaagaaaataaagatattaaaccaattgaatcaatattccataatgca
ttttcaccagcagaatgtgaaccattagagattgatatgaatcatttaattagctctcat
tctgcaaaatcgatgggtgcctacaatttacataaactttcattaaattggccaataaaa
caatttgttttatcaagttcagtaacatcaattttaggatcacaacgtcaatgtggttat
gtagcttcaaattgctttatagatgcattatcaagacatagaaaatcattaaatctacca
tgtatttcaatcaattggggtctattgggaggtggtggttttgctgcacgtaatgatgct
gtttttaaattatttgaattacaaggtttggttggtatttcaaaagatttagtttggggt
agtttagatttacttttacaaaatcaaaacgaatcaacaaataaaatggttgcatcattt
gaattccacgctacttgtaaaacatacaaaaatcataaactatcatataaattagattac
tttttaaatccaatcatatcaaaagaatctgtgactgacgaaaaagaattttcaattaga
caagatatcgttgataaatttgcatcactactttcaactgatcaatccaaactcaattta
gatataaaggtaattgattatggtgctgattcattacttgttgtcgaagttaaaaattgg
gctgataataaatttactagaaatatattatccatgcctgaaattcaaaactcaacaatt
aatcaaattattaatatcgttacaacaaaagtatcaaatttaccttcaaagaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
