Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0281475
Help
Entry
DDB_G0281475 CDS
T00245
Symbol
pks18
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
KAsynt_C_assoc
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_23
PS-DH
Methyltransf_12
Methyltransf_11
Thiolase_N
ADH_N
Epimerase
PKS_DH_N
Anamorsin_N
Methyltransf_31
Methyltransf_2
Methyltransf_25
PP-binding
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8623087
NCBI-ProteinID:
XP_640701
dictyBase:
DDB_G0281475
UniProt:
Q54TW0
LinkDB
All DBs
Position
3:4556537..4565616
Genome browser
AA seq
2999 aa
AA seq
DB search
MGFKVNKNLNETNDNSDNDVAIIGIGFRLPSGNLNKSNDSPIILWDNLMKGFDGMVETSE
RWSDNFNQLGEISNKSGGLLPLDEWKSFDPLFFGINPSEAQTIDPQQRILLKCTWEAIED
SNIDPIKIRGSKTSVYMGGTSVEYKELNKNSNEINPNIFGSTFNTIANRISYCFDLSGES
MTLDTACSSSLNAIILGYQSIKSGTSNLSIVGGVNLILDSNLSKSYSYLNMLSKKEGKCM
SFDSRADGFVRSEGAGVFILKSLKQSIIDGNNIYCVIKGASSNIDGNGLNDKQNFYSPSS
SSQAENINRALSSTKGSVKIDDIVYVEAHGTGTPTGDPIELEAISRVFKTNNNDNNNQQH
QNPILIGSFKSSVGHLESASGSASLVKCCLMFKNQYLTPNVNFKTPNPSIKFDEWNLKVV
TEPIQFKDVKKSNNFSMILNNFGITGSNCCLILSQYNGNHNDEQENQQQQQQQGKQYLIP
FSANSIQSLKQYESLINENQFKESNDFKEFVKHQIYSKSISLYQRSVSIASNWNDFNEGM
KSTNNNNNKTQTSNSKSSNISIIPKNPITVMVFAGQGSQYSTMAMELYNNEPIFKESMDR
LDNRLLRYYGYSVLEKFRSSCDSDSIHYPTIAQPSMCMLTISLFELYKHWGIETSFIIGH
SLGEIPAAYCSGMISLDTLCFLIYHRSVAQTHTHRNGRMLSINISPEEYNSNYSLKYPKV
EIACYNSPTSIVLGGEETILNQISNDLKEKGIFSAMLGSLSSFHTSSQRIIKDQVIDLNI
ECKLAKIPSFSTVTTNLFNETTLFNSEYIFNNMALPVKFSQSISNLFKHIEINNLGSDIV
FIELAPHPTLQFYLKQMASSYEKVNSNLKISTYSPLHKKKNDIEEIQKTISQLYCNNGYS
INFKSQFNNDFKINKINSILPNYQWEDVIHWREDLIHQKHNTQGPPIDQLGLSLIESSPN
LKSYQTFIDISRKPFQYLKGHFVNGKYYFPGCGYIDNLLKIYGSQDFTIASMEFKSPLIF
TEGVSQCLQTNIFQTGKSEFRVNYHFKDTKSNEWIQSSVAHFQLFNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNDSDDGNSTNKKYNIEDIINNKCNFTKLSNNELYENIKSKTGIYYTGEFKTVSN
LYVGENCSLAEIPITIKSYESSFFSPSILDTCLHGTIGLIDEKSQIVFERVEGFEYHSSN
IPSQNELSSLKHTKLYSLTESFKRVGDSYSSSITVMLEDGRVLIEFKKVVCKSLTNVIDS
LIIQSPLNELYSTCMQTIDSPIQPSLSSSSLIQLLGNTNEKVKINYSQFISNQLYYNIIK
RCPQLNIETIKSKNIEQLKESYNSLNTKYSKLFKSVFETIQSIGINNEDNSEFNETNIQH
YKILLKSTRIIAKLLFPLKDDDLSKDTGQSLFENGILDEFNSNYFNNNNQVISNIIKESL
LPILNEKMVFRIFGFGGFGSSLSSVVLNKINELLQEFPNSEIDIEFTHADISSSSSSFGS
STPNFKPNFPQINEKVHIIYKSLDLEKQLSSEQMIKPSYYDFVIMSNVLHFTKDVKSVLD
QIHQILKPNGQIILVEPINKSILLDNIFGIFDQWWSFTDLNIRRNDCYISKDTWNSLLLD
CNFDNSKVLISTKEISNFYIIQTQKPSISNLNTNSTTNGDTVIIYGDELKFISSDSNKEI
KISNIQQFNELIEKSIITDESIIYFTKSTNQLTVDNFKLVTLEYIQINQKLLSNNLKCKH
VLITLNSDNMNYLSASLIGATRYFEEFPQLNLFNLDFDQNSINNNELEKTIKLLLDSNQF
IQKEFFIKNSKVYYERYKRELNLNNFFKESQSFSNEKNQLYAKLSPNLEYILKSKKVIKD
DEIEVEVKATGINYKDYLIYCGLVSAESINRYGDVNNPEFGIEYSGIISRIGNNITNFEI
GDQVYGMGLDTISTHVIVNPNYCYHKPTNISFQEAASIPCVYLTSLCSIFNIGCLSVSGN
ESILIHSGTGGVGLSALNILKWKGHKSHVFVTVGSKEKEKYLLDTYGDFITGIYSTRNKN
YVEQIKLKLKQLGSNKNGVDLILNTLSSDYMESNFKCLNTSGRIVDLSVTHLNHNEYINN
NNFKFNFGYHNFELTFINKFLIQKSLKKIKIGIESGELKLIPITAYSNSNAKEAIEFINQ
RKHIGKIVLNNDNDILDSLFNNLSNERNSKFTTLKPNYQINKDHLGSNIIVTGQSGIILE
ILKWIVKFSENVKNIIILSKSSMKWGLELLIKKNKHINFNFKSIDIGDSNQVDKSIDEIL
NENSITNIDSIFHFAFEHTICDVNDIEINHLTKSHGAKTMGAINLHNQSIKRNWKLKQFI
LSSSVTSMIGSTDQCTYVCSNRLLDSLSKYRNSIGLPSICTNYGSVQSAGIVSRNKSIEK
LLDAQGLDPLSINMILGSLDSQIQNVNKSTNLMVSPFNFNNFFETFKNHSMIHKFDFITN
LLENNKSKNSNNGNTEGESNIDTLFLNKVSELLSMELPKINQDLKLVEYGSDSLLIVQLK
NWIDKEIFPNLITIQQLQTNTISSSIKIITNQFNSKSTDGRKKQKQNGINVSSNKSSLPT
LEFWKNETKLDEEEFNFILDSSTKSKINHKDQLKDNEKRILLTGSTGFLGAYLLWHLIQM
DNCKIVYCLLRNKKLFNNPLNDIIDNLKHHQLYDKQLNESHLSKIVAVVGDLSKIKFGLS
DDNYSLLSNDTNLLLNCGADINLSSNYEESKQVNVVGTKEMIKISLIGNIKPKPIITISS
FSVFYNQKLNQEFDESIVTPKLETINDLPAGYIQSKVISEIILTEASSRFNIPSAIIRAP
SIFSNPETGIGHSADIIQLMLQSCFKLGYYPSGNGVDFDLLCSPITWVADNTIKIIFNDN
IINNKEPQQLTSPLKPNIYSVYGKVLDLFEILQVLKSDEGGNCKEIEINQWKQMVMDSKE
KACIKLRTFHTLQFDGRNILNKGHGISNKQKSYLQSIGSFGNGGEITNQMIFKNVQSNN
NT seq
9000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggttttaaagtaaataaaaatttaaatgaaacaaatgacaatagtgataatgatgtt
gcaattattggtattggatttagattaccatcaggtaatttaaataaatcaaatgattct
ccaattattttatgggataatttaatgaaaggatttgatggtatggttgaaacatcagaa
agatggagtgataatttcaatcaacttggtgaaatttcaaataaaagtggtggattatta
ccattagatgaatggaaatcatttgatccattatttttcggtattaacccatcagaagct
caaacaattgatcctcaacaaagaatactattaaaatgtacatgggaggcaatagaggat
tcaaatattgatccaattaaaattcgtggttcaaaaacatcagtttacatgggtggtact
tctgttgaatataaagaattaaataagaattcaaatgaaattaatccaaatatttttggt
tcaacatttaatacaattgcgaatcgtatttcatattgttttgatcttagtggtgagtct
atgacattagatactgcttgttcatcatctttaaatgcaattatcttaggttatcaatca
attaaaagtggtacttccaatttatcaattgttggtggtgttaatttaatattagattca
aatttatcaaaatcttattcttatttaaatatgttaagtaagaaagaaggtaaatgtatg
tcatttgattcacgtgcagatggattcgttagaagtgagggtgctggtgtatttatatta
aaaagtttaaaacaatcaataattgatggtaataatatttattgcgttattaaaggagca
agttcaaatattgatggtaatggtttaaatgataaacaaaacttttattcaccatcatca
tcttcacaagctgaaaatattaatagagcactatcatcaactaaaggatctgtaaaaatt
gatgatattgtttatgtagaagcacatggtactggtacaccaactggtgatccaattgag
ttagaagcaatttcaagagttttcaaaaccaataataatgataataataatcaacaacac
caaaatccaatattaattggatcatttaaaagttccgttggtcatttagaatcagcctca
ggttcagcatcattagtaaaatgttgtttaatgtttaaaaatcaatatttaacacccaat
gttaatttcaaaacaccaaatccatcaattaaatttgatgaatggaatttaaaagttgtt
acagaaccaatacaatttaaagatgtaaagaaatcaaacaacttttcaatgattttaaat
aattttggtatcactggttcaaattgttgtttaattttatcacaatacaatggaaaccat
aatgatgaacaggaaaatcaacaacaacaacaacaacaaggaaaacaatatttaattcca
ttttcagcaaattcaatacaatcattaaaacaatatgaatcattaattaatgaaaatcaa
tttaaagaatcaaatgattttaaagaatttgttaaacatcaaatatatagtaaatcaata
tcactttatcaacgttcggtttcaatagcatcaaattggaatgattttaatgaaggcatg
aaatcaacaaataacaacaataataaaacacaaacatcaaattcaaaatcatcaaatatt
tcaataattccaaagaatccaatcactgtaatggtatttgcaggacaaggttcacaatat
agtacaatggcaatggaattatataataatgaaccaatatttaaagaatcaatggataga
ttagataatagattattaagatattatggatactctgtattggagaaatttagatcaagc
tgtgatagtgatagtattcattatccaacaattgctcaaccatcaatgtgtatgctaacc
atatcattattcgaattatataaacattggggtattgaaacatcatttattattggtcat
agtttaggtgaaattccagctgcttattgctcaggtatgatttcattagatactttatgt
tttttgatttatcatagatcagttgcacaaactcatacacatcgtaatggtagaatgtta
tcaattaatattagtcctgaagaatataattcaaattattcattaaaatacccaaaagtt
gaaattgcatgttataattcaccaacttcgattgtacttggtggtgaagaaacaatatta
aatcaaatatcaaatgatttaaaagaaaaaggaatattctcagcgatgttaggttcacta
tcatcattccatacatcaagccaaagaattattaaagaccaagtcattgatttaaatatt
gaatgtaaattagcaaaaattccatcattttcaacagttacaaccaatttattcaatgaa
acgacattattcaattcagaatatatttttaataatatggctctaccagttaaattttca
caatcaatttcaaatctatttaaacatattgaaataaataatttaggaagtgatattgtt
ttcattgaattagcaccacatccaacattacaattttatttaaaacaaatggcatcatca
tatgaaaaagtcaattcaaatttaaaaatatcaacatattcaccacttcacaagaaaaag
aatgatatcgaagagattcaaaaaacaatttcacaactttattgtaataatgggtacagt
attaattttaaatcacaatttaataatgattttaaaattaataaaatcaattcaatatta
ccaaattatcaatgggaagatgtaattcactggagagaagatttaattcatcaaaaacat
aatactcaaggaccaccaattgatcaacttggtttatcattaattgaaagttcaccaaat
ttaaaatcatatcaaacatttattgatatttctagaaaaccattccaatatcttaaaggt
cattttgtgaatggcaaatattatttcccaggttgtggttatattgataatcttttaaaa
atttatggttcacaagattttacaattgcttcaatggaatttaaatcaccattaattttt
acggaaggtgttagtcaatgtttacaaacaaacattttccaaactggtaaatcagaattc
agagttaactatcattttaaagatacaaaatcaaatgaatggatacaatcatcagttgct
catttccaattatttaataataataataataataataataataataataataataataat
aataataataataataataatgatagtgacgatggaaatagtaccaataaaaaatataat
attgaagatattataaataataaatgcaatttcacaaaattatcaaacaatgaactttat
gaaaatattaaatcaaaaactggtatatattatactggagaatttaaaacagtatcaaac
ctttatgtgggtgaaaattgttcattagcagaaataccaataacaattaaatcttatgaa
tcatcatttttctcaccatcaatattagatacttgtttacatggtacaattggattaatt
gatgaaaaatctcaaattgtatttgaaagagttgaaggattcgaataccattcttcaaat
attccatcacaaaatgaattatcatcattaaaacatacaaagctatattcattaacagaa
tcattcaaaagggttggagattcatattcaagttcaattacagttatgttggaggatggt
agagttttaattgaatttaaaaaggttgtatgtaaatctttaactaatgttattgattca
ttaataatacaatcaccattaaatgaattatattcaacatgtatgcaaacaattgattca
ccaattcaaccttctttatcatcatcatcattgatacaactacttggcaacaccaatgaa
aaagttaaaattaattatagtcaattcatttcaaatcaattgtattacaatataattaaa
agatgtccacaacttaatattgaaacaatcaaatcaaagaatattgaacagttaaaagaa
agttacaactctttaaatactaaatattcaaaattattcaaatcagtatttgaaacaatt
caatcgattggtataaataatgaagataatagtgaatttaatgaaacaaacattcagcat
tataaaatcttattgaaatcaactagaataattgcaaaattattattcccattaaaagat
gatgatttaagtaaggatacaggacaatcattatttgaaaatggaattttagatgaattc
aattcaaattattttaataataataatcaagttattagcaacataattaaagaatcactt
ttaccaatattaaatgaaaagatggtattcagaatatttggatttggaggttttggatca
tcattatcatcagttgttttaaataaaatcaatgaattacttcaagaatttccaaatagc
gaaattgatatagaattcactcatgctgatatttcatcatcatcatcttcttttggtagt
agtacaccaaatttcaaaccaaatttcccacaaataaatgaaaaagttcatataatttat
aaatcattagatcttgaaaaacaattatcaagtgaacaaatgattaaaccatcatattat
gattttgtaatcatgtcaaatgttttacattttacaaaagatgttaaatcggtattggat
caaatccatcaaattttaaaaccaaatggccaaattatattagtagaacctattaataaa
tcaattttacttgataatatatttggtattttcgatcaatggtggagttttacagattta
aatattagaagaaatgattgttatatttcaaaagatacttggaatagcttactattagat
tgtaattttgataatagtaaagttttaatttcaacaaaagaaatttcaaacttttatata
attcaaactcaaaaaccttcaatttcaaatttaaatacaaattcaactacaaatggtgat
acagttataatctatggtgatgaattaaaatttataagttctgatagtaataaagaaatt
aaaatttcaaatattcaacaatttaatgaattaattgaaaaatcaataataacagatgaa
tcaattatttactttacaaaatcaacaaatcaattaacagtagataatttcaaattagta
acattggaatatattcaaatcaatcaaaaactattatcaaataatttaaaatgtaaacat
gtattgattacattaaattctgacaatatgaattatttatcagcatcattaataggagca
actagatattttgaagaatttccacaattaaatttattcaatttagatttcgatcaaaat
tcaataaataataatgaattagaaaaaacaattaaattgttattagattcaaaccaattc
attcaaaaagaattctttataaagaatagtaaagtttattacgaaagatataagagagaa
ttgaatttaaataatttctttaaagaatcccaatcattttcaaatgaaaagaaccaatta
tacgcaaaattatcaccaaatttagaatatattttaaaatcaaaaaaggttataaaagat
gatgaaattgaagtagaagtaaaagcaacaggtattaattataaagattatttaatttat
tgtggattagtatcagctgaatcaattaatcgttatggtgatgttaataatcctgaattt
ggtattgaatactctggtattatttcacgtattggtaataatataacaaattttgaaatt
ggtgaccaagtttatggtatgggattagatacaatttcaactcatgtaattgtaaatcca
aactattgttatcataaaccaacaaatatcagttttcaagaagcagcatcaataccatgt
gtttatttaacatcattatgctcaatatttaatattggatgtttaagtgttagtggtaat
gaatcaattttaattcattcaggtacaggtggtgtaggattatcagcattgaatatatta
aaatggaaaggtcataaatctcatgtatttgtaacagtaggttcaaaagaaaaagaaaaa
tacctactagatacatatggtgattttataactggaatttattcaacaagaaataaaaat
tatgttgaacaaattaaattaaaattaaaacaattaggatcaaataagaatggtgtagat
ttaatattgaatacattatcaagtgattatatggaatcaaatttcaaatgtttaaataca
agtggtagaattgtagatttatctgtgactcatttaaatcataatgaatatattaataat
aataattttaaattcaattttggttatcataattttgaattaacatttattaataaattt
ttaattcaaaaatcattaaagaaaattaaaattggaattgaaagcggtgaattaaaatta
ataccaataactgcatattcaaactcaaatgcaaaagaagcaattgaatttattaatcaa
cgtaaacatattggtaaaatagttttaaataatgataatgatattttagattcattattt
aataatctttcaaatgaaagaaattcaaaatttacaactcttaaaccaaattatcaaata
aataaagaccatttgggttcaaatataatagttacaggtcaatctggtataattttagag
attttaaaatggattgttaaattttcagaaaatgttaaaaatattattatattatcaaaa
tcatctatgaaatggggtttggaattattaattaaaaagaataaacatataaatttcaat
tttaagagtattgatattggtgattcaaatcaagttgataaatcaattgatgaaatttta
aatgaaaattcaataacaaatattgattcaatttttcattttgcattcgaacatactata
tgtgatgtaaatgatattgaaattaatcatttgaccaaatctcatggtgcaaaaacaatg
ggtgcaattaatttacataatcaatcaattaaaagaaattggaaattaaaacaatttatt
ttatcatcatcagtaacatcgatgattggttcaactgatcaatgtacatatgtttgttct
aatagattattggattcattatcaaagtatagaaattctattggattaccttcaatatgt
acaaactatgggtcagtacaatctgcaggtattgtttcaagaaataaatctattgaaaaa
ttattagatgctcaaggtttagatccattatcaattaatatgatattaggttcattagat
tcacaaattcaaaatgtaaacaaatcaacaaatttaatggtatcaccgttcaattttaat
aatttctttgaaacttttaaaaatcattcaatgattcataaatttgatttcattacaaat
cttttagaaaataataaatcaaaaaatagtaataatggtaatacagaaggagaatcaaat
attgatacattatttttaaataaagtttcagaattattatcaatggaattaccaaagatt
aatcaggatttgaagttggtggagtatggttcagattcattattaattgttcaattaaaa
aattggatagataaagaaatctttccaaatttaattacaattcaacaacttcaaactaat
acaatttcatcatcaattaaaatcattacaaatcaatttaattctaaatcaactgatggt
agaaaaaaacaaaaacaaaatggaattaatgtttcatcaaataaatcatcattaccaact
ttagaattttggaaaaatgaaactaaacttgatgaagaagaatttaattttatattagat
tcttcaaccaaatcaaaaataaatcataaagatcaattaaaagataatgaaaaaagaatt
cttttaactggtagtactggatttttaggtgcatacctactttggcatttaattcaaatg
gacaattgtaaaattgtttattgtttattaagaaacaaaaaactatttaataatccatta
aatgatataatagataatttaaaacatcatcaattatatgataaacaattaaatgaaagt
catttatcaaaaattgttgcagttgtaggtgatttatcaaaaattaaatttggtttatca
gatgataattattcattactttcaaatgatacaaatttattattaaattgtggtgctgat
attaatttatcatcaaattatgaagagtcaaaacaagtaaatgtagttggtacaaaagaa
atgataaaaatatcattaattggtaatataaaaccaaaaccaattattacaatctcatca
ttttcagtattttataatcaaaagttaaatcaagagtttgatgaatcaattgttacacca
aaacttgaaacgattaatgatttaccagcaggttatattcaaagtaaagttatttcagaa
attatattaacagaagcatcatcaagattcaatataccatcagcaataatcagagcacca
agtattttctcaaatcctgaaactggtattggtcatagtgctgatatcattcaattaatg
ttacaatcttgctttaaattaggttattacccaagtggtaatggagttgattttgatctt
ctttgttcaccaataacatgggtcgctgataatactattaaaattatttttaatgataat
attattaacaacaaagaacctcaacaattaacatcaccattaaaaccaaatatttacagt
gtatatggaaaagttttagatttatttgagattttacaagtattaaagagtgatgaaggt
ggcaattgtaaagaaattgaaattaatcaatggaagcaaatggtaatggattcaaaagaa
aaagcatgtattaaattaagaacttttcacactttacaatttgatggtagaaatatttta
aataaaggtcatggaatttcaaataaacaaaaatcatatctacaatcaattggatctttt
ggaaatggtggtgaaatcactaatcaaatgatattcaagaatgttcaatcaaataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
