Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0271520
Help
Entry
DDB_G0271520 CDS
T00245
Symbol
pks5
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
Methyltransf_12
Methyltransf_23
ADH_N
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_11
Thiolase_N
PP-binding
PKS_DH_N
HTH_51
Methyltransf_25
Methyltransf_31
adh_short
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8618014
NCBI-ProteinID:
XP_645557
dictyBase:
DDB_G0271520
UniProt:
Q86JI5
LinkDB
All DBs
Position
2:499181..506804
Genome browser
AA seq
2512 aa
AA seq
DB search
MDMKLNDIENENFINQMKGVAIVGIGFRIPSGNSENSISSPDDLFNNLKNGFDGVSSTSE
RWSDNYHKLGEISSPNAGLLPLNEWKSFDPLFFGINPSDAHHIDPQQRLLLKCTWEALED
ASIDPISIRGTNTSVFIGSSTIDYLHANKHPDLILKNAIGFSPSTLSNRISYCFDIHGPS
LSIDTACSSSMNAVTQGYHSILNGTSNMSIVGGVNFVIDVETIKGFSYLNMLSKTHGKCK
AFDESGDGFTRGECAGVVVLKKLDDAIRDGNRIYCIINGISSNIDGNGIADKANFYSPSK
QSQFNNINLAFKSTNGKISVNDIQYIEAHGTGTKTGDPIETEAISMAFKNRDKSTPILIG
SIKSNIGHCEAGSGVVSLIKCCLMFKYQCFLPNIHFKNPNPLIKFNEWNLKVVTSPIPFN
RNNEKSVSMMINNFGVTGSNCCLLISEFKKQDYESYENNIGSINKNILVPFSANSPKSLD
QYQSKIKNIINNQFNFIDFANNQIYSKSNYLYQRSVVIANNSNDLVNKILNKKHIQTKNP
IISNMSFKGKNPITIFVFSGQGSQYPKMALELYNNEVIFKKSIDLIDSKLSKYYGYSVLE
KLRSIGDDDTTSIHDPTIAQPAMCMFSVSLFELYKHWGVNPSFILGHSLGEIPTSYCSGM
IDLDTFCYTVYQRSIAQTKTHGNGRMLSINISDEEFKSMYSQKYPQIEIACYNSPQSIVV
AGNESILNEISKELKEKEIFTAMLGSLSSFHTSSQQCTKDSILQLNIESKKSKVPTFSTV
TTNLFNESDPFNSQYVYDNIINPVKFTQTISNIYKHIESNQLDNDIVFIEIAPHPTLSFY
IKQMVPSSLNESVSVYSALHKKKNDVEEFQQTISNLYCQNGYNINFKCQFNNKKSNQKIN
LPLYQWDDELYFAQTQVLEQHRKEGPPIDHLGLSNSYYSPFKNSYRTFIDIKNKPFQYLK
GHMVKGKYYFPGCGYIDNIIQLYKNQDIFISFIEFKTPLILIEGINQCLQTNIQQTGKSE
YRAQFHFKDQKSNEWIQSSNANFQLLDHTIEMPPKYNIEEIIKNKCTLARLTKNEIYTHI
KSKTGLNYTAMFQGATECYIGVDCTLSVVSIESQTNSFLNIPILDSVFHGNISLINDQCQ
IVFDKVHGLKYYSSNIPNDYKDKSVYVYAKLKSKTSDSYSASFTVLLSDGTVVYEIDEAF
SKSLIPIKELLKIEYPNDELFSINLQPKDSPIPAPSTFKSLIYENDRFNAEPPMVENLFQ
YISTIFYKNIINRCPEINIDIIKSLSIDEIISNFSKISKHERLFKYVFETIKENGILNSL
EEKDDTYFVFNEVLIKSSRVISKLLFPLENDNDNEDTPQLLFQNGLMDKVYKCRYLKNKN
QMIAHIIKHSIKEIINNNIIIRILEFGGGTASLSVEVIEEIVTLLQENPNYQVEIEYTWS
DISPAFIVDTKNKINKIIKGAGITNGLNVIYHPLTIDESLVELQSIKPSYYDFVIMSNVL
HVVKDIKQAVEQMYQLLIPNGQLLFVEPPYKSIICDSLFGSFEQWWAFTDTDIRKDHCCL
SQDGWYKLLKWSNFESIEMSTESKFMGSVIQAQKPSFTSLINQQPKYDNIIIFGNNCPNF
IDNIKPFSNFNEFIQIETIQEFDQLINKSTITNDSIIYFIKSINQLSLDNYKQATLEYIE
INQKLLQINSLCKHVLIVNDSRKTNYLASSIVGAARYFDEFQQLKLHTLDFDYDSTQNYL
ISKNNKMVQFINNLIDSKTNVHKEMIIINNKVYYEIVQKEKNLKLKYNSESFEQQDNLMC
SLSPNLEYQLQSKQIKLRDNQVEVKTIATGINNKDYLVYSGLEGSVNSNTPQFGYEFSGI
ITRVGNNVKDYKVGDNVFGLSNSCTSSNIIVNHERIQIKPSNISHIEAASIPIDYLTSFM
SLFNVGCLNIEDNESILIHLGSDSFGLSTFEILKWKGFKSNLFVTVNSDEIKQYLLNNYG
DLITAIYSNTDKGYVSQIKNKLIEQGSNDNGVDLILNTLPSDFMDSNFQLLAINGRIIDL
SNDHLNQSEYMKNVNFTLNRGYHNFDLMSQRNSRINRSLLTISKAIENGELKLIPIKEFS
NSDINDAIEFIIEENRIDKIVVSHDHEVYQELYAKFSNENDFSILKSNYQINSNNLGKNI
LITGQSGIILEILKWIIKYSNINTIENVIILSRSSLKWELELLINQTKLSNNNIKFHFKS
VDVGDSEQVDNAINEILNENQEIINIHSIFHFAFTQIACKVQEINMKHLDISHGAKTMGA
INLHNQSIKRNWKLINFVISSSIASLVGSTDQCSYVCANALLDSFSKYRVSLGLPSTSIN
LGAIESTGFVSKNESISVFLDGSGIIPTPINQVLGLLDLQIQNPGKFTNSMVAKFNPLNF
SNNEQINLLLKMDYIFNLHSNGYTKVKESAGSKNVDELFIKKISDLFSIDESKINKDIRL
IDYGADSLVIVQLKNWVDQEIGFNLITIQQLQNNTINVSIKIILNFLKKINK
NT seq
7539 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatgaaattaaatgatattgaaaatgaaaattttataaatcaaatgaaaggtgtt
gcaattgttggtattggatttagaatcccttctggtaatagtgaaaattcaattagttca
ccagatgatttatttaataatttaaagaatggttttgatggtgttagtagtacatcagaa
agatggagtgacaattaccacaagttgggtgaaattagtagtccaaatgcaggtttatta
ccattaaatgaatggaaatcattcgatccattattttttggtattaatccatccgatgct
catcatattgatcctcaacaaagattattattaaaatgtacatgggaagcattagaagat
gcatctatcgatccaatttcaattcgtggtacaaatacttcagttttcattggctcatca
actattgattatttacatgcaaataaacatccagatcttattttaaagaatgctattggt
ttttcaccaagtactttatcaaatagaatttcatactgcttcgatatccatggtccttca
ttatcaattgatacagcttgctcatcatcaatgaatgctgttactcaaggttatcactca
atattaaatggtacttccaatatgtctattgttggtggtgtaaattttgtaatagatgtt
gaaacaataaaaggtttttcatatttaaatatgttaagtaaaacacatggtaaatgtaaa
gcatttgatgaaagtggtgatggttttacacgtggtgaatgtgctggtgttgtagtttta
aagaaacttgatgatgctattagagatggtaatagaatttattgtataattaatggtata
agttcaaatattgatggtaatggaattgctgataaggccaacttttattcaccatcaaag
caatcacaatttaataatattaatttagcatttaaatcaaccaatggtaaaatttcagta
aatgacattcaatatatcgaagcacatggtaccggtactaaaacaggtgatccaattgaa
actgaagcaatttcaatggcttttaaaaatagagataaatcaacaccaattctaattggt
tcaattaaaagtaatattggtcattgtgaagctggttcaggtgttgtatcattaatcaaa
tgttgtttaatgtttaaatatcaatgctttttaccaaatattcatttcaaaaatccaaat
ccattaattaaattcaatgaatggaatttaaaagttgtaacatcaccaattccattcaac
agaaataatgaaaaatcagtttcaatgatgattaataactttggtgttactggttcaaat
tgttgtttacttatttcagagtttaaaaaacaagattatgaatcatatgaaaacaacatc
ggcagtattaataaaaatatattagtgccattctcagcaaattctccaaagtcattggac
caataccaatcaaaaatcaaaaatataattaataatcaattcaattttattgattttgca
aataaccaaatttattcaaaatcaaattatctttatcaaagatcagttgtaatagcaaat
aattcaaatgatcttgttaataaaattttaaataaaaaacatattcaaactaaaaatcca
atcatttcaaatatgtcattcaaaggaaagaatccaattacaatttttgttttttcaggt
caaggatcacaatatcctaaaatggctttagaattatataataatgaagtaatctttaaa
aaatcaattgatttaatcgattcaaaattatcaaaatactatggttattcagttttagaa
aaattaagatcgattggagatgatgatactacttccattcatgatccaactattgcacaa
ccagcaatgtgtatgttttcagtatcattatttgaattatataaacattggggagtaaat
ccttcatttattcttggtcatagtcttggtgaaatcccaacctcatattgttctggaatg
attgatttagatacattctgttatacagtttatcaaagatcaatagcacaaactaaaaca
catggtaatggtagaatgttatcaatcaatattagtgatgaagaatttaaatcaatgtat
tctcaaaagtatccacaaattgaaattgcgtgttataattcacctcaatcaattgttgtg
gcaggtaatgaatcaatattaaatgaaatttcaaaagaattaaaagaaaaagaaattttc
actgcaatgttaggttcattatcatcattccatacaagtagtcaacaatgtacaaaagat
agtatattacaactaaacattgaaagtaaaaaatcaaaagtaccaacattttcaacagtt
acaacaaatttattcaacgaatcagatccatttaattcacagtatgtttatgataatatt
attaatccagttaaattcacacaaacaatttcaaatatttataaacatatcgaatcaaat
caattagataatgatattgtattcattgaaattgcaccacatccaacattatcattttat
attaaacaaatggtaccatcaagtttaaatgaatcagtttcagtttattcagcacttcac
aagaaaaagaatgatgtcgaagagtttcaacaaaccatttcaaatttatattgtcaaaat
ggatataatattaattttaaatgtcaatttaataataaaaaatcaaatcaaaaaattaat
ttaccactttatcaatgggatgacgaattatatttcgctcaaactcaagtactcgaacaa
catagaaaagaaggaccaccaattgaccatcttggtctatcaaactcttattattcacca
tttaaaaattcatataggacatttattgatataaagaataaaccatttcaatatctaaaa
ggtcatatggttaaaggtaaatactacttcccaggttgtggttatattgataatattatt
cagctttataaaaatcaagatatttttattagttttattgaatttaaaacaccattaatt
ttaattgagggtatcaatcaatgtttacagacaaacattcaacaaactggtaaaagtgaa
tatcgtgcacaatttcatttcaaagatcaaaaatcaaatgaatggattcaatcatcaaat
gcaaatttccaattattagatcacactattgaaatgccaccaaagtataatattgaagaa
attattaaaaacaaatgtacgttggcaagattaacaaagaatgaaatttatactcacata
aaatcaaaaactggtttaaattatactgcaatgtttcaaggtgctactgaatgttatata
ggtgtagattgtacattatcagttgtatcaattgaatctcaaacaaattcatttttaaat
ataccaattttagattcagttttccatggtaacatttctttaataaatgatcaatgtcaa
attgtatttgataaagttcatgggttaaagtactattcatcaaatattccaaatgattat
aaagataaatcagtttatgtatatgcaaaattaaaatcaaagacaagtgattcatattca
gcttcatttactgtactattatcggatggtacagttgtatatgaaattgatgaagcattc
agtaaatctttaattccaattaaagaattacttaaaattgaatatccaaatgatgaatta
ttttcaattaatttacaaccaaaagattctccaattccagctccttcaactttcaaatcc
ctaatttatgaaaatgatcgtttcaatgctgaaccaccaatggtagagaatctctttcaa
tacatttcaacaatattttataaaaatattataaatagatgtccagaaattaatattgat
ataattaaatctttaagtattgatgaaattatttcaaatttcagtaaaatttcaaaacat
gaaagattatttaaatatgtttttgaaactataaaagagaatggtattcttaatagtttg
gaagaaaaagatgatacttactttgtatttaatgaagtacttatcaaatcatcaagagtt
atttcaaaattattattcccattagaaaatgataatgataatgaagatacacctcaatta
ttatttcaaaatggtttaatggataaagtttataaatgcagatatttaaaaaataagaat
caaatgattgcccatattattaaacattcaattaaagagattattaataataatattata
attagaattttagaatttggaggaggtactgcatcattatcagttgaagttattgaagaa
atcgttacattacttcaagagaatccaaattatcaagttgaaatcgaatatacatggagt
gatatttcgcctgcattcatagtagatacaaagaataaaatcaataaaatcattaaaggt
gctggtataacaaatggattaaatgttatttatcatccattaacaattgatgaatcattg
gtagaacttcaatcaatcaaaccatcatattatgattttgttataatgtcaaatgttctt
catgttgttaaagatattaaacaagctgtagaacaaatgtatcaattgttaataccaaat
ggtcaattactttttgttgaacccccttataaatcaataatatgtgatagtttatttggt
tcatttgaacaatggtgggcattcactgatactgatattagaaaagatcattgttgtctt
tctcaagatggttggtataaattattgaaatggtcaaactttgaaagtattgaaatgtca
actgaaagtaaattcatgggatcagttatccaagcacaaaaaccatcatttacatcatta
ataaatcaacaaccaaagtatgataatattattatttttggtaacaattgtccaaacttt
attgataatattaaaccattttcaaatttcaatgagttcattcaaattgaaactattcaa
gaatttgatcaactaattaacaaatcaacaattacaaatgattcaatcatttatttcata
aaatcaattaatcagttatctttggataattataaacaagcaactcttgaatatattgaa
atcaatcaaaaactattacaaattaatagtttatgtaaacatgtattaattgttaatgat
tcaagaaaaaccaactatttagcatcatcaattgttggtgctgcaagatactttgatgaa
ttccaacaattgaaattacatacattagattttgattatgattcaacccaaaattattta
atttcaaaaaataacaaaatggttcaattcattaataacttgatagactccaaaacaaat
gttcataaagaaatgattataattaataacaaagtatattatgaaatagttcaaaaagag
aaaaatctaaaattaaaatacaattcagaatctttcgaacaacaagataatttaatgtgt
tcattatcaccaaatttagaatatcaattacaatcaaaacaaattaaattaagagataat
caagttgaagttaaaacaattgcaactggtatcaataataaagattacttagtttatagt
ggtttagaaggtagtgttaattcaaatacaccacaatttggatatgaattttcaggtata
ataacaagagttggtaataatgtaaaagattataaagttggtgataatgtatttggttta
tcaaattcttgtacatcatccaatattattgtgaatcatgaaagaattcaaataaaacct
tcaaacataagtcatattgaagcagcatcaattccaattgattatttaacatcatttatg
agtttattcaatgttggttgtttaaatattgaagataatgaatcaattttaattcattta
ggtagtgatagttttgggttatcaacatttgaaatattaaaatggaaaggttttaaatca
aatttattcgttacagttaattcggatgaaattaaacaatatcttttaaataattatggt
gatttaataactgcaatttattcaaacacagataaaggttatgtaagtcaaattaaaaat
aaacttattgaacaaggctcaaatgataatggagtagatttaatattaaatacattacca
agtgattttatggattcaaatttccaattgttagcaattaatggtagaattatagattta
tcaaatgatcatttaaaccaaagtgaatatatgaaaaatgtaaactttactcttaatcgt
ggttatcataattttgatttaatgtcacaaagaaattcaagaatcaatagaagtttatta
accatttcaaaagcaattgaaaatggtgaattaaaattaattccaattaaagaattttca
aactctgatattaatgatgcaattgaatttattattgaagagaatagaattgataaaatt
gtagttagtcatgatcatgaagtttatcaagaactctatgctaaattttcaaatgaaaat
gatttttcaatattaaaatcaaattatcaaattaattcaaataatttaggtaaaaatata
ttaattaccggtcaatcaggtattattttagaaatattaaaatggatcattaaatattca
aatattaacacaatagaaaatgttattattctttcaagatcatcattaaaatgggaatta
gaattattaattaatcaaaccaaactatcaaataataatattaaattccatttcaagagt
gttgatgttggtgatagtgaacaagttgataatgcaatcaatgaaatattaaatgaaaat
caagaaattataaatattcattcaatattccattttgcatttacccaaattgcatgtaaa
gttcaagaaatcaatatgaaacatttagatatttcacacggagcaaaaacaatgggagca
attaatttacataatcaatcaattaaacgtaattggaaattaattaattttgtgatttcg
tcatcaattgcctctcttgttggttcaacagatcagtgttcatatgtttgtgcaaatgca
ttattagattcattttcaaaatatagagtatctcttggactaccatcaacatctattaat
cttggtgcaattgaatcaactggtttcgtttcaaagaatgaatcgatttcagtattttta
gatggcagtggtattattccaacaccaatcaatcaagttttaggccttttagatttacaa
attcaaaaccctggtaaatttacaaattcaatggttgctaaatttaatccattaaacttt
tcaaataatgaacaaattaatcttttattaaaaatggattacattttcaatttacattct
aatggatatactaaagtaaaggagagtgctggaagtaaaaatgttgatgaattgtttatt
aaaaaaatatcagatttattctcaattgatgaatctaaaataaataaggatattagatta
atcgattatggcgcagactcattagttatcgttcaattaaagaattgggttgaccaagaa
attggatttaatttaattacaattcaacaacttcaaaataatacaattaatgtttcaatt
aaaataattttaaattttttgaaaaagataaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
