Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0288457
Help
Entry
DDB_G0288457 CDS
T00245
Symbol
pks26
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
Methyltransf_12
Methyltransf_11
PS-DH
Methyltransf_23
ADH_zinc_N
ADH_N
ADH_zinc_N_2
Thiolase_N
PKS_DH_N
PP-binding
Methyltransf_31
Methyltransf_28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8626635
NCBI-ProteinID:
XP_636757
dictyBase:
DDB_G0288457
UniProt:
Q54IX3
LinkDB
All DBs
Position
5:1543867..1551579
Genome browser
AA seq
2531 aa
AA seq
DB search
METNNNKNIQEDIAIIGFRIPGCQDNTPSELWNNLMNKFSGVGKTTERWSDNYHLSGDIN
NGNSGLLPLKEWKKFDPAFFGINPTMVSTIDPQQRILLKCTWEALEDAGIDPIKLRGSNT
SIFIGCSTGDYLDMVKSNNEIQTNLFGSVNHSLSNRISYCFDFHGASMTIDSACSSSLNT
VLLGCQSINQGKSNLCIAGGVNFILDTTIPTAFSFLNILSKNGKCMTYDEGADGFVRGEG
AGLVVLKSLKDAIKDGNNIYCIIKGGNTNVDGNGNADKANFFQPSKQSQSDNIKLALESI
KKKSMLDIDIDYVETHGTGTPTGDPIEVEGISKVFKENHSPENPLLIGSLKSNIGHMEAA
SGVTSLIKCCLMFKNKSFAPNVNFQKINPKIKLDEWNIKVVTEAIPFKKNKITSMVVNSF
GVTGSNCCLVLTESINNNNNSNVDKITKNEKEYLIPFSANSNQSLKNYIEEVSKIDESLQ
FEDFVYKQLSNKSTSLFQRFVVTSKDWKELKYKLSQPLPLKEISSSISVKKPNPITVFVF
CGQGSQFNKMGLELYNNDKNFRNYIDRFDKKLLEYYGYSVISKLRSIDDNDLITIHDPII
AQPATAILQISLFELYKHWGINPSFIVGHSLGELPMAFCSGMIDFDTVCYLLYHRSLAQS
KTNGCGKMLSCNISSEEFVKNYSPRYPFLEIACYNSPNSIVVAGKESILLELSKEFKNSG
IFCAMLGSLSSFHTSSQLEVKDHIYSLKFESKEPVIPTFSTVTTHLFNSNKLYDNDYIFQ
NIMKPVLFNETISNLYKHVENNQLGSEMIFIELAPHQTLSFYLKQLIPKDSNYFSNSNSI
TILSPLHKKKNDYLEIQQTISTCYCKGYDVNFKSQILIESKTNISNKSLPLYQWDDKEFW
KDLEKQKRILQGPPMDTLGFSNEKSPILKSFETKIDIKKKPFQYLKGHIVKGKIYFPGVG
YIENLLKMYPSQDIDIDSMEFEAPLILIEGIVTCLQSNVYKIGKNEFKVQFHFQDQKTKQ
WIQSSFANYHLSHRDDFDPTTNKLNIQNLISNNCNLTKLSKNQFYNFIKAKAGLSYNGEF
QGVEKCYLGDNCSLVEIPFDTSNQDVETNINMIPILDSCLHGVHILYVEQCQMVLEKIEG
LKYYSSTLILSKQKEQQKLYVFTRIENKDLINNSISASIIVMISDGTVFFEIESVSLKSL
IPLKDPISIENPTDELFSSYLQSIDSLISEPSSYKSIYKRNEFISSGMSDLSRSDYQQFI
STLLYTNLIKRNQSIESDLRNQIEFEEIKAKYCKNSKFERLFTFVIETIKQYDGINGNLN
SWNEGNIDIYKILIKSTRIISKLLFPLQGEDTTIDTPQSLFENNLLDDFYNINGNTVIQN
QLVGEIITQSIKPLINEKMVFRILEFGGGVGSLSIVTLNKINQLLEQHPNFQIDIEYTWT
DISPSFIPDAKKLLSNIKGVTIIYRSLDLEESLIEKQLLKPSYYDFVIMSNVLHVIKEIK
FGIDEIYKVLSPNGQLLFIETPYRMLICDSIFGVFDQWWGFTDTGIRVDRCCMKQKTWFK
LLSESNYQDIIMSDDIKDCCFVIQAKKPSISSLEYKLKIDSQENDKIIVFGENDTFMKYL
ENKSTKQIIKIKTCQQFSDLITSNSKEINNQSIIYFIKTLNQLLIENFKEITLEYIQINQ
LLLSSGLSCKHILLLNQSTSENYLGSSISGAARYFDEFPPLKLYSFDFDKYSLNNESINI
IDDIIEPIIKSMNNSNIRKELLVRNNKIFFERYKQEKRIKENYKSTSFENDKSLFVHLNA
NLEYELKSKQVKLKQNEIEVNVKATGINYKDYLVYTAMTPSELINHKGESNPEFGHDFSG
IITRIGDDDGDNDNEFKVGDQVYGIWFNTTASHIIVDKEFLCHKPSKLSHTIASSIPVVY
ITSLYSLYNIGNIQNDESILIHSASGGIGLSALNILKWKNHKSHIFVTVGSKEKEKYIHD
TYGDFITGIYSSRNKDYLKLIKRKLTELGSNKKGVDIILNTLSSSEHMVSNFKCLNHRGR
IIDLSITHLNHNEYTCNNNFKYNYGYHNVEVLFVKGDIISKLLKNITSAIENGSLSTGIP
IIEFNDSDCFNAIEFINKRQHIGKIVVNHNKENLIQELIKKTNLPIIKSNYQINSDHLGK
NILVTGQSGIILEILKWIVKYSTNVENIIILSRSSLKWELELLVNKNKNKLNFIYKSVDV
GNSLEIEKVIDEILMENPQINNVDSIFHYAFTQISCKEHEIDQVHLNVSHQAKTMGAINL
HNQSIKRNWKLINFIMASSAAGLIGSTDQCSYVCSSNVLDTFSKYRKHVLGLPSICINYG
LIESTGFVSRNQSVAVMLDGQGIRPMQTNQILGSLDLFIQNPSKSTNIILTSFNFNEFAT
GNLQQSNVHKFDFQFNCCLSQKSKLMANNQASENPVKDLLINNICELLSIDESKLNIDIR
LIDYGSDSLTIVQIKNLIDKNLLIPNLISIQMLQNNSISDNIKILTDSYNKKKQNEQNEL
KNIKVGSFTKK
NT seq
7596 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaacaaataataataagaatattcaagaagatattgctataattggttttagaatc
ccaggatgtcaagataataccccatcagagttgtggaataatttaatgaataaatttagt
ggtgttggtaaaactactgaaagatggagtgacaattatcatttatctggtgatattaat
aatggaaattccggtttattaccattgaaagagtggaagaaattcgatcctgcttttttt
ggtattaatcctaccatggtttccacaattgatccacaacaacgtattctattaaagtgt
acatgggaagcattggaagatgctggaattgatccaattaaattacgtggttcaaatact
tcaattttcattggttgttcaactggtgattatctagacatggttaagagtaacaatgaa
atccagacaaatctatttggttcagttaatcattcattatctaatagaatttcttattgt
tttgatttccatggtgcttcaatgactattgattctgcatgttcttcttcattaaacaca
gttttattaggctgtcaatcaattaatcaagggaaatctaatttatgtatagctggtggt
gtaaattttattttagataccactattccaactgcattttcatttttaaatatattaagt
aaaaatggaaaatgtatgacatatgatgaaggtgctgatggatttgtaagaggagaggga
gcaggtttggttgttttaaagagtttaaaagatgcaattaaagatggaaataatatttat
tgtataattaaaggtggaaatacaaatgttgatggtaatggaaatgctgataaagcaaac
ttctttcaaccatccaaacaatcgcagtcagataatattaaattagcattggaatctatt
aaaaagaaaagtatgcttgatatcgatattgactatgttgaaactcatggtacaggtaca
cccactggtgatccaattgaagttgaaggtatatcaaaggtttttaaagaaaatcattca
cctgaaaatccattattaataggttcccttaaatcaaatattggtcacatggaagcagca
tccggtgttacttcattaataaaatgttgcctaatgttcaaaaataaatcttttgcacca
aatgtaaattttcaaaagattaatccaaaaatcaaattagatgaatggaatattaaagtt
gtaactgaggcaattccatttaaaaaaaataaaataacatcaatggttgtaaatagtttt
ggtgtaactggttcaaattgttgtttagttttaacagagtctattaataataataataat
agtaatgttgataaaataacaaagaatgaaaaagaatatttaatcccattttcagcaaat
tctaatcaatcattaaagaattatatagaggaagtttctaaaattgatgaatctttacaa
tttgaagattttgtttataaacagttatcaaataaatcaacatctttatttcaacgtttt
gtagtgacatcaaaggattggaaagaattaaaatataaattgtctcaacctttaccttta
aaagagatttcttctagtatttcagttaaaaaacctaatccaattactgtttttgtattt
tgtggtcaaggttcacagtttaataaaatggggttagaattatataataatgataagaat
ttcagaaattatatcgatagatttgataagaaattgttggaatactatggttattcagta
atatcaaagttaagatcaattgatgataacgatttaattacaattcatgatccaataatt
gcacaacctgcaacagcaattttacaaatttcattattcgaactttataaacattggggt
attaatccatcatttatagttggtcatagtctaggtgaattaccaatggccttttgttca
ggtatgatagattttgatacggtttgctatttactttatcatagatctttagctcaatca
aaaaccaatggatgtggtaaaatgttatcttgtaatattagtagtgaagagtttgttaaa
aactattcacctcgttatccatttttagaaattgcttgttataattcgccaaactcaatt
gtagtggctggtaaagaatcaatcctattagaactatcaaaagaatttaaaaattctggt
atattttgcgcaatgttaggttcattatcatcattccatacaagtagtcaattagaagta
aaagatcatatctactctttaaaatttgaatcaaaggaaccagtaataccaacattttca
acagtaacaactcatttattcaattcaaataaactatatgataatgattatatttttcaa
aacattatgaaacctgtattatttaatgaaacaatttcaaatctttataaacatgtagaa
aataatcaacttggtagtgagatgattttcattgaattggcacctcatcaaactttatca
ttttatttgaaacaattaataccaaaagattcaaattatttcagtaatagtaactcaatt
acaattttatcccctcttcataaaaagaaaaatgattatttagaaattcaacaaacaatt
tcaacttgttattgtaaaggttatgatgttaattttaaatcacagatcctcatagaatct
aaaacaaatatatcgaataaatctttaccactttatcaatgggatgataaagagttttgg
aaagatttagaaaaacaaaaaagaatattacaaggtccaccgatggatacattgggtttt
tcaaatgaaaaatcaccaattttaaaatcatttgaaaccaaaattgatataaagaaaaaa
ccattccaatatttaaaaggtcatattgtaaaaggtaaaatttatttcccaggtgttggt
tacatagagaatttattgaagatgtatccttcacaagatattgatatagattccatggaa
tttgaagcacctttaattttaattgaaggtatcgttacatgtttacaatcaaacgtttat
aaaataggaaagaatgaattcaaagtacaatttcatttccaagatcaaaaaacaaaacaa
tggattcaatcttcatttgccaattatcatttatctcatagagatgactttgatccaact
accaataaattaaacattcaaaatttaatttcaaataattgtaatttaaccaaattatca
aagaatcaattttataatttcataaaggcaaaagcaggtttatcttataatggagaattt
caaggtgttgaaaaatgttatttaggtgataattgttcattggttgaaattccatttgac
acaagtaatcaagatgttgaaaccaatattaacatgattccaattttagattcatgttta
catggagttcatattctttatgttgaacaatgtcaaatggttttagaaaagattgaagga
ttaaaatactattcatcaacactcatattatcaaaacaaaaagaacaacagaaattatat
gttttcacaagaattgaaaataaagatttaataaacaattcaatttcagcatcaattatt
gttatgattagcgatggtacagtattttttgaaattgaatcagtatctctaaaatcttta
attcctttaaaagatccaatatcaattgaaaatccaactgatgaattattttcttcttac
cttcaatcaattgattctctaatttctgaaccatcatcatataaatcgatttataaaaga
aatgaatttatttcaagtggaatgagtgatttatcaagatcagattatcaacaatttatt
tcaactttattatatacaaatttaattaaaagaaatcaatcaattgaaagtgatttaaga
aaccaaattgaatttgaagaaattaaagcaaaatattgcaaaaattcaaaatttgaaaga
ttatttacatttgttattgaaaccattaaacaatatgatggtataaatggtaatcttaat
agttggaatgaaggtaatattgatatttataaaattttaataaaatcaacaagaatcatt
tcaaaattattattcccattacaaggtgaagatacaacaattgatacacctcaatcttta
tttgaaaataatcttttagatgacttttataatattaatggtaacacagttattcaaaat
caattggttggtgaaatcattacacaatctataaaaccattaattaatgaaaagatggta
tttagaatattagaatttggaggtggtgttggatctttatcaatcgtaacattgaataaa
ataaaccaattacttgagcaacatccaaactttcaaattgatatagaatatacatggaca
gatatctcaccttcattcattccagatgctaaaaaacttctttcaaacataaaaggtgtt
actattatttatagatcattggatctagaagaatcattgattgaaaagcaattattaaaa
ccatcctattatgattttgtaataatgtcaaatgtacttcacgttattaaagaaattaaa
tttggtattgatgagatctataaagtattatcgccaaatggtcaattattgttcattgaa
actccttatagaatgttaatatgtgatagtatttttggtgtattcgatcaatggtggggc
ttcacagatactggaattagagttgacagatgttgtatgaaacaaaaaacttggtttaaa
ttactatcagaaagtaattatcaagatattataatgtcggatgatataaaagattgttgt
tttgtaattcaagctaaaaaaccatcaatttcatcattagaatataaacttaaaattgat
agtcaagaaaatgataaaataattgtttttggtgaaaatgatacttttatgaaatactta
gagaataaatcaacaaaacaaattataaaaattaaaacatgccaacaatttagtgatttg
attactagtaattcaaaagaaataaataatcaatcaattatttatttcattaaaacatta
aatcaacttttaattgaaaactttaaagagataaccttggaatatattcaaataaatcaa
ttactattatcatctggtttatcatgcaaacatattttacttttaaatcaatccacaagt
gaaaattatttaggttcatcaatttcaggtgcagcaagatattttgatgaattcccacca
ttaaaactgtattcatttgattttgataaatactctttaaataatgaatcgatcaatatt
attgatgatattattgaaccaattatcaaatctatgaataattcaaatatcagaaaagaa
ttattagttagaaataataaaattttctttgaaagatataaacaagaaaaaagaattaag
gaaaattataaatcaacatcattcgaaaatgataaatcattatttgttcatttaaatgca
aatctggaatatgaattaaaatctaaacaagtcaaattaaaacaaaatgaaattgaagtt
aatgtaaaagcaactggaattaattataaagattatttagtttatactgctatgacacca
agtgaattaataaatcataaaggtgaatcaaatccagaatttggccacgatttttcaggt
attataactcgtattggagatgatgatggtgataatgataatgaatttaaagttggtgat
caagtttatggtatttggttcaatactactgcaagtcatattatagttgataaagaattc
ctttgtcataaaccaagtaaacttagtcataccattgcatcttcaataccagttgtttat
attacatcattatatagtttatacaatataggtaatattcaaaatgatgaatctatatta
attcattcagcatcaggtggaattggtttatcagcattaaatatattaaaatggaagaat
cacaaatctcatattttcgttacagttggttcaaaagaaaaagaaaaatatattcatgat
acttatggtgattttattacaggaatttattcaagtagaaataaagattatttaaaactt
attaaaagaaagttaacagaattaggatcaaataaaaagggagtagatattatattgaat
actttatcaagtagtgaacatatggtatcaaatttcaaatgtttgaatcatagaggtaga
atcattgatttatcaataactcatttaaaccataatgaatatacttgtaataataatttc
aaatacaactatggttatcataatgttgaagttttatttgttaaaggggatataatttca
aaactattgaaaaatattacctcagcaattgaaaatggatcattatccactggaattcca
atcattgaattcaatgattcagattgttttaatgctattgaatttattaataaacgtcaa
catattggtaagattgttgttaaccataataaagaaaatttaattcaagaattaattaaa
aaaacgaatttaccaattatcaaatcaaattatcaaatcaatagtgatcatctaggtaaa
aatatattggttactggtcaatctggtattatattggaaattttgaaatggatagttaaa
tattcaacaaatgttgaaaacataattatcctatcaagatcatcattgaaatgggaattg
gaattattagtaaacaaaaataaaaacaaattgaatttcatttacaaaagcgttgatgtt
ggtaattcattggaaattgaaaaagtaattgatgaaattttaatggaaaaccctcaaatc
aataatgtagattcaatctttcattatgcttttactcaaatctcttgtaaagaacatgaa
attgatcaagtacatttaaatgtatcacatcaagcaaaaaccatgggtgcaattaattta
cataaccaatcaattaaaagaaattggaaattaataaactttataatggcatcatcagca
gcgggtcttattggatcaactgatcaatgttcatatgtttgttcaagtaatgttttagat
acattttcaaaatatcgtaaacatgtattaggattaccttcaatttgtataaactatggt
ttaattgaatccactggttttgtatctcgtaatcaatcagttgcagtgatgttggatggt
caaggtattagaccaatgcaaacaaatcaaattttaggatcattagatttatttattcaa
aatccttcaaaatctaccaatataattttaaccagtttcaattttaatgaatttgcaaca
ggtaatctccaacaatcaaatgttcataaatttgatttccagtttaattgttgtttatca
caaaaatcaaaattaatggcaaacaaccaagcaagtgaaaatcctgttaaagatttatta
atcaataatatatgtgaattattatcaattgatgagtcaaaattaaacattgatattaga
ttaattgattatggttcagattcattaacaattgttcaaattaaaaatttaattgataaa
aatctattaataccaaatttaatttcaattcaaatgttacaaaataactcaatctctgac
aatataaaaattttaacagattcctacaacaaaaagaaacaaaatgaacaaaatgaatta
aaaaatataaaagttggttcatttactaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system