Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0290469
Help
Entry
DDB_G0290469 CDS
T00245
Symbol
pks28
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_23
KAsynt_C_assoc
Methyltransf_11
PS-DH
PP-binding
PKS_DH_N
Methyltransf_25
Methyltransf_31
ADH_N
Thiolase_N
Methyltransf_16
GDP_Man_Dehyd
Anamorsin_N
AMOP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8627661
NCBI-ProteinID:
XP_001733033
dictyBase:
DDB_G0290469
UniProt:
B0G170
LinkDB
All DBs
Position
5:4095634..4104349
Genome browser
AA seq
2690 aa
AA seq
DB search
MEKYDIYYNSNEEYYGDVAVIGIGLRFPSGDLNESISKPNQLFNSLLNGLNGIVTTSERW
SDNYYLNGEINSVSAGLLPLDEWKRFDPIFFGINPSYDNVVTIDPQQRLLLKCVWEALED
SGIDPISLRGTNTSTFIGSSTTDYGSLQKSPFETQNNIFGSSNHSVANRIGYNFDFRGEN
FTIDSACSSSLNAINCGYNSIKSNKSNVSVVGGVNFILDPHVSKSFTQLNMLSPTGKCHS
FSSDADGFVRSEGVGIVILKKLKDAIKDSNNIYCVIKGSSSNVDGNYDKLNFYSPSKSSQ
YENMKLAIKSTNGQINESDIDYCEAHGTGTPTGDPIELEGISRLFDQNNNNKKQVLVGSI
KSNIGHTEACSGVASLIKCCIMFKNKLFLQNINFKESNPLINFKEWALKVVTEPITFNEN
KTTVMLINNFGVTGSNVCLILSEFKDKRYSNDESSSDNFCEQIDIDSKANEKKKFLIPLS
SNSSTSLDNYKSIIVNNNDDDSNSSTRSFQEFVYNQIKFKSTSLIQKSVIIASDWNEFQD
DDNQIKLKNSESLISNITVEKKKSPLTVIVFCGQGSQYNRMALSLYENEPIFRESVNRFD
KELFKYYGYSVLDRLRSVSDKDEISIHLPILAQPANIMIQISLYELYKHWGVSADIIVGH
SLGELSSSYSSGMIDFETLCHLIYHRSLAQNKTTGTGRALSVNISYDEFIERYQSKNNKY
ETLEIACYNSPTSIVIAGKEDLLNEISKEFKSNDIFCAMLGSLSSFHTSSQLMIKDEVCS
LVFKSKLPSVPVFSTVTTNLFNDQTPYNANYVWENIRQPVSFTQTISNLYKHIESNDMGN
EITFIEVAPHPTLQFYLNQMKSTQSSYFNNGKSVTIYSPLHKKKNDYNEFLKTISLLYVN
NNFNINFKSQLTNINNNNNNINNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKIIQFNINSLPLYQ
WDDNEYFKLNPFHEKITNEGPSIQNLGNGIDSACPTYQTFIDIKKPPFQWLKGHQVSDKF
YYPGMGYVQNLLSIYPNQDITISSLEFKSPLVLTEGNNQCLETTVSLLSKNEFNVKSHYK
DQKTNQWILSSLGNFSLFKHNSINSEKLINIQALKDKCNFTTISKHDFYESIKIKTNLTY
KGLFQGVKECSIGNNCSLAVVSLNEINNHTISNHSTIGRSLFNAATLDSCLHGSLIAVAQ
PVVLDRIEGFKLYSSNIPLSSSLSKDDNDNSNNSLIKELYIFTEEKARTNYQSFSASVKI
ILPNGRLLMEISRVVCSSVSLANPSNTIICKPPSNEIYTPYLQPKDSIINKPQQFKHLYS
VDEFIAKEEDNQIISTELLLSLFYKHINVRCPTINLESLTTLEYNQFKQLYYNNNGLVNE
NLFKFVFEILKSYSSSNHYILNHHNNSENKNKNNNNNNNSNNNENSNNESPIHFEKLYNL
YTKTTKIIAKQIFPLKDDSFTDTPQSLFENGFLDDFYKNSRVVQPLNNLLSEIIIEALKP
ILNQPIVFRILEAGGGTGSLSLLILEKICKLLNANPNSVIDIEFTWSDVSSSFSAEIKEK
FSPFTAHKNFNIIHRVLDLEKPLFDQDFKTSYYDLVVMSNVMHVVKKLKPTLDEIHNILT
PNGQLLFVEPPYKSINYDSVFCCFSQWWPSSDSDTELRPDRSCMNQDKWIKILNETNYRD
TIISGNDNLIFLIQTRKPSINEIISKQSSDSSLDQFNSFNNIILFGNNNYGCSLQNSISS
NQELKSKTININNFNEFQTWIANNYDNSDDFDNNKTLIIFLKSIEPINISNFKEITYEYI
QINQLILKLELTNNFKHLLISLDSTTDNYLSSSIIGAARYFVEYPQLDLYILNYDIISLK
ILNNNSSSSCNSSNGSISSCSCKQQQLSLINYLINTNNNIQKEFTINNNKVYYERYTRHS
NKIKCNLQSKSFETNKDNLLIQLDSNLEYQLYSKRVEPNSKEVEIEIKATGINYKDYLMH
IGMVSSDLDLKYGKEYEVENCIGIENPMIGNDFSGIITRLGSDAEKKKFKVGDHVCGVAS
KTSGSHVVIDYNFIYHQPLNYNHSISASIPSIYVTSLHSIYGVGNLKSNESILIHSAAGG
IGISSLDLLKCKKHQGHIFLTVGSKDKEDYLKKNYGSFITAIYSSRNKDYVNEIKNKLIE
LGEVKQQGVDLILNTLSSEFMDSNFQCLNMSGRIVDLSVTHLTPNDYIANNHFKYNMGYN
NVEMIDFNGKMVRSYLKKIIKMINSNKLELSIPIIEYSNNQFKDAIEYINQRKHIGKIIV
NHNQDEFNRVYNNYQQNNNNNNQIIMKHSYDISKLNMGKNILLTGQTGIILEIMKYLIRY
SNHSIQNIIILSKSKLKWELELLINQTKFIKDNIIKFHFIQIDIEDSNKVNQVLNQLELN
ENITNIDSIIHFAFNNDIGDVQDVNMNRLNIAHGAKTIGAINLHNESINRSWKIKQFIIA
SSVSSIFGSDQQCCYVSACSVIDSLSKYRHSLGLPSLAINLGTVASTGFISRNNAIETMF
KSSFLKLFSPQLVISSLDLFIQNQRQYPNYSLVDFNFEVMLTSPNYHLYKLDYEINIFKK
SYQINTNSSSGSGSDNEFIHSTILNKISELLSIDESKINEDLQLTQYGMDSLVIVQLKNF
IDNQLGHNLITIHQLQHNKINQSIDIIKFGYLINKNKFKYKNNNKNNNNG
NT seq
8073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaatatgatatttactataacagtaacgaggaatattacggtgatgttgcagtt
attggcataggtttgagatttccaagtggtgatttaaatgaatcaatttcaaaaccaaat
caattatttaattcattattaaatggattaaatggaattgttactacttctgaaagatgg
tctgataattattatttaaatggtgaaattaattcagtttccgctggtttattacctctt
gatgaatggaaacgatttgatccaatattctttggaattaatccaagttatgataatgtt
gttacaattgatcctcaacaaagattattattaaaatgtgtatgggaagcattagaagat
agtggtattgatccgattagtttacgtggtacaaatacaagtacatttattggtagcagt
actactgattatggtagtcttcaaaaatcaccatttgaaactcaaaataatatctttggt
tcttcaaatcattcagttgcgaatagaatcggttataactttgactttagaggtgagaat
tttacaattgattcagcttgctccagttctttaaatgcaattaattgtggatacaattca
atcaaatcaaataaatcaaatgtatcagttgttggtggtgttaattttatattagaccca
catgtttcaaaatcattcacacaattgaatatgttaagtccaactggtaaatgtcattct
ttttcatcggatgctgatggttttgttcgttcagaaggtgttggaatagtcatattaaag
aaactaaaagatgcaattaaagattcaaataatatctattgtgtaatcaaaggttcaagt
tcaaatgtggacggaaactatgataaattaaacttttattcaccatcaaaatcatctcaa
tatgaaaatatgaaattagcaatcaaatcaaccaatggtcaaatcaatgaatctgatatt
gattattgtgaagctcatggtactggtactccaactggtgatccaattgaattagaaggt
atttcaagacttttcgatcaaaataacaataacaagaaacaagttttagttggctcaatc
aaatcaaacattggacacactgaagcatgttctggagttgcatcattaattaaatgttgt
ataatgtttaagaataaactatttcttcaaaatattaatttcaaagaatcaaatccatta
ataaatttcaaagaatgggcattaaaagtcgtaactgaaccaattaccttcaatgaaaat
aaaaccactgtcatgttaattaataattttggtgttactggttcaaatgtttgtttaata
ttatcagaatttaaagataaacgttatagtaatgatgaaagcagtagtgataatttttgt
gagcaaattgatattgatagtaaagcaaatgaaaaaaagaaatttttaataccactctca
agtaattcatcaacatcattagataattataaatccataatagtcaataataatgatgat
gattcgaattcatcaacaagaagttttcaagaatttgtttataatcaaatcaaattcaaa
tcaacatcattaattcaaaaatcagttataattgcaagtgattggaatgaatttcaagat
gatgataatcaaataaagttgaaaaatagtgaaagtttaatttcaaatattactgttgaa
aaaaagaaatcaccactcacagtaatagtattttgtggccaaggttcacaatataataga
atggcattatcactatacgagaatgaaccaatattcagagaatcagtgaatagattcgat
aaagagttattcaagtattatggttattcagttttagatagattaagatcagtcagtgat
aaagatgaaatatcaatccatctaccaattttagcacaaccagcaaatataatgattcaa
atatcactctatgaactatataaacattggggtgtttcagcagatatcatcgttggtcat
tctcttggtgaattatcatcatcctattcatcaggtatgatcgattttgaaacattgtgt
cacttaatctatcatagatcattggctcaaaacaaaactacaggtacaggtagagcgctt
tcagtcaatattagctatgatgaatttattgagagatatcaatccaaaaacaataaatac
gaaacacttgaaattgcatgttacaattcaccaacatcaatcgttattgcaggtaaagaa
gatctattaaatgaaatttcaaaagaatttaaatcaaatgatatcttttgtgcaatgtta
ggatcattatcatcatttcacacatcaagtcaacttatgataaaagatgaagtatgctca
ttggtatttaaatcaaaactaccatcagtaccagtattttcaacagttacaaccaattta
ttcaatgatcaaacaccatataatgccaattatgtatgggagaatattcgccaaccagta
tcattcacacagaccatcagcaatctttacaaacatatcgagtctaatgatatgggtaat
gaaattacattcattgaagttgcaccacatccaacattacaattttacttgaatcaaatg
aaatcaactcaatcaagttactttaataatggcaaaagcgttacaatctattcaccatta
cataaaaagaagaatgattataatgaatttttaaagacaatctctttattatatgttaat
aataattttaacattaattttaaatcacaattaactaacatcaataataataataataat
attaataataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataacaaaataatccaatttaatattaatagcttgccactttatcaa
tgggatgataatgaatactttaaattaaatccatttcatgaaaagattacaaatgaaggc
ccatccattcaaaaccttggtaatggtattgattcagcatgtccaacatatcaaacattt
attgatatcaagaaaccaccatttcaatggttaaaaggtcatcaagtcagtgataaattt
tactatcctggaatgggttatgttcaaaatctattatcaatttatccaaatcaagatata
acaattagctcattagaatttaaatcaccattagtattaacagaaggtaataatcaatgt
ttagaaactacagtttctctcctctcaaagaatgaattcaacgttaaaagtcattacaaa
gatcaaaaaacaaatcaatggatattatcatcacttggtaattttagtttattcaaacat
aacagtatcaatagtgaaaaattaattaacattcaagcattaaaagataaatgtaatttt
acgacaatatcaaaacatgatttttatgaatccattaaaatcaaaacaaatttaacatat
aaaggtttatttcaaggtgtaaaagaatgctcaattggtaataattgttcactcgctgta
gtatcattaaatgaaatcaataatcatacaattagtaatcatagtactattggtcgttca
ttatttaatgctgcaactttagattcttgtttacatggttcattaattgcagttgcacaa
ccagttgtactcgatagaattgaaggtttcaaattatactcttcaaatattccattatca
tcatctttgagcaaagatgacaatgataatagtaataatagtttaattaaagaattatat
atttttactgaagaaaaagcaagaactaattatcaatcgttttcagcatcagttaaaatc
attcttccaaatggtagattattaatggagatctcaagggtggtttgttcatcagtttca
cttgcaaatccaagcaatactataatttgtaaaccaccttcaaatgaaatttatacacca
tatcttcaaccaaaagattcaatcatcaacaaacctcaacaattcaaacatttatatagt
gtagatgaatttattgccaaagaagaagataatcaaatcatttcaactgaattgttatta
tcattattttataaacatatcaacgttagatgtccaactataaatttagaatcattaaca
acattagaatataatcaatttaaacaactatattataacaacaatggtttagtaaatgaa
aatcttttcaaattcgtttttgaaatcttaaagagttatagtagtagtaatcattatatt
cttaatcatcataacaacagtgaaaacaaaaacaaaaacaacaacaacaacaacaacagc
aacaacaatgaaaatagtaataatgaatcaccaatacattttgaaaaattatacaacttg
tatactaaaacaactaaaataatagcaaaacaaatattcccattaaaagatgattcattt
acagatacaccacaatcattattcgaaaatggatttttagatgatttttataagaattca
agagtagttcaaccattaaataacttattaagtgaaattataattgaagcactcaaacca
attttaaatcaaccaattgtatttcgtatattagaagcaggtggtggtactggtagtctt
agtttattaattttagaaaagatttgtaaacttttaaatgcaaatccaaactcagtcatt
gatatcgaattcacatggagtgatgtatcatcttcattttcagcagagattaaagagaag
ttttcaccatttacagctcacaaaaatttcaatattatccaccgtgtattagatttagag
aaaccattatttgatcaagactttaaaacatcctattatgatctcgttgtaatgtcaaat
gtaatgcatgtcgttaagaaacttaaaccaacattggatgaaattcataatatattgaca
ccaaatggtcaactgctatttgttgaaccaccttataaatcaattaattatgattcagtt
ttttgttgcttttcacaatggtggccatcttctgatagtgataccgagttaagacctgat
agaagttgtatgaatcaagataaatggattaaaattttaaatgaaacaaactatagagat
acaattatatctggtaatgacaatttaatatttttaattcaaacaagaaaaccatcaatt
aatgaaatcatttcaaagcaatcatcagattcatcattggatcaatttaattctttcaat
aatatcattttatttggtaataataattatggttgtagccttcaaaattcaatatcatca
aatcaagaattaaaaagtaaaacgattaatattaataattttaatgaatttcaaacatgg
attgcaaataattatgataatagtgatgattttgacaataataaaacattaataatattt
ttaaagtcaattgaaccaattaatatttcaaatttcaaagaaataacctatgaatatatt
caaatcaatcaattaatattaaagttagaattaacaaataatttcaaacatttattaata
tcattggattcaacaactgataattatttatcatcatcaattattggtgcagcacgttat
ttcgttgagtatccacaattagatttatatattttaaactatgacataatttctttgaaa
attttaaataataatagcagtagcagttgtaatagtagtaatggtagtattagtagttgt
agttgcaagcaacaacaattatcattaatcaactatttaatcaatacaaataataatatt
caaaaagaatttacaattaataataataaagtatactatgaaagatatactagacattca
aataaaattaaatgtaatttacaatcaaaatcatttgaaacaaataaagataatttattg
attcaattagattcaaatttagaatatcaattatatagtaaaagagttgaaccaaactca
aaagaagtagagatcgaaattaaagcaacaggtataaactataaagattatttaatgcat
attggtatggttagcagtgatttagatttaaagtatggtaaagaatatgaagttgaaaat
tgtattggtattgaaaatcctatgattggtaacgattttagtggtattattacaagatta
ggtagtgatgcagaaaaaaagaaatttaaagtgggtgatcatgtttgtggtgtcgcatca
aaaacaagtggttctcatgtggtcatagattataattttatttatcatcaacctttaaat
tataatcattcaatttcagcatcaattccatcgatatacgttacatcattacatagtatc
tatggtgttggtaatttaaaatcaaatgaatccattttaattcactcagcagcaggtggt
attggtatttcatctttagatttattaaaatgcaaaaaacatcaaggtcatatattttta
acagttggttcaaaagataaagaagattatttaaaaaagaactatggatcatttattact
gctatctattcatctcgtaataaagactatgtcaatgaaataaagaataaattaattgaa
ttaggagaagtcaaacaacaaggtgtagatttaatattaaacacactatcatcagaattt
atggattcaaatttccaatgtttaaatatgtcaggacgtatcgttgatttaagtgttact
catctcacaccaaatgactatattgccaataatcatttcaaatataatatgggttacaat
aatgttgaaatgattgatttcaatggtaaaatggtcagaagttatttaaagaaaattatc
aaaatgatcaattcaaacaaattagagttaagtataccaatcattgaatattcaaataat
cagttcaaagatgcaatcgaatatattaatcaaagaaaacatatcggtaaaattatcgta
aatcataatcaagatgagtttaatagagtttataataattatcaacaaaacaataataat
aataatcaaattataatgaaacattcatatgatatatcaaaattaaatatgggcaaaaat
attttactcactggtcaaactggtatcattttagaaataatgaaatacttgattagatat
tcaaatcactcaattcagaatattataatactttcaaaatcaaaattaaaatgggaatta
gagttattaattaatcaaactaaatttatcaaagataatatcattaaattccattttatt
caaatcgatattgaagattcaaataaagtcaatcaagtattgaatcaattagaactaaat
gagaatattacgaatatcgattcaatcattcattttgcatttaataatgatattggtgat
gttcaagatgttaatatgaatcgtttaaatattgctcatggtgcaaaaacaattggagcc
attaatcttcacaatgaatcaattaatcgttcatggaaaattaaacaatttataattgca
tcttcagtgtcatcaatatttggttcagatcaacaatgttgttatgttagtgcttgtagc
gttatagattcattatcaaagtatagacattcacttggattaccatctttagcaattaat
ttaggtactgtagcttcaactggatttatatcacgtaataatgcaattgaaaccatgttt
aaaagttcattcttaaaattattctcaccacaactcgttattagttcattagatttattc
attcaaaatcaacgtcaatatccaaattatagtttagtagatttcaattttgaagttatg
ttaacttcaccaaattaccatctttataaacttgattatgaaattaatattttcaaaaaa
tcatatcaaatcaataccaattccagtagtggtagtggtagtgataatgaattcattcat
tcaacaattttaaacaaaatcagtgaattactatcaattgacgaatctaaaattaatgaa
gatttacaacttacacaatatggtatggacagtttagtaatagtacaattaaagaatttt
atcgataatcaattaggtcataatctcattacaattcatcaactacaacataataaaatc
aatcaatcaattgatattattaaatttggttatctaattaataaaaacaaattcaaatac
aaaaataataataaaaataataataatggataa
DBGET
integrated database retrieval system
