Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0271524
Help
Entry
DDB_G0271524 CDS
T00245
Symbol
pks6
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
KAsynt_C_assoc
Methyltransf_23
ADH_N
Methyltransf_11
Thiolase_N
ADH_zinc_N_2
PS-DH
Methyltransf_31
PP-binding
Epimerase
PKS_DH_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8618015
NCBI-ProteinID:
XP_001732962
dictyBase:
DDB_G0271524
UniProt:
B0G0Z9
LinkDB
All DBs
Position
2:507457..516313
Genome browser
AA seq
2924 aa
AA seq
DB search
MNNLKNIDLIEKGVAIVGIGFRIPSGNNENSICSPDDLFNNLKNGFDGVSSTSERWSDNY
HKLGEISSPNAGLLPLNEWKSFDPLFFGINPSEASLIDPQQRLLLKCTWEALEDASIDPI
SIRGTNTSVFIGASNIDYQHTNKHQDSVLKNAIAQSTCAISNRISYCFDFNGPSLSIDTA
CSSSLNAVSQGYHSILNGTSDISIVGGVNLILDVEMTKAYSYLSMLSKTHGKCKAFDESG
DGFTRGECVGVVVLKNLQDAIKDGNRIYCVINGSSSNVDGNGNMDKVNFYSPSKQSQFNN
INSAFKSTNDKLSINDIQYIEAHGTGTKTGDPIETEAISMAFKNRDKSAPILIGSIKSNI
GHCEAGSGVASLIKCCLMFKYQCFLPNIHFKNPNPLIKFNEWNLKVVTSPIPFNKRNNEK
PVSMMINNFGVTGSNCCLLISEFKNNNNFKENINLESQSVNDRVLIPFSANSSNSLNQYQ
SKFKNIINNQFNFIDFTAIQIYSKSNYLYQRSVVIASNSNELFENISNKKQIQTKNSIIS
NMSFKGKNPITIFVFSGQGSQYPKMALELYNNEVIFKKSIDLIDSKLSKYYGFSVWEKVK
TIKDDDLTSIHDPIFAQPALCMISVSLFELYYHWGVNPSFILGHSLGEISASYCSGMIDL
DTFCYTVYQRSIAQSKTNGCGRMLSINISDEEFKSMYSQKYPQIEIACYNSPQSIVVAGN
ESILNEISKELKEKEIFTAMLGSLSSFHTSSQQSTKDSILQLNIESNQPKVPIFSTVTTN
LFNESNRFNSQYVYDNIIKPVKFTQTISNIYKHIESNQLDNDIVFIEIAPHPTLSFYIKQ
MVPSSLNESVSVYSALHKKKNDVEEFQQTISNLYCQNGYNINFKCQFNNKKSNLNIELPL
YQWSDELYFAQNQVLEQHRKGGPPIDHLGLSNSYYSPFKNSYKTLIDINYKPFQYLKGHM
VKGKYYFPGCGYIDNIIQLYKNQDIFISFIEFKTPLILIEGINQYLQTNIQQTGKSEYRA
QFHFKDHKSNEWIQSSNSNFQLLDHGNDIPSNYNIKEIIKNKCNLSKLTKNELYKNIKSK
TGLNYTGVFQGVTECYIGDNCTLSVVSLESQTNSFLNIPILDTCLHGMLILINDQCQIVF
DKAIGFKYYSSNIPADFKENKDSFYVYSNLRPRVGGDSYHGTIIVMLSDGSVLYEIEEVV
CKSLIPIKDSLKIEYPNDELYKVHLQSKDSPIPTPSSFKSIIYENDFFQSSLNIPEDLFK
YISTLFYKDIIKRCPEININKINSHSVNEIISSFSKISKHERLFRFVFETIKENGILNSF
EEKDDTYFEFNKVIIKSSRIISKLLFPLENDNDNEDLPQSLFQNGLMDKIYKCSYLRKKN
QVISHVIKHSIKEIINNNIIIRILEFGGGTASLSVEVIEEIVTLLQENPNYQVEIEYTWS
DISPAFIADAKNKINKIINDAAITNGLNVIYHPLTIGESLIETQSIKPSYYDFVIMSNVL
HVVKDIKQAVEQMYQLLTTNGQLVFLEPPYKSVLNDSIVGSFEQWWSFTDTDIRKDRCGM
PQQSWYQLLNSCNFKDIVMSKECIFFGSVIQAQKPPISLLNSQPKYDNIIIYGGSINSSF
VENIKLDSNSKSLFQIETIQEFNKLISKSTITNDSIVYFIKTLETLSLDNFKQITLEYIE
INQKLLQINSLCKHVLIVSDSRKTNYLASSAIGAARYFDEFPLLKLHTLDFDYDSTQNYI
NSKNNKMVQFINILTDSKTNVHKEMIIINNKVYYEIVQKEKNLKLKYNSESFENQNNLMC
SLSPNLEYQLQSKQIKLRDNQVEVKTIATGINYKDYLNFSGSNSNGDDNTGLPQFGYEFS
GIITRVGNNVKDYKVGDNVFGLSNSCTSSHIVTNFKKIQIKPSKISHIEASSIPIDYLTS
FMSLFNVGSLNIEDNESILIHLGRDGFGLSTFEILKWKGFKSNLFVTVNSDKTKQYLLKK
YGDLITGIYSNTDKSYVAEIKNKLIKLGSKKKGVDLILNTLPSDFMDSNFKLLTKYGRII
DLNSNHLNQSEFLKNINFKYNHGYHNFELSLFQKNKILKCLNEISNAIENGELKTIPIKE
FTNLNIKDAIKYITNGNIEKITVSHDHEIYSDIIYRYLDEKEFSILKSNYQINSNNLGKN
ILITGQSGIILEILKWIIKYSNINTIENVIILSRSSLKWELELLINQTKLSNNNIKFHFK
SVDVGDSEQVDNAINDILNENQQIRNIDSIFHFAFQQIACKVQEINMKHLNISHGAKSMG
AINLHNQSIKRNWKLINFVMASSALSFIDSTDQCTYACANTLLDSFSKYRVSLGLPSTCI
NLGLIESTGFVSKNESISVFLDGNGIIPTPINRVLGLLDLQIQNASKFTNSMISNFKPSK
FKNNQQISLFLKFDYLMNLKNNSEQTKKENTGNKNIDELFIEKVSELFSMDESKINKNLR
LIDYGADSLIIVQLKNWIDKEIGINLITIQQLQNNTINISIKMILNSLMKNNQNKYLPSN
RIDYWKNEMKFEESIKPIPNEIRSRNNNSGKIILLTGTTGFLGGFLLFNMLRLDSCKLIY
CLIRNKSKSSYPLDEIINNLKYHQLYEKLNKSQISKIIPIIGDLSMNKLGLSNDDYETIS
KNVNLIINPGADINQKSSYQDCKLVNVNGVKEIIKLSLSSLKQRIPIVNFSSFSVFFNQS
LDKNFDESVLPSIDNIDNLPTEYMKSKVVGEYILLEASKNYNIPSILIRPPSIFLNPETG
IGHSSDLTLLMIQSCYELGYCPNQILNGFILINTITWLSNNITNIIMNDNCWTNSKMNIY
NVHGKQIQSSLIIKPLEKHFNCKQINNNDWIDMVNNSNKKSCIKLKSFHSLENIFKSENK
GYKSNESQSISLSTKSLLESMGSYNTDLKITDKMIISHIKHIFK
NT seq
8775 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataatttaaaaaatatagatttaatagagaaaggtgttgcaattgttggtattgga
tttagaattccttctggtaataatgaaaattcaatttgttcaccagatgatttatttaat
aatttaaagaatggttttgatggtgttagtagtacatcagaaagatggagtgacaattac
cacaagttgggtgagattagtagtccaaatgcaggtttattaccattaaatgaatggaaa
tcattcgatccattattttttggtattaatccatctgaagcatctttaatcgatccacaa
caaagattattattaaaatgtacatgggaagcattagaagatgcgtcaattgatccaatt
tcaattcgtggtacaaatacttcagttttcattggtgcttcaaatatagattatcaacat
acaaataaacaccaagactcagttttaaaaaatgcaatagcacaatccacctgtgcaatt
tcaaatagaatatcatattgtttcgattttaatggtccatcattatcaattgatactgca
tgttcatcatcattaaatgcagtttctcaaggttatcattcaatattaaatggtacttct
gatatctcaattgttggtggtgtaaatttaatattagatgttgaaatgacaaaggcatat
tcgtatttaagcatgttaagtaaaacacatggtaaatgtaaagcatttgatgaaagtggt
gatggttttacacgtggtgaatgtgtcggtgttgtagttttaaaaaatttacaagatgca
attaaagatggtaatagaatttattgtgtaattaatggttcaagttcaaatgttgatggt
aatggtaatatggataaagttaacttttattcaccatcaaaacaatcacaatttaataat
attaattcagcatttaaatcaacaaatgacaagctctcaattaatgatattcaatatatc
gaagcacatggtactggtactaaaacaggtgatccaattgaaactgaagcaatttcaatg
gcttttaaaaatagagataaatcagcaccaattctaattggttcaattaaaagtaatatt
ggtcattgtgaagctggttcaggtgttgcatcattaatcaaatgttgtttaatgtttaaa
tatcaatgctttttaccaaatattcatttcaaaaatccaaatccattaattaaattcaat
gaatggaatttaaaagttgtaacatcaccaattccattcaacaaaagaaataatgaaaaa
ccagtttcaatgatgattaataactttggtgtaacaggttcaaattgttgtttacttatt
tcagaatttaaaaataacaataactttaaagagaatattaatttagaatctcaaagtgtt
aatgatagagtgttaataccattctcagcaaattcatcaaattcattaaatcaataccaa
tcaaaatttaaaaatataattaataatcaattcaattttattgattttaccgcaattcaa
atttattcaaaatcaaattatctttatcaaagatcagttgtaattgcaagtaattcaaat
gaactttttgaaaatatctcaaataaaaaacaaattcaaactaaaaattcaattatctca
aatatgtcattcaaaggaaagaacccaattacaatttttgttttttcaggtcaaggatca
caatatcctaaaatggctttagaattatataataatgaagtaatctttaaaaagtcaatt
gatttaatcgattcaaaattatcaaagtactacggtttttcagtatgggagaaggtaaaa
acaatcaaagatgatgacttaacctcaatacatgatccaatttttgcccaaccagcacta
tgtatgatttcagtatcactatttgaattatattaccattggggagtaaatccatcattt
attcttggtcatagtcttggtgaaatttcagcatcatattgttctggaatgattgattta
gatacattctgttatacagtttatcaaagatcaatagcacaatctaaaacaaatggttgt
ggtagaatgttatcaattaatatcagtgatgaagaatttaaatcaatgtattctcaaaag
tatccacaaattgaaattgcgtgttataattcacctcaatcaattgttgtggcaggtaat
gaatcaatattaaatgaaatttcaaaagaattaaaagaaaaagaaattttcactgcaatg
ttaggttcattatcatcattccatacaagtagtcaacaatctacaaaagatagcatatta
caactaaacattgaaagcaatcaaccaaaagtaccaatattttcaacagttacaacaaat
ttatttaatgaatcaaatcgatttaattcacaatatgtttatgataatattatcaaacca
gttaaattcacacaaacaatttcaaatatttataaacatatcgaatcaaatcaattagat
aatgatattgtattcattgaaattgcaccacatccaacattatcattttatattaaacaa
atggtaccatcaagtttaaatgaatcagtttcagtttattcagcacttcacaagaaaaag
aatgatgtcgaagagtttcaacaaaccatttcaaatttatattgtcaaaatggatataat
attaattttaaatgtcaatttaataataaaaaatcaaatctaaatattgaattacctctt
taccaatggagtgacgaattatacttcgctcaaaatcaagtacttgaacaacatagaaaa
ggaggaccaccaattgaccatcttggtctatcaaactcttattattcaccatttaaaaat
tcatataaaacacttattgatataaattataaaccatttcaatatcttaaaggtcatatg
gttaaaggtaaatactacttcccaggttgtggttatattgataatattattcaactttat
aaaaatcaagatatttttattagttttattgaatttaaaacaccattaattttaattgaa
ggtatcaatcaatatttacaaacaaacattcaacaaactggtaaaagtgaatatcgtgca
caatttcatttcaaagatcataaatcaaatgaatggattcaatcatcaaattcaaatttc
caattattagatcatggtaatgatataccatcaaattataatattaaagaaattattaaa
aacaaatgtaatttgagcaaattaacaaagaatgaactttataaaaatattaaatcaaaa
actggtttaaattatactggagtttttcaaggtgttactgaatgctatataggtgataat
tgtaccttatcagttgtatctttagaatctcaaacaaactcatttttaaatataccaatt
ttagatacatgcttacacggaatgttaatattaataaatgatcaatgtcaaattgtattt
gacaaagccattggatttaaatattattcatcaaacataccagcagattttaaagaaaac
aaagatagtttttatgtttattccaatcttagaccaagagtaggtggtgattcataccat
ggaacaattatagtaatgttatcagatggttcagttttatatgaaattgaagaagttgtt
tgtaaatcattaattccaatcaaagattcacttaaaattgaatatccaaatgatgaatta
tacaaagttcatttacaatcaaaagattctccaattccaacaccatcatcattcaaatca
attatttatgaaaatgatttctttcaatcttcacttaatattccagaagatttattcaaa
tatatttcaacattattttataaagatattataaaaagatgtccagaaattaatatcaat
aaaattaattctcatagtgttaatgaaattatttcaagtttcagtaaaatttcaaaacat
gaaagattatttagatttgtatttgaaacaataaaagagaatggtattcttaatagcttc
gaagaaaaagatgacacttacttcgaatttaataaagtaattatcaaatcatcaagaatt
atttcaaaattattatttccattagaaaatgataatgataatgaagatttacctcaatca
ttatttcaaaatggtttaatggataaaatttataaatgcagttatttaagaaagaagaat
caagtgatttcacatgtcattaaacattcaattaaagagattattaataataatattata
attagaattttagaatttggaggaggtactgcatcattatcagttgaagttattgaagaa
atcgttacattacttcaagagaatccaaattatcaagttgaaatcgaatatacatggagt
gatatttcacctgcattcatagcagatgcaaagaataaaatcaataaaatcattaatgat
gctgctataacaaatggattaaatgttatttatcatccattaacaattggtgaatcattg
atagaaactcaatcaattaaaccatcatattatgatttcgttataatgtcaaatgttctt
catgttgttaaagatatcaaacaagctgtagaacaaatgtatcaattgttaacgacaaat
ggtcaattagtgtttttagaaccaccttataaatcagttctaaacgattcaatcgttggt
tcatttgaacaatggtggtcattcactgatactgatattagaaaagatagatgtggtatg
cctcaacaaagttggtatcaattattaaattcgtgtaattttaaagacattgtaatgtct
aaagaatgcattttctttggatcagtaatacaggcacaaaaaccaccaatttctttattg
aattctcaaccaaagtatgataatataattatatatggtggcagtattaattcaagtttt
gtagaaaacatcaaattagattcaaattcaaaaagtttatttcaaattgaaactattcaa
gaatttaataaattaataagtaaatcaacaattacaaacgattcaatagtttatttcata
aaaacattagaaacattatcattggataattttaaacaaataactcttgaatatattgaa
atcaatcaaaaactattacaaattaatagtttatgtaaacatgtattaattgttagtgat
tcaagaaaaacaaactatttagcatcatcagctattggtgcagcaagatactttgatgaa
ttcccactattgaaattacacacattagattttgattatgattcaactcaaaattatata
aattcaaaaaataacaaaatggttcaattcattaatatcttgacagattccaaaacaaat
gttcataaagaaatgattataattaataacaaagtatattatgaaatagttcaaaaagag
aaaaatctaaaattaaaatacaattcagaatcttttgaaaatcaaaataatttaatgtgt
tcgttatcaccaaatttagaatatcaattacaatcaaaacaaattaaattaagagataat
caagttgaagttaaaacaattgcaactggtatcaattataaagattatttaaattttagt
ggttcaaatagcaacggtgatgacaatacaggtttaccacaatttggatatgaattttca
ggtattataacaagagttggtaataatgtaaaagattataaagttggtgataatgtattt
ggtttatcaaattcttgtacatcatctcacattgttacaaattttaaaaaaattcaaata
aaaccttcaaaaataagtcatattgaagcatcatcaattccaattgattatttaacatca
tttatgagtttatttaatgttggaagtttaaatattgaagataatgaatcgattttaatt
catttaggtagagatggttttgggttatcaacatttgaaatattaaaatggaaaggtttt
aaatcaaatttattcgttacagttaattcagataaaactaaacaatatcttttaaaaaaa
tatggtgatttaattactggaatttattcaaacacagataaaagttatgtggcagaaata
aaaaacaaattaattaaattaggttcaaaaaagaaaggagtagatttaatattaaataca
ttaccaagtgattttatggattcaaatttcaaactattaacaaagtatggtagaataatt
gatttaaattcaaatcatttaaatcaaagtgaatttttaaaaaatatcaattttaaatat
aatcatggttaccataactttgagttatcattatttcaaaaaaataaaattctcaaatgt
ttaaatgaaatttcaaatgctattgaaaatggagaattaaaaactattccaattaaagaa
tttacaaatttaaatattaaagatgccatcaaatacattaccaacggtaacattgaaaaa
attacagttagtcatgatcatgaaatttatagtgatattatttatagatatttagatgaa
aaagagttttcaatattaaaatcaaattatcaaattaattcaaataatttaggtaaaaat
atattaattacaggtcaatcaggtattattttagaaatattaaaatggatcattaaatat
tcaaatattaacacaattgaaaatgttattattctttcaagatcatcattaaaatgggaa
ttagaattattaattaatcaaactaaactatcaaataataatattaaattccatttcaag
agtgttgatgttggtgatagtgaacaagttgataatgcaatcaatgatatactaaatgaa
aaccaacaaattagaaatattgattcaatattccattttgcatttcaacaaattgcatgt
aaagttcaagaaatcaatatgaagcatttaaatatttcacatggagcaaaatcaatgggt
gcaattaatttacataatcaatcaattaaacgtaattggaaattaattaattttgttatg
gcttcttctgcactttcatttatagattcaacagatcaatgtacatatgcttgtgcaaat
actctattagattcattttcaaaatacagagtatcacttggattaccatcaacttgtatt
aaccttggtttaattgaatcaactggtttcgtttcaaagaatgaatcgatttcagtattt
ttagatggcaatggtattatcccaacaccaatcaatcgagttttaggtcttttagattta
caaattcaaaatgctagtaaattcacaaattcaatgatttcaaatttcaaaccctcaaaa
tttaaaaataatcaacaaatatcattatttttaaaatttgactacttgatgaatttaaaa
aacaatagtgaacaaactaaaaaagagaatactggaaataaaaacattgatgaattattc
attgagaaagtttcagaattattttcaatggatgaatcaaaaataaataaaaatcttaga
ttaatcgattatggtgcagattcattaataatagttcaattaaagaattggatagataaa
gaaattggtataaatttaataacaattcaacaacttcaaaataatacaattaatatttca
attaaaatgatattaaattcattaatgaaaaacaatcaaaataaatacctaccttcaaat
agaattgattattggaagaatgaaatgaaatttgaagaatctattaaaccaataccaaat
gaaattcgatcaagaaataataactcaggaaaaattattttattaactggtacaactggt
tttttaggtggtttcttgctattcaatatgttaagattagattcatgtaaattaatttat
tgtttgattaggaataaaagtaaatcaagttatccattagatgaaattataaataattta
aaatatcatcaactttatgaaaaattaaataaatcacaaatttcaaagattataccgatt
attggtgatttatcaatgaataaacttggtctttcaaatgatgattatgaaacaatttca
aaaaatgtaaatttaattatcaatccaggtgcagatattaatcaaaaatcaagttatcaa
gattgtaaattagtaaatgttaatggagtaaaagaaattattaaattatcattatcatct
ttaaaacaaaggataccaattgtaaacttttcatcattttcagtatttttcaatcaatca
cttgataagaatttcgatgaatcagttttaccatcaattgataatattgataatttacca
acagaatatatgaagagtaaagttgtgggagaatacattttattggaagcttcaaaaaat
tataatataccatcaattttaattagaccaccaagtatatttttaaatccagaaacaggt
attggtcatagtagtgatctcactttattaatgatccaatcatgttatgaattaggttat
tgcccaaatcaaattttaaatggttttattttaattaatacaattacatggttatcaaat
aatattacaaatattataatgaatgataattgttggacaaattcaaaaatgaatatttat
aatgtacatggtaaacaaattcaatcaagtttaataattaaaccacttgaaaaacatttc
aattgtaaacaaatcaacaataatgattggattgatatggttaataattcaaataaaaaa
tcatgtattaaattaaaatcattccattctttagagaatatttttaaaagtgaaaacaaa
ggatataaatccaatgaaagtcaaagcatttcattatcaaccaaatcattactagaatca
atgggttcatacaatactgatcttaaaatcactgataaaatgattatttctcatattaaa
catatttttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
