Dictyostelium discoideum (cellular slime mold): DDB_G0271530
Help
Entry
DDB_G0271530 CDS
T00245
Symbol
pks9
Name
(RefSeq) beta-ketoacyl synthase family protein
Organism
ddi
Dictyostelium discoideum (cellular slime mold)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
NAD_binding_4
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
KR
Methyltransf_12
Methyltransf_23
KAsynt_C_assoc
ADH_N
Methyltransf_11
ADH_zinc_N_2
Methyltransf_31
Thiolase_N
PP-binding
Epimerase
PKS_DH_N
Methyltransf_25
PS-DH
adh_short
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8618022
NCBI-ProteinID:
XP_645569
dictyBase:
DDB_G0271530
UniProt:
Q86AE3
LinkDB
All DBs
Position
2:541447..550308
Genome browser
AA seq
2931 aa
AA seq
DB search
MGNLKNINLKEKGVAIVGIGFRIPSGNNENSISSPDDLFNNLKNGFDGVSSTSERWSDNF
HKLGEISSPNAGLLPFKEWKSFDPLFFGINPSEAPLIDPQQRLLLKCTWEALEDASIDPI
SIRGTNTSVFIGSSTIDYLHTNKHQDSVLKNAIAQSTSAISNRISYCFDFNGPSLSIDTA
CSSSLNAVSQGYHSILNGTSNMSIVGGVNLILDVDIIKAYSILSMLSKTHGKCKTFDESG
DGFTRGECVGVVVLKNLQDAVKDGNRIYCVINGSSSNVDGNGNMDKVNFYSPSKQSQFNN
INSAFKSTNDKLSINDIQYIEAHGTGTKTGDPIETEAISMAFKNRDKSTPILIGSIKSNI
GHCEAGSGVASLIKCCLMFKYQCFLPNIHFKNPNPLIKFNEWNLKVVTSPIPFNKRNNEK
PVSMMINNFGVTGSNCCLLISEFKNNNNFKENINLESQSVNDRVLIPFSANSSNSLNQYQ
SKFKNIINNQFNFIDFTANQIYSKSNFLYQRSVVIASNSNELFENISNKKQIQTKNSIIS
NMSFKGKNPITIFVFSGQGSQYPKMALELYNNEVIFKKSIDLIDSKLSKYYGFSVWEKVK
TIKDDDLTSIHDPIFAQPALCMISVSLFELYYHWGVNPSFILGHSLGEISASYCSGMIDL
DTFCYTVYQRSIAQSKTNGCGRMLSINISDEEFKSMYSQKYPQIEIACYNSPQSIVVAGN
ESILNEISKELKEKEIFTTMLGSLSSFHTSSQQCTKDSILQLNIESNQPKVPIFSTVTTN
LFNESNRFNSQYVYDNIIKPVKFTQTISNIYKHIESNQLNNEIVFIEIAPHPTLLFYIKQ
MVPSSLNESVSVYSALHKKKNDVEEFQQTISNLYCQNGYNINFKCQFNNKKSNQSINLPL
YQWDEELYFTQAQTLEQHRKEGPPIDHLGTSNSYNSPFNNSYRTSIDIKNKPFLYLKGHM
VKGKYYFPGCGYIDNIIQLYKNQDIFISFIEFKTPLILIEGINQYLQTNIQQTGKSEYRA
QFHFKDQKSNEWIQSSNANFQLLDHGNDIPPKYNIKEIIENKCNLSKLTKNELYTHIKSK
TGLNYTGVFQGVTECYIGGDCTLSVVSLESQTNSFLNIPILDTCLHGMIGLSNDQCQIVF
DKAIGFKYYSSNIPANLKDYKDSVYVYSHLKSKSVDSFFGSIIVMLSDGSVLYEIEEVVC
KSLIPIKDSLKIEYPNDELYKVHLQSKDSPIPTPSSFKSIIYENDFFHSALNIPEDLFKY
ISTLFYKDIIKRCPEININKINSHSVNEIISSFSKISKHERLFRFVFETIKENGILNSLE
ENDDAYFEFNEVIIKSSRIISKLLFPLESDNDNEDLPQSLFQNGLMDKIYKCRYLRKKNQ
MISHVIKHSIKEIINNNIIIRILEFGGGTASLSVEVIEEIIALLQENPNYQVEIEYTWSD
ISPAFIADAKNKINKIINDAAITNGFNVIYRPLKIDESLIETQSINPSYYDFVIMSNVLH
VVKNIKQAVEQMYQLLTPNGQLLFLEPPYKSVLNDSIVGSFEQWWSFTDTDIRKDRCSMS
QQSWCQLLKTCNFKDIAMSKECIFVGIVIHAQKPPISLLNSQPKRDNIIIYGGGNPIFVE
NIKLYSNSKSLIQIETIQEFNQLLSQSTITNDSIIYFIKTLETLSLDNFKQITLEYIEIN
RKLLQINSLCKHVLIVSDSRKTNYLASSVVGAARYFDEFQQLKLNTLDFDYDSTQNYINS
NNKDMVQFINILTDSKTNVHKEMIIINNKVYYEIVQKEKNLKLKYNSESFENQNNLMCSL
SPNLEYQLQSKQIKLRDNQVEVKTIATGINYKDYLNFSGSNSNGDDNTGLPQFGYEFSGI
ITRVGNNVKDYKVGDNVFGLSNSCTSSHIVTNYKKIQIKPSNLSHNEASSIPIDYLTSFM
SLFNIGSLNIEDNESILIHLGSDGFGLSTFEILKWKGFNSNLFVTVNSYETKRYLQDNYG
DFITGIYSNTDKSYVTEINKKLIKLGSKKKGVDLILNTLPSDFMDSNFKLLAKYGRIIDL
TSNHLNQSEFLKNINFKYNHGYHNFELSLIQKNKIHKCLYEISNAFENGELKTIPIKEFT
NLNIKDAIKYITNNKIEKITVSHDHEIYSDIIYRSLDEKEFSILKSNYQINSNNLGKNIL
VTGQSGIILEILKWIIKYSNINTIENVIILSRSSLKWELELLINETKLSNNNIKFHFKSV
DIGDSEQVDNAINEILNENQQITNIDSIYHFAFQQITCKVQEINMKHLDISHGAKSMGAI
NLHNQSIKRNWKLINFVMASSAISLIGSTDLCTYVCANALLDSFSKYRESLGLPSTCICL
GAIESTGFVSKNESVSVFLDGGGFHPTPINQVLGLLDLQIQNAGKFTNSMLSNFKPSKFK
NNQQTSLFLKFDYLMNLKNNSEETKIENTGNKNIDELFIEKVSELFSMDESKINKNLRLI
DYGADSLIIVQLKNWIDKEIGINLITIQQLQNNTISTSMKMILNSLMKNNQNIDDNNKDL
PSNRIDYWKNEMKFEESIKPISNEIQSRNNSEKIILLTGTTGFLGGFLLFNMVRLDSCKL
IYCLIRNKSKSNNPLDEIINNLKYHQLYEKLNQSQISKIIPIIGDLSMNKLGLSNDDYET
ISKNVNLIINPGADINQKSSYQDCKLVNVNGVKEIIKLSLSSLKQRIPIVNFSSFSVFFN
QSLDKNFDESVLPSIDNIDNLPTEYMKSKVVGEYILLEASKKYNIPSILIRPPSIFLNPE
TGIGHISDFSLLSIQSCYELGYYPNQFENDFILINTITWLSNNITNIIMNDNCWTDSKMN
IYNVHGKQIQSSLIIKPLEKHFNCKHINTNDWIDMVNNSNKKSCIKLKSFHSLDIILKSE
NNRYKPNENQSISLSTKSLLESMGSYNTDLEITDKMIISHINQIFNLNETI
NT seq
8796 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaatttaaaaaatataaatttaaaagagaaaggagttgcaattgttggtattgga
tttagaattccttctggtaataatgaaaattcaattagttcaccagatgatttatttaat
aatttaaagaatggttttgatggtgttagtagtacatcagaaagatggagtgacaatttt
cataaattaggtgaaattagtagtccaaatgcaggtttattaccatttaaagaatggaaa
tcattcgacccattattttttggtattaatccatctgaagctccattaatcgatcctcaa
caaagattattattaaaatgtacatgggaagcattagaagatgcatctattgatccaatt
tcaattcgtggtacaaatacttcagttttcattggttcttcaactattgattatttacat
acaaataaacatcaagactcagttttaaagaatgcaatagcacaatcaaccagtgcgatt
tcaaatagaatttcatactgtttcgattttaatggtccatcactatcaattgatactgca
tgttcatcatcattaaatgcagtttctcaaggttatcattcaatattaaatggtacttcc
aatatgtcaattgttggtggtgtaaatttaatattagatgttgatattataaaagcatat
tcgattttaagcatgttaagtaaaacacatggtaaatgtaaaacatttgatgaaagtggc
gatggttttacacgtggtgaatgtgtcggtgttgtagttttaaagaatttacaagatgca
gtaaaagatggtaatagaatttattgtgtaattaatggttcaagttcaaatgttgatggt
aatggtaatatggataaagttaacttttattcaccatcaaaacaatcacaatttaataat
attaattcagcatttaagtcaacaaatgacaaactctcgattaatgatattcaatatatc
gaagcacatggtaccggtactaaaacaggcgatccaattgaaactgaagcaatttcaatg
gcttttaaaaatagagataaatcaacaccaattctaattggttcaattaaaagtaatatt
ggtcattgtgaagctggttcaggtgttgcatcattaatcaaatgttgtttaatgtttaaa
tatcaatgctttttaccaaatattcatttcaaaaatccaaatccattaattaaattcaat
gaatggaatttaaaagttgtaacctcaccaattccattcaacaaaagaaataatgaaaaa
ccagtttcaatgatgattaataactttggtgtaacaggttcaaattgttgtttacttatt
tcagaatttaaaaataacaataactttaaagagaatattaatttagaatctcaaagtgtt
aatgatagagtgttaataccattctcagcaaattcatcaaattcattaaatcaataccaa
tcaaaatttaaaaatataattaataatcaattcaattttattgattttaccgcaaatcaa
atttattcaaaatcaaattttctttatcaaagatcagttgtaattgcaagtaattcaaat
gaactttttgaaaatatctcaaataaaaaacaaattcaaactaaaaattcaatcatctca
aatatgtcattcaaaggaaagaacccaattacaatttttgttttttcaggtcaaggatca
caatatcctaaaatggctttagaattatataataatgaagtaatctttaaaaagtcaatt
gatttaatcgattcaaaattatcaaagtactatggtttttcagtatgggagaaggtaaaa
acaatcaaagatgatgacttaacctcaatacatgatccaatttttgcccaaccagcacta
tgtatgatttcagtatcactatttgaattatattaccattggggagtaaatccatcattt
attcttggtcatagtcttggtgaaatttcagcatcatattgttctggaatgattgattta
gatacattctgttatacagtttatcaaagatcaatagcacaatctaaaacaaatggttgt
ggtagaatgttatcaattaatatcagtgatgaagaatttaaatcaatgtattctcaaaag
tatccacaaattgaaatcgcatgttataattcacctcaatcaattgttgtggcaggtaat
gaatcaatattaaatgaaatttcaaaagaattaaaagaaaaagaaattttcaccacaatg
ttaggttcattatcatcattccatacaagtagccaacaatgtacaaaagatagtatatta
caactaaacattgaaagtaatcaaccaaaagtaccaatattttcaacagttacaacaaat
ttatttaatgaatcaaatcgatttaattcacaatatgtttatgataatattatcaaacca
gttaaattcacacaaacaatttcaaatatttataaacatatcgaatcaaatcaattaaat
aatgaaattgtattcattgaaattgcaccacatccaacattattattttatattaaacaa
atggtaccatcaagtttaaatgaatcagtttcagtttattcagcacttcataagaaaaag
aatgatgtcgaagagtttcaacaaaccatttcaaatttatattgtcaaaatggatataat
attaattttaaatgtcaatttaataataaaaaatcaaatcaatcaataaatttaccactt
taccaatgggatgaagaattatatttcactcaagcccaaactctcgaacaacatagaaaa
gaaggaccaccaattgaccatcttggtacatcaaactcttataattcaccatttaataat
tcatatagaacatcaatcgatataaagaataaaccatttctatatcttaaaggccatatg
gttaaaggtaaatactacttcccaggttgtggttatattgataatattattcaactttat
aaaaatcaagatatttttattagttttattgaatttaaaacaccattaattttaattgaa
ggtatcaatcaatatttacaaacaaacattcaacaaactggtaaaagtgaatatcgtgca
caatttcatttcaaagatcaaaaatcaaatgaatggattcaatcatcaaatgcaaatttc
caattattagatcatggtaatgatataccaccaaagtataatattaaagaaattattgaa
aacaaatgtaatttaagcaaattaacaaagaatgaactttatacacatataaaatcaaaa
actggtttaaattatactggagtttttcaaggtgttactgaatgttatataggtggtgat
tgtacattatcagttgtatctttagaatctcaaacaaactcatttttaaatataccaata
ttagatacttgtttacatggaatgataggattgtcaaatgatcaatgtcaaattgtattt
gataaagctattggatttaaatattattcatcaaacataccagcaaatttaaaagattat
aaagatagtgtttatgtttattcccatttaaaatcaaaaagtgttgattcattctttgga
tctataatagtaatgttatcagatggttcagttttatatgaaattgaagaagttgtttgt
aaatcattaattccaatcaaagattcacttaaaattgagtatcctaatgatgaattatac
aaagttcatttacaatcaaaagattctccaattccaacaccatcatcattcaaatcaatt
atttatgaaaatgatttcttccattctgcacttaatattccagaagatttattcaaatat
atttcaacattattttataaagatattataaaaagatgtccagaaattaatatcaataaa
attaattctcatagtgttaatgaaattatttcaagtttcagtaaaatttcaaaacacgaa
agattatttagatttgtatttgaaacaataaaagagaatggtattcttaatagtttggaa
gaaaatgatgatgcttatttcgaatttaatgaagtaattatcaaatcgtcaagaattatt
tcaaaattattattcccactagaaagtgataatgataatgaagatttacctcaatcatta
tttcaaaatggtttaatggataaaatttataaatgcagatatttaagaaagaagaatcaa
atgatttcacatgttattaaacattcaattaaagagattattaataataatattataatt
agaattttagaatttggaggaggtactgcatcattatcagttgaagttattgaagaaata
attgcattacttcaagagaatccaaattatcaagttgaaatcgaatatacatggagtgat
atttcacctgcattcatagcagatgcaaagaataaaatcaataaaatcattaatgatgct
gctataacaaatggatttaatgttatttatcgtccattaaaaattgatgaatcattgata
gaaactcaatcaattaatccatcatattatgatttcgttataatgtcaaatgttcttcat
gttgttaaaaatattaaacaagctgtagaacaaatgtatcaattgttgactccaaatggt
caattactatttttagagccaccttataaatcagttctaaatgattcaatagttggttca
tttgaacaatggtggtcattcactgatactgatattagaaaagatagatgtagtatgtct
caacaaagttggtgtcaattattaaagacatgtaattttaaagacattgcaatgtctaaa
gaatgcatctttgttggtattgtaatacatgcacaaaaaccaccaatttctttattgaat
tctcaaccaaaacgtgataatataattatatatggtggtggtaatccaatttttgtagaa
aacatcaaattatattcaaattcaaaaagtttaattcaaattgaaactattcaagaattt
aatcaattattaagtcaatcaacaataacaaacgattcaatcatttatttcataaaaaca
ttagaaacattatcattggataattttaaacaaataactcttgaatatattgaaatcaat
cgaaaattattacaaatcaatagtttatgtaaacatgtattaattgttagtgattcaaga
aaaactaactatttagcatcatcagttgttggtgcagcaagatactttgatgaattccaa
caattgaaactaaatactttagattttgattatgattcaactcaaaattatataaattca
aataataaagatatggttcaattcattaatatcttgacagattccaaaacaaatgttcat
aaagaaatgattataattaataataaagtatattatgaaatagttcaaaaagagaaaaat
ctaaaattaaaatacaattcagaatcttttgaaaatcaaaataatttaatgtgttcatta
tcaccaaatttagaatatcaattacaatcaaaacaaattaaattaagagataatcaagtt
gaagttaaaacaattgcaactggtatcaattataaagattatttaaattttagtggttca
aatagcaacggtgatgacaatacaggtttaccacaatttggatatgaattttcaggtatt
ataacaagagttggtaataatgtaaaagattataaagttggtgataatgtatttggttta
tcaaattcttgtacatcatctcacattgttacaaattataaaaaaattcaaataaaacct
tcaaacctaagtcataacgaagcatcatcaattccaattgattatttaacatcatttatg
agtttatttaatattggtagtttaaatattgaagataatgaatcaattttaattcattta
ggtagtgatggttttggattatcaacatttgaaatattaaaatggaaaggttttaattca
aatttattcgttacagtaaattcatatgaaactaaacgatatcttcaagataattacggt
gattttattactggaatttattcaaacacagataaaagttatgttacagaaataaataaa
aaattaattaaattaggttcaaaaaagaaaggagtagatttaatattaaatacattacca
agtgattttatggattcaaatttcaagctattagcaaagtatggtagaataattgattta
acgtcaaatcatttaaatcaaagtgaatttttaaaaaatatcaattttaaatataatcat
ggttaccataactttgagttatcattaattcaaaaaaataaaattcacaaatgtttatat
gaaatttcaaatgcttttgaaaatggagaattaaaaaccattccaattaaagaatttaca
aatttaaatattaaagatgccatcaaatacattaccaacaataaaattgaaaaaattaca
gttagtcatgatcatgaaatttatagtgatattatttatagatctttagatgaaaaagag
ttttcaatattaaaatcaaattatcaaattaattcaaataatttaggtaaaaacatatta
gtcacaggtcaatcaggtattattttagaaatattaaaatggatcattaaatattcaaat
attaatacaattgaaaatgttattattctttcaagatcatcattaaaatgggaattagaa
ttattaattaacgaaactaaactatcaaataataatattaaatttcatttcaagagtgtt
gatatcggtgatagtgaacaagttgataatgcaatcaatgaaatattaaatgaaaaccaa
caaattacaaatattgattcaatataccattttgcatttcaacaaattacatgtaaagtt
caagaaatcaatatgaaacatttagatatttcacatggagcaaaatcaatgggagcaatt
aatttacataatcaatcaattaaacgtaattggaaattaattaattttgttatggcttca
tctgcaatttcattaataggttcaactgatttatgtacatatgtttgtgcaaatgcatta
ttagattcattttcaaaatacagagaatcacttggattaccatcaacttgcatttgcctt
ggtgcaattgaatcaactggtttcgtttcaaagaatgaatcagtttcagtatttttagac
ggtggtggtttccatccaacaccaatcaatcaagttttaggccttttagatttacaaatt
caaaatgctggtaaattcacaaattcaatgctttcaaatttcaaaccctcaaaatttaaa
aataatcaacaaacatcattatttttaaaatttgattacttgatgaatttaaaaaacaat
agcgaagaaaccaaaatagagaatactggaaataagaacattgatgaattattcattgag
aaagtttcagaattattttcaatggatgaatcaaagataaataaaaatcttagattaatc
gattatggtgcagattcactaataatagttcaattaaaaaattggatagataaagaaatt
ggtataaatttaataacaattcaacaacttcaaaacaatacaattagcacttcaatgaaa
atgatattaaattcattaatgaaaaataatcaaaatatagatgacaataataaagaccta
ccttcaaatagaatcgattattggaagaatgaaatgaaatttgaagagtctattaaacca
atatcaaatgaaatacaatcaaggaataattcagaaaaaattattttattaaccggtaca
actggttttttaggtggtttcttattattcaatatggtaagattagattcatgtaaatta
atttattgtttaattagaaataaaagtaaatcaaataatccattagatgaaattataaat
aatttaaaatatcatcaactttatgaaaaattaaatcaatcacaaatttcaaagattata
ccaattattggtgatttatcaatgaataaacttggtctttcaaatgatgattatgaaaca
atttcaaaaaatgtaaatttaataatcaatccaggtgcagatattaatcaaaaatcaagt
taccaagattgtaaattagtaaatgtaaatggagtaaaagaaattattaaattatcatta
tcatcattaaaacaaaggataccaattgtaaacttttcatcattttcagtatttttcaat
caatcacttgataagaattttgatgaatcagttttaccatcaattgataatattgataat
ttaccaacagaatatatgaagagtaaagttgttggtgaatatattttattggaagcttct
aaaaaatataatataccatcaattttaattagaccaccaagtatatttttaaatccagaa
acaggtattggtcatattagtgacttctctttattatcaatccaatcatgttatgaatta
ggttattatccaaatcaatttgaaaatgattttattttaattaatacaattacatggtta
tcaaataatattacaaatattataatgaatgataattgttggacagattcaaaaatgaat
atttataatgtacatggtaaacaaattcaatcaagtttaataattaaaccacttgaaaaa
catttcaattgtaaacatatcaatactaatgattggattgatatggtaaataattcaaat
aaaaaatcatgtattaaattaaaatcattccattctttggatataattttaaaaagtgaa
aacaatagatataaacccaatgaaaatcaaagcatatcattatcaaccaaatcattacta
gaatcaatgggctcatacaacactgatcttgaaatcactgataaaatgattatttctcat
attaatcaaatttttaatttaaatgaaacaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
